• Search Research Projects
  • Search Researchers
  • How to Use
  1. Back to project page

2008 Fiscal Year Annual Research Report

膵島特異的遺伝子の発現調節軸に焦点を絞った糖尿病遺伝子の探索

Research Project

Project/Area Number 20018010
Research InstitutionGifu University

Principal Investigator

武田 純  Gifu University, 大学院・医学系研究科, 教授 (40270855)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 堀川 幸男  岐阜大学, 医学部・附属病院, 准教授 (10323370)
Keywords糖尿病 / インスリン分泌 / 食欲 / トランスクリプトーム / 遺伝子多型 / 関連解析 / 膵島 / グルココルチコイド
Research Abstract

デキサメサゾン(DEX)に応答すり視床下部発現をスクリーニングした。検出した既知遺伝子は10,801個だった。その内DEX投与によって2倍以上発現が変化した遺伝子は22個だった。15個は増加し、7個は減少した。一方でラット視床下部cDNAライブラリから11,092個の部分塩基配列を含むクローンを獲得し、GenBankデータベースとの相同性解析とクラスタリングによって2,777個の既知遺伝子を同定した。その内2,498個はマイクロアレイでも検出された。mRNA長が1,5-2.5kbの遺伝子について、ライブラリのクローン重複数とマイクロアレイのシグナル強度は有意に相関し(r=0.569(p<0.001))、検出した遺伝子のGOに基づく機能分布も両手法の間で類似していた。カスタムアレイによって残り279個のGC反応性を検証したところ、GC反応性遺伝子は含まれていなかった。GCによって増加した15個の遺伝子のうち、転写因子結合領域予測プログラム(rVISTA)と文献検索によってGREが予測された遺伝子は6個にすぎなかった。その中で、GC反応性が最も大きかったsgk、bc16、pdk4について発現の詳細を検討し、これら3遺伝子の発現がDEX容量依存性に増加することを確認した。In situhybridization法によって、CRH産生細胞の存在する室傍核を含む視床下部前方の切片でも3遺伝子の発現が検出された。In silicoの手法によって予測されたGREが実際に機能しているかを検討するため、Hela細胞を用いてレポーターアッセイを行った結果、sgkのプロモーター領域だけがGC反応性を示し、bc16, pdk44のプロモーターは反応しなかった。現在、これらの遺伝子機能の膵島との共通性について検討している。

  • Research Products

    (3 results)

All 2009 2008

All Journal Article (3 results) (of which Peer Reviewed: 3 results)

  • [Journal Article] Construction of a prediction model for type 2 diabetes mellitus in the Japanese population based on eleven genes with strong evidence of the association2009

    • Author(s)
      K. Miyake, et.al.
    • Journal Title

      J. Hum. Genet 54

      Pages: 236-241

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Identification of minimal promoter and genetic variants of Kruppel-like factor 11 gene and association analysis with type 2 diabetes in Japanese2009

    • Author(s)
      E, Kuroda, et.al.
    • Journal Title

      Endocr. J. (In press)

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Case report of familial Carney complex due to novel frameshift mutation c. 597del C (p. Phe200LeufsX6) in PRKAR1A2008

    • Author(s)
      A. Sasaki, et.al.
    • Journal Title

      Mol. Genet. Metab 95

      Pages: 182-187

    • Peer Reviewed

URL: 

Published: 2010-06-11   Modified: 2016-04-21  

Information User Guide FAQ News Terms of Use Attribution of KAKENHI

Powered by NII kakenhi