Elucidation of the mechanism of forming transcriptionally active chromatin structures by non-coding RNA

2023 Fiscal Year Final Research Report

• Project/Area Number: 19K23736
• Research Category: Grant-in-Aid for Research Activity Start-up
• Allocation Type: Multi-year Fund
• Review Section: 0701:Biology at molecular to cellular levels, and related fields
• Research Institution: Kumamoto University (2023); Japanese Foundation for Cancer Research (2019)
• Principal Investigator: Yamamoto Tatsuro 熊本大学, 病院, 医員 (90844770)
• Project Period (FY): 2023-02-26 – 2024-03-31
• Keywords: エピジェネティクス / クロマチン構造 / 非コードRNA / 乳がん

Outline of Final Research Achievements

The previous study reported that Eleanor non-coding RNAs are overexpressed in recurrent breast cancer cells, but the function is not elucidated. In this study, we aimed to elucidate the mechanism of the role of non-coding RNAs with chromatin structures. Therefore, we investigated the 3D chromatin structure changes caused by non-coding RNAs using a method for analyzing 3D chromatin interactions in the cell nucleus of the genome. As a result, Eleanor RNA transcripts change chromatin structure formation in 3D, and contribute to making a spot for transcriptional activation.

Free Research Field

分子生物学

Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements

クロマチン構造に関する研究は近年注目を浴びており、この構造が破綻すると、遺伝子発現が変化し、がんなどの疾患に関わることが報告されている。しかしながら、非コードRNAによるクロマチン3次元構造の変化は未解明であった。本研究では、発癌や治療耐性を獲得する過程で、非コードRNAによる転写活性なクロマチン高次構造の形成機構を解明した。
本研究の成果は、現在注目を浴びているクロマチン高次構造の形成・維持の解明の一端を担うものに位置し、がんに対する新規の診断法や治療法につながると期待される。