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2008 Fiscal Year Annual Research Report

小児癌由来遺伝子材料を基盤とした疾病関連遺伝子の探索と病態解明への応用

Research Project

Project/Area Number 20018028
Research InstitutionChiba Cancer Center (Research Institute)

Principal Investigator

大平 美紀  Chiba Cancer Center (Research Institute), 臨床ゲノムセンター・がんゲノム研究室, 室長 (20311384)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 磯貝 恵理子  臨床ゲノムセンター, がんゲノム研究室, 上席研究員 (40300917)
中川原 章  臨床ゲノムセンター, 研究局, 研究局長 (50117181)
大羽 成征  京都大学, 大学院・情報学研究科, 講師 (80362838)
Keywords発生・分化 / マイクロアレイ / 遺伝子 / ゲノム
Research Abstract

神経・肝の発生分化における遺伝子発現ネットワークの解明と、神経芽腫・肝芽腫の発生および疾患メカニズムの解明を目指し、本年度は以下を進めた。
1)神経芽腫腫瘍サブセット間における発現量の異なる遺伝子の解析
これまでのスクリーニングから抽出した2つの遺伝子TSLC1とncRANlこついて解析を進めた。ncRANは、神経芽腫で高頻度に増加する17q25に座位し、進行神経芽腫において特異的に高発現を示した。様々な解析からncRANが新規非コードRNAであることが示唆された。発現レベルが神経芽腫の予後と強く相関すること、過剰発現時に神経芽腫細胞のコロニー形成能を亢進し、ノックダウン時に細胞増殖が抑制されることから、ncRANの高発現は、神経芽腫の細胞増殖亢進に関与していることが示された。今後はこれらの遺伝子の転写制御についての解析や遺伝子変異検索を行い、病態との関連について解析を進める。
2)神経発生分化関連転写因子群の神経芽腫細胞における遺伝子発現解析
癌遺伝子LMO3やMYCNが関わるMASH1などの神経発生・分化関連転写因子群の転写制御機構について解析を進めた。発生初期の神経組織におけるこれらの遺伝子の発現の追跡を目的に、遺伝子導入マウス胚の作製を開始した。
3)診断用チップの臨床応用
神経芽腫の診断ミニチップに新たにアレイCGH法によるリスク分類システムを組み合わせ、臨床における評価を進めた。新規登録症例を含め約150症例のデータを蓄積した。一方、188例の神経芽腫のゲノムコピー数異常の解析から、がん関連チロシンキナーゼ遺伝子ALKの増幅と変異を見いだした。本遺伝子の変異を持つ症例については、今後阻害剤を導入した新規治療法の開発が期待される。本研究においても、腫瘍リスク分類システムにALK遺伝子変異を取り入れるため、今後ALKの神経芽腫における意義付けを行う予定である。

  • Research Products

    (11 results)

All 2009 2008

All Journal Article (9 results) (of which Peer Reviewed: 9 results) Presentation (2 results)

  • [Journal Article] High expression of ncRAN, a novel non-coding RNA mapped to chromosome 17q25.1, is associated with poor prognosis in neuroblastoma.2009

    • Author(s)
      Yu M, Ohira M, Isogain E, ObaS, Nakagawara A, 他11名, 2, 8, 11, 18番目
    • Journal Title

      Int. J. Oncol. 34

      Pages: 931-938

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Novel risk stratification of patients with neuroblastoma by genomic signature which is independent of molecular signature.2008

    • Author(s)
      Tomioka N, Oba S, Ohira M, Isogain E, Nakagawara A, 他11名, 2, 3, 8, 16番目
    • Journal Title

      Oncogene 27

      Pages: 441-449

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] ERAP140/Nbla10993 is a novel favorable prognostic indicator for neuroblastoma and induced in response to retinoic acid.2008

    • Author(s)
      Arai H, Ohira M, Nakagawara A., 他9名, 5, 8番目
    • Journal Title

      Oncology Rep. 19

      Pages: 1381-1388

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] A novel HECT-type E3 ubiquitin protein ligase NEDL1 enhances the p53-mediated apoptotic cell death in its catalytic activity-independent manner.2008

    • Author(s)
      Li Y, Ohira M, Nakagawara A., 他3名, 5, 6番目
    • Journal Title

      Oncogene 27

      Pages: 3700-3709

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] The methylation status of RASSF1 promoter predicts responsiveness to chemotherapy and eventual cure in hepatoblastoma patients.2008

    • Author(s)
      Honda S, Ohira M, Nakagawara A, 他10名, 5, 10番目
    • Journal Title

      Int. J. Cancer 123

      Pages: 1117-1125

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Expression of TSLC1, a candidate tumor suppressor gene mapped to chromosome 11q23, is down-regulated in unfavorable neuroblastoma without promoter hypermethylation.2008

    • Author(s)
      Ando K, Ohira M, Nakagawara A, 他8名, 2, 11番目
    • Journal Title

      Int. J. Cancer 123

      Pages: 2087-2094

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] N-MYC promotes cell proliferation through a direct transactivation of neuronal leucine-rich repeat protein-1 (NLRR1) gene in neuroblastoma.2008

    • Author(s)
      Hossain S, Ohira M, Nakasawara A, 他5名, 6, 8番目
    • Journal Title

      Oncogene 27

      Pages: 6075-6082

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] KIF1Bbeta functions as a haploidinsufficient tumor suppressor gene mapped to chromosome 1p36.2 by inducing apoptotic cell death.2008

    • Author(s)
      Munirajan A, Ohira M, Nakagawara A, 他7名, 6, 10番目
    • Journal Title

      J. Biol. Chem. 283

      Pages: 24426-24434

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Oncogenic mutations of ALK kinase in neuroblastoma.2008

    • Author(s)
      Chen Y, Ohira M, Nakagawara A, 他11名, 5, 11番目
    • Journal Title

      Nature 455

      Pages: 971-974

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] Integrated analysis of genome copy number aberrations and its application for risk stratification for neuroblastoma2008

    • Author(s)
      大平美紀, 他10名
    • Organizer
      第67回日本癌学会学術総会
    • Place of Presentation
      名古屋
    • Year and Date
      2008-10-29
  • [Presentation] Practical Application and Validation of a Customized Expression Microarray-based Diagnostic System toward the New Risk Classification of Neuroblastoma2008

    • Author(s)
      大平美紀, 他16名
    • Organizer
      第13回国際神経芽腫学会 Advances in Neuroblastoma Research (ANR) 2008
    • Place of Presentation
      千葉・幕張
    • Year and Date
      2008-05-23

URL: 

Published: 2010-06-11   Modified: 2016-04-21  

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