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2019 Fiscal Year Research-status Report

Integrating Computational and Experimental Approaches for New Paradigms in Molecule Synthesis

Research Project

Project/Area Number 19KK0150
Research InstitutionUniversity of Shizuoka

Principal Investigator

渡辺 賢二  静岡県立大学, 薬学部, 教授 (50360938)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 佐藤 道大  静岡県立大学, 薬学部, 講師 (10629695)
恒松 雄太  静岡県立大学, 薬学部, 講師 (30629697)
岸本 真治  静岡県立大学, 薬学部, 助教 (40814330)
Project Period (FY) 2019-10-07 – 2022-03-31
Keywordsspiro-carbon / monooxygenase / FAD / 天然物 / 生合成酵素 / epoxidation
Outline of Annual Research Achievements

【目的】スピロ環は天然物において広く見られる構造であり、生物活性において重要な役割を持つ。近年、スピロ環を含む創薬リード化合物も多く開発され、スピロ環に対する関心は高まりつつある。このことから、酵素反応によりスピロ環を高収率で産生できるようになれば、様々な医薬品の開発につながることが期待される。我々はAspergillus fumigatus 由来のスピロ環化合物であるazaspireneとspirotryprostatin Aに着目し、そのスピロ環形成機構の解明を目指した。
【方法・結果・考察】これまでの研究により、spirotryprostatin A のスピロ環は酵素FqzBが形成することが明らかになっている1)。このFqzBがスピロ環を形成するメカニズムを明らかにすべく、FqzBの結晶化を試みた。まず、fqzBを大腸菌BL21 (DE3) 株に導入し、組み換え遺伝子の発現を行った。フレンチプレスを用いて発現宿主大腸菌を破砕し、破砕液から三段階のクロマトグラフィーでFqzBを高純度に精製した後、結晶化条件のスクリーニングを行った。得られた結晶を用いたX線構造解析より、フラビン結合型のFqzBの結晶構造を解明することに成功した。FqzBの結晶構造を確認すると、フラビンの近傍にスペースを確認でき、ここに基質が入り込むことが予想された。
Azaspirene中のスピロ環形成は酵素PsoGが担う事がpsoGのノックアウト実験から示唆されていたが、基質、メカニズムともに不明であった。そこで、A. fumigatus A1159株のpsoG欠損株から基質となる化合物の探索を行った。psoG欠損株の培養液から野生株で検出されない化合物1を単離し、NMR解析によりその構造を決定した。次に、psoGを導入した酵母からミクロソーム画分を取得し、化合物1を反応させた。すると、azaspireneの生成を確認することができ、PsoGが化合物1を変換してスピロ環を形成していることが明らかになった。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

1: Research has progressed more than it was originally planned.

Reason

リザーバーに終濃度が20% (v/v)になるようにエチレングリコールを加えたものにタンパク質結晶を数秒間浸して、凍結処理を行った後、液体窒素で瞬間冷凍した。凍結したFqzBの結晶をUniPuck (Crystal Positioning Systems)に充填し、液体窒素中に保管した。これに高エネルギー加速器研究機構のビームラインBL17Aを用いて、X線回折実験を行ったところ、分解能2.4A, 空間群P212121, a=55, b=68, c=122°, β=90°で回折データを得ることに成功し、結晶構造を解明できたため。

Strategy for Future Research Activity

現在、基質との共結晶化を行い、スピロ環形成機構の精密機能解明に取り組んでいる。

Causes of Carryover

新型コロナウイルスの影響で学会の中止、さらには米国への渡航制限により旅費支出ができなくなったため。

  • Research Products

    (2 results)

All 2019

All Journal Article (2 results)

  • [Journal Article] Functional and Structural Analyses of trans C-Methyltransferase in Fungal Polyketide Biosynthesis2019

    • Author(s)
      Kishimoto Shinji、Tsunematsu Yuta、Matsushita Takuma、Hara Kodai、Hashimoto Hiroshi、Tang Yi、Watanabe Kenji
    • Journal Title

      Biochemistry

      Volume: 58 Pages: 3933~3937

    • DOI

      10.1021/acs.biochem.9b00702

  • [Journal Article] Genomic Mushroom Hunting Decrypts Coprinoferrin, A Siderophore Secondary Metabolite Vital to Fungal Cell Development2019

    • Author(s)
      Tsunematsu Yuta、Takanishi Jun、Asai Shihori、Masuya Takahiro、Nakazawa Takehito、Watanabe Kenji
    • Journal Title

      Organic Letters

      Volume: 21 Pages: 7582~7586

    • DOI

      10.1021/acs.orglett.9b02861

URL: 

Published: 2021-01-27  

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