2022 Fiscal Year Annual Research Report
Reformation of evolutionary genomics in land plant evolution: from sequence comparison to functional comparison.
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19K22448
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| Research Institution | Kanazawa University |
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Principal Investigator |
西山 智明 金沢大学, 疾患モデル総合研究センター, 助教 (50390688)
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| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
関本 弘之 日本女子大学, 理学部, 教授 (20281652)
土金 勇樹 東京大学, 大学院理学系研究科(理学部), 特任研究員 (20434152)
坂山 英俊 神戸大学, 理学研究科, 准教授 (60391108)
榊原 恵子 立教大学, 理学部, 准教授 (90590000)
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| Project Period (FY) |
2019-06-28 – 2023-03-31
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| Keywords | クロロキブス / シャジクモ / コレオケーテ |
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| Outline of Annual Research Achievements |
クロロキブスChlorokybus riethii NIES-160について、無菌化に成功し、国立環境研究所微生物系統保存施設に提供し頒布されるようにした。このNIES-160株について、ゲノム配列にRNA-seqデータをマッピングし遺伝子予測を行い、推定遺伝子領域・プロモーター領域がわかるようになった。これによりプロモーターを単離しコドン使用頻度に合わせた配列設計が可能となった。
シャジクモの形質転換実験についてパーティクルガンによる遺伝子導入について再現性をとった。また、エレクトロポーレーション法を検討した。葉状体をキュベットにいれて電気パルスを与えて再生する実験を行い、結果としては選択なしでもかなり死ぬが無パルスなら死なないのでパルス条件次第では可能性がまだあると判断した。また、ハイグロマイシンで非形質転換体を殺せることを確認した。セロハン上培養で仮根の割合が高い培養ができることがわかった。このことは仮根への形質転換への希望を抱かせる。ただし、仮根から葉状体を形成する条件についてさらに明らかにする必要があるだろう。
コレオケーテColeochaete scutata UTEX LB2567株、CCAC 0493株、NIES-4262株について遊走子を作らせることができることを確認し、コレオケーテColeochaete scutata NIES-4262株について新たに無菌化した。形質転換の基盤となると期待される。CCAC 0493株についてトマトを標準にフローサイトメトリーにより核DNA量を測定し、ゲノムサイズは3.05 ± 0.02 Gbと推定された。
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