• Search Research Projects
  • Search Researchers
  • How to Use
  1. Back to project page

2020 Fiscal Year Annual Research Report

次世代「緑の革命」植物の創生に資するDELLAと転写因子の複合体構造基盤解析

Research Project

Project/Area Number 19K23658
Research InstitutionUniversity of Tsukuba

Principal Investigator

野崎 翔平  筑波大学, 生命環境系, 助教 (20850910)

Project Period (FY) 2019-08-30 – 2021-03-31
Keywords緑の革命 / 転写制御因子 / ジベレリン / DELLAタンパク質 / ブラシノステロイド / BZR転写因子 / X線結晶構造解析 / 植物によるタンパク質発現系
Outline of Annual Research Achievements

本課題では、従来の欠点を克服した「緑の革命」植物の創生を見据え、DELLAが多様なクラスの転写因子を認識する機構に着目し、その複合体構造基盤解析を推し進めることでDELLAが多様な生命現象を制御できる原理的な知見を得ることを目的としている。
昨年度に引き続き、DELLA-転写因子複合体の結晶化を試みたが、DELLAの収量が低さが結晶化スクリーニングのボトルネックとなっていた。そこで本年度は、DELLAのコンストラクトおよび精製法を改善することで、収量を大きく増加させることに成功した。また、この試みの中で、シロイヌナズナ由来DELLAには二量体型と単量体型が非平衡状態で存在することを見出した。さらに、二量体型のDELLAのみが標的転写因子であるBZR1と相互作用することが明らかになった。これらの結果は、DELLAの分子内に二量体形成能を変化させる未知の制御スイッチング機構が備わることを強く示唆している。
また、DELLAが標的とする転写因子の遺伝子制御機構により深く迫るため、植物ホルモン・ブラシノステロイドの鍵転写因子であるBZR1の生化学的解析・構造生物学的解析にも取り組んだ。これまでBZR1は6塩基のDNAをコア配列として認識すると考えられてきたが、生化学的解析により周辺2塩基ずつを含んだ計10塩基を特異的に認識することが明らかとなった。Plant Cistrome Databaseから抽出したIn vitroゲノムワイド解析、および共同研究チーム独自のマイクロアレイの結果と照らし合わせてみたところ、この周辺配列2塩基の認識がBZR1を介した転写抑制制御に大きく寄与することが示唆された。さらに、X線結晶構造解析により、BZR1はDNAの歪みやすさを認識することで、周辺2塩基への特異性を生み出すことが明らかになった。
本研究で得られた結果は、植物の成長肥大制御を詳細に理解する上で極めて重要な知見であり、植物の生長を自在に制御できる基盤技術の創出につながる可能性がある。

  • Research Products

    (17 results)

All 2021 2020

All Journal Article (8 results) (of which Peer Reviewed: 7 results,  Open Access: 4 results) Presentation (9 results) (of which Invited: 1 results)

  • [Journal Article] Gene co-expression network analysis identifies BEH3 as a stabilizer of secondary vascular development of Arabidopsis2021

    • Author(s)
      Tomoyuki Furuya、Masato Saito、Haruka Uchimura、Akiko Satake, Shohei Nosaki, Takuya Miyakawa, Shunji Shimadzu, Wataru Yamori, Masaru Tanokura, Hiroo Fukuda, *Yuki Kondo
    • Journal Title

      The Plant Cell

      Volume: in press Pages: -

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Evaluation of spice and herb as phyto-derived selective modulators of human retinaldehyde dehydrogenases using a simple in vitro method2021

    • Author(s)
      Thi Bao Chau Bui、Shohei Nosaki、Mito Kokawa、Yuqun Xu、Yutaka Kitamura、Masaru Tanokura、Satoshi Hachimura、Takuya Miyakawa
    • Journal Title

      Bioscience Reports

      Volume: online published Pages: -

    • DOI

      10.1042/BSR20210491

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Different DNA-binding specificities of NLP and NIN transcription factors underlie nitrate-induced control of root nodulation2021

    • Author(s)
      Nishida Hanna、Nosaki Shohei、Suzuki Takamasa、Ito Momoyo、Miyakawa Takuya、Nomoto Mika、Tada Yasuomi、Miura Kenji、Tanokura Masaru、Kawaguchi Masayoshi、Suzaki Takuya
    • Journal Title

      The Plant Cell

      Volume: online published Pages: -

    • DOI

      10.1093/plcell/koab103

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Prevention of necrosis caused by transient expression in Nicotiana benthamiana by application of ascorbic acid2021

    • Author(s)
      Nosaki Shohei、Kaneko Mika K、Tsuruta Fuminori、Yoshida Hideki、Kato Yukinari、Miura Kenji
    • Journal Title

      Plant Physiology

      Volume: online published Pages: -

    • DOI

      10.1093/plphys/kiab102

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Highlighting the potential utility of MBP crystallization chaperone for Arabidopsis BIL1/BZR1 transcription factor-DNA complex2021

    • Author(s)
      Nosaki Shohei、Terada Tohru、Nakamura Akira、Hirabayashi Kei、Xu Yuqun、Bui Thi Bao Chau、Nakano Takeshi、Tanokura Masaru、Miyakawa Takuya
    • Journal Title

      Scientific Reports

      Volume: 11 Pages: -

    • DOI

      10.1038/s41598-021-83532-2

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] VISUAL network analysis reveals the role of BEH3 as a stabilizer in the secondary vascular development in Arabidopsis2021

    • Author(s)
      Furuya Tomoyuki、Saito Masato、Uchimura Haruka、Satake Akiko、Nosaki Shohei、Miyakawa Takuya、Shimadzu Shunji、Yamori Wataru、Tanokura Masaru、Fukuda Hiroo、Kondo Yuki
    • Journal Title

      bioRxib

      Volume: - Pages: -

    • DOI

      10.1101/2021.01.19.427273

    • Open Access
  • [Journal Article] RAP Tag and PMab-2 Antibody: A Tagging System for Detecting and Purifying Proteins in Plant Cells2020

    • Author(s)
      Miura Kenji、Yoshida Hideki、Nosaki Shohei、Kaneko Mika K.、Kato Yukinari
    • Journal Title

      Frontiers in Plant Science

      Volume: 11 Pages: -

    • DOI

      10.3389/fpls.2020.510444

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] NIGT1 family proteins exhibit dual mode DNA recognition to regulate nutrient response-associated genes in Arabidopsis2020

    • Author(s)
      Ueda Yoshiaki、Nosaki Shohei、Sakuraba Yasuhito、Miyakawa Takuya、Kiba Takatoshi、Tanokura Masaru、Yanagisawa Shuichi
    • Journal Title

      PLOS Genetics

      Volume: 16 Pages: 1009197-1009197

    • DOI

      10.1371/journal.pgen.1009197

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] 統合的アプローチによるブラシノステロイド応答遺伝子制御の実態解明2021

    • Author(s)
      野崎 翔平、光田 展隆、坂本 真吾、山上 あゆみ、寺田 透、徐 玉群、Bui Thi Bao Chau、三浦 謙治、中野 雄司、田之倉 優、宮川 拓也
    • Organizer
      日本植物学会第85回大会
  • [Presentation] RAPタグとタグ抗体PMab-2 抗体:植物細胞における検出、精製のためのタグシステム2020

    • Author(s)
      三浦 謙治、野﨑 翔平、金子 美華、加藤 幸成
    • Organizer
      第62回日本植物生理学会年会
  • [Presentation] 生体高分子の X 線結晶構造解析に向けたコンストラクトデザイン戦略2020

    • Author(s)
      野崎 翔平
    • Organizer
      第55回形質転換植物デザイン研究拠点セミナー・T-PIRCセミナー
    • Invited
  • [Presentation] シロイヌナズナのNIGT1転写因子間の相互作用が標的配列の認識と栄養応答に及ぼす影響2020

    • Author(s)
      植田 佳明、野崎 翔平、宮川 拓也、木羽 隆敏、田之倉 優、柳澤 修一
    • Organizer
      日本土壌肥料学会 2020年度岡山大会プログラム
  • [Presentation] BES/BZR転写因子の競争的関係性は維管束幹細胞制御の堅牢性に貢献する2020

    • Author(s)
      古谷 朋之、齊藤 真人、内村 悠、佐竹 暁子、野﨑 翔平、宮川 拓也、島津 舜治、矢守 航、田之倉 優、福田裕穂、近藤 侑貴
    • Organizer
      日本植物学会第84回大会
  • [Presentation] 硝酸に応答して根粒共生を抑制するNLPを介した転写制御機構の解析2020

    • Author(s)
      西田 帆那、野崎翔平、鈴木 孝征、伊藤 百代、宮川 拓也、西嶋 遼、田之倉 優、川口 正代司、川勝 泰二、寿崎 拓哉
    • Organizer
      日本植物学会第84回大会
  • [Presentation] ブラシノステロイド情報伝達における鍵転写因子のDNA結合特異性の究明2020

    • Author(s)
      野崎 翔平、宮川 拓也、光田 展隆、寺田 透、山上 あゆみ、徐 玉群、Bui Thi Bao Chau、中野 雄司、田之倉 優
    • Organizer
      日本植物学会第84回大会
  • [Presentation] ブラシノステロイドのマスター転写因子BIL1/BZR1のプロモーター選択特異性の解明2020

    • Author(s)
      野崎 翔平、宮川 拓也、光田 展隆、寺田 透、山上 あゆみ、中野 雄司、田之倉 優
    • Organizer
      日本農芸化学会2020年度大会(要旨のみ)
  • [Presentation] Study on food ingredients that regulate the activity of Retinaldehyde dehydrogenase isozymes (RALDHs)2020

    • Author(s)
      Bui Chau Thi Bao、野崎 翔平、徐 玉群、田之倉 優、宮川 拓也、八村 敏志
    • Organizer
      日本農芸化学会2020年度大会(要旨のみ)

URL: 

Published: 2021-12-27  

Information User Guide FAQ News Terms of Use Attribution of KAKENHI

Powered by NII kakenhi