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2020 Fiscal Year Annual Research Report

細胞外小胞のRNAメチル化計測によるがんバイオマーカーの最高性能化と実用化

Research Project

Project/Area Number 19K22658
Research InstitutionOsaka University

Principal Investigator

石井 秀始  大阪大学, 医学系研究科, 特任教授(常勤) (10280736)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 土岐 祐一郎  大阪大学, 医学系研究科, 教授 (20291445)
江口 英利  大阪大学, 医学系研究科, 教授 (90542118)
今野 雅允  大阪大学, 医学系研究科, 寄附講座講師 (80618207)
浅井 歩  大阪大学, 産業科学研究所, 特任助教(常勤) (40783262)
Project Period (FY) 2019-06-28 – 2021-03-31
KeywordsRNAメチル化 / エピトランスクリプトーム / シークエンス
Outline of Annual Research Achievements

マイクロRNAのM6Aを正確に計測するために、TS法とMS法による計測法を開発し、その精度を最大化するために開発研究を行ってきた。その結果、血液中に含まれるエクソゾーム(EV)の外側の形状とその中身のシークエンスを高い精度で行う事に成功した。第1に、EVの選別から外側の形状のみで高い精度で由来する臓器を診断する技術を確立した。第2にEVの中身から核酸の修飾を含めた全プロファイリングを実施し、未診断疾患における新たな診断ツールとして性能を確立した。
得られた技術は大阪大学の知的財産として特許化を進めている。最終年度は、これまでの解析で得られたEVの内外の情報を統合して臨床材料を用いたバイオマーカーの性能の最適化を実施した。新しいシーズに関しては知的財産を整備し、将来のベンチャー化に向けたわが国発の基盤技術として整備した。
特に、RNAメチル化に関して、大阪大学発の新しい技術を用いて高い精度で計測を行い、得られた結果のデータを標準的な他の次世代シークエンス技術と比較して、両者が相補的でありかつ大阪大学のTS法とMS法が一分子一塩基レベルでの情報の取得と疾患のプロファイリングにおいて優れていることが明らかとなった。このプロファイリングの結果を参照して、新たな医薬品であるエピトランスクリプトームを標的とした創薬に向けて基盤を構築することができた。
得られた成果はコンパニオン診断技術として応用することが可能である。最近海外の研究グループから報告されたエピトランスクリプトームの阻害化合物であるSTMシリーズを例とするような医薬品に対してもその診断性能が発揮できることが明らかとなった。

  • Research Products

    (14 results)

All 2020

All Journal Article (9 results) (of which Int'l Joint Research: 5 results,  Peer Reviewed: 9 results,  Open Access: 9 results) Presentation (2 results) Patent(Industrial Property Rights) (3 results) (of which Overseas: 3 results)

  • [Journal Article] Theoretical analyses and experimental validation of the effects caused by the fluorinated substituent modification of DNA2020

    • Author(s)
      Koseki Jun、Konno Masamitsu、Asai Ayumu、Horie Naohiro、Tsunekuni Kenta、Kawamoto Koichi、Obika Satoshi、Doki Yuichiro、Mori Masaki、Ishii Hideshi
    • Journal Title

      Scientific Reports

      Volume: 10 Pages: 1138

    • DOI

      10.1038/s41598-020-57899-7

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] One-carbon metabolism for cancer diagnostic and therapeutic approaches2020

    • Author(s)
      Asai Ayumu、Konno Masamitsu、Koseki Jun、Taniguchi Masateru、Vecchione Andrea、Ishii Hideshi
    • Journal Title

      Cancer Letters

      Volume: 470 Pages: 141~148

    • DOI

      10.1016/j.canlet.2019.11.023

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Convolutional Neural Network Can Recognize Drug Resistance of Single Cancer Cells2020

    • Author(s)
      Yanagisawa Kiminori、Toratani Masayasu、Asai Ayumu、Konno Masamitsu、Niioka Hirohiko、Mizushima Tsunekazu、Satoh Taroh、Miyake Jun、Ogawa Kazuhiko、Vecchione Andrea、Doki Yuichiro、Eguchi Hidetoshi、Ishii Hideshi
    • Journal Title

      International Journal of Molecular Sciences

      Volume: 21 Pages: 3166~3166

    • DOI

      10.3390/ijms21093166

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] State-of-the-Art Technology of Model Organisms for Current Human Medicine2020

    • Author(s)
      Konno Masamitsu、Asai Ayumu、Kitagawa Toru、Yabumoto Masami、Ofusa Ken、Arai Takahiro、Hirotsu Takaaki、Doki Yuichiro、Eguchi Hidetoshi、Ishii Hideshi
    • Journal Title

      Diagnostics

      Volume: 10 Pages: 392~392

    • DOI

      10.3390/diagnostics10060392

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Immuno-Surgical Management of Pancreatic Cancer with Analysis of Cancer Exosomes2020

    • Author(s)
      Takeda Yu、Kobayashi Shogo、Kitakaze Masatoshi、Yamada Daisaku、Akita Hirofumi、Asai Ayumu、Konno Masamitsu、Arai Takahiro、Kitagawa Toru、Ofusa Ken、Yabumoto Masami、Hirotsu Takaaki、Vecchione Andrea、Taniguchi Masateru、Doki Yuichiro、Eguchi Hidetoshi、Ishii Hideshi
    • Journal Title

      Cells

      Volume: 9 Pages: 1645~1645

    • DOI

      10.3390/cells9071645

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Genome-wide association meta-analysis identifies GP2 gene risk variants for pancreatic cancer2020

    • Author(s)
      Lin Yingsong、et al
    • Journal Title

      Nature Communications

      Volume: 11 Pages: 3175

    • DOI

      10.1038/s41467-020-16711-w

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] A Four-Dimensional Organoid System to Visualize Cancer Cell Vascular Invasion2020

    • Author(s)
      Yanagisawa Kiminori、Konno Masamitsu、Liu Hao、Irie Shinji、Mizushima Tsunekazu、Mori Masaki、Doki Yuichiro、Eguchi Hidetoshi、Matsusaki Michiya、Ishii Hideshi
    • Journal Title

      Biology

      Volume: 9 Pages: 361~361

    • DOI

      10.3390/biology9110361

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] COVID-19 Drug Discovery Using Intensive Approaches2020

    • Author(s)
      Asai Ayumu、Konno Masamitsu、Ozaki Miyuki、Otsuka Chihiro、Vecchione Andrea、Arai Takahiro、Kitagawa Toru、Ofusa Ken、Yabumoto Masami、Hirotsu Takaaki、Taniguchi Masateru、Eguchi Hidetoshi、Doki Yuichiro、Ishii Hideshi
    • Journal Title

      International Journal of Molecular Sciences

      Volume: 21 Pages: 2839~2839

    • DOI

      10.3390/ijms21082839

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Hereditary pancreatitis model by blastocyst complementation in mouse2020

    • Author(s)
      Asai Ayumu、Konno Masamitsu、Kawamoto Koichi、Isotani Ayako、Mori Masaki、Eguchi Hidetoshi、Doki Yuichiro、Arai Takahiro、Ishii Hideshi
    • Journal Title

      Oncotarget

      Volume: 11 Pages: 2061~2073

    • DOI

      10.18632/oncotarget.27595

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Presentation] miRNAメチル化2020

    • Author(s)
      石井秀始
    • Organizer
      第79回日本癌学会学術総会
  • [Presentation] RNA Expression and Methylation in Liquid Biopsy2020

    • Author(s)
      石井秀始
    • Organizer
      第79回日本癌学会学術総会
  • [Patent(Industrial Property Rights)] トンネル電流を使用したマイクロRNA解析2020

    • Inventor(s)
      谷口正輝、石井秀始、大城敬人、今野雅允
    • Industrial Property Rights Holder
      谷口正輝、石井秀始、大城敬人、今野雅允
    • Industrial Property Rights Type
      特許
    • Industrial Property Number
      PCT/JP2020/ 017654
    • Overseas
  • [Patent(Industrial Property Rights)] miR302核酸改変体2020

    • Inventor(s)
      石井秀始、今野雅允、小比賀聡、森正樹
    • Industrial Property Rights Holder
      石井秀始、今野雅允、小比賀聡、森正樹
    • Industrial Property Rights Type
      特許
    • Industrial Property Number
      PCT/JP2020/ 017659
    • Overseas
  • [Patent(Industrial Property Rights)] エピジェネティックスを標的とした新規医薬2020

    • Inventor(s)
      石井秀始、他7名
    • Industrial Property Rights Holder
      石井秀始、他7名
    • Industrial Property Rights Type
      特許
    • Industrial Property Number
      PCT/JP2020/017607
    • Overseas

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Published: 2021-12-27  

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