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2008 Fiscal Year Annual Research Report

RNA転写後複合体ネットワークの試験管内再構成

Research Project

Project/Area Number 20034041
Research InstitutionEhime University

Principal Investigator

堀 弘幸  Ehime University, 理工学研究科, 教授 (20256960)

Keywords核酸 / 酵素 / 生体分子 / ゲノム / 進化
Research Abstract

平成20年度は、RNA修飾複合体ネットワーク解析に向けて、次のことを行った。
(1)プロテインノット型RNA修飾酵素のRNA認識機構
TrmHについて、デオキシ体を含むキメラ核酸との反応中間体解析を行ない、本酵素がフレキシブルにD-ループ中のグアニンヌクレオシドの2' -OH基を認識していることを明らかにした。また、本酵素の遺伝子破壊株を解析し、Gm18の修飾がtRNAの安定性に寄与することを発見した。さらに、TrmDについては、サブユニット間のジスルフィド結合形成が酵素自身の安定性に貢献することを報告した。
(2)古典的ロスマンフォールド型RNA修飾酵素のRNA認識機構
Trm1が、まったく新規なRNA認識機構を持ち、G26のみならず、G27もメチル化することを見出した。本研究成果については、予備的な結果を幾つかの学会で報告し、国際学会紀要としてまとめ、現在、さらにデータを足して論文を投稿中である。また、TrmBの遺伝子破壊株について検討し、本酵素によってもたらされるm7G46の修飾が好熱菌RNA修飾ネットワークの鍵となっていることを発見した。現在、その詳細について検討を重ねている。
(3)葉酸依存性RNA修飾酵素の構造・機能解析
TrmFOのX線結晶構造解析に成功するとともに、準定量的な酵素活性測定法を開発し、触媒機構およびRNA結合部位の推定をおこなった。本研究の成果は、Proc. Natl. Acad. Sci. USA誌に報告した。
(4)プロセシング酵素
スプラシングエンドヌクレアーゼの結晶化に成功し、現在、解析中である。

  • Research Products

    (26 results)

All 2009 2008 Other

All Journal Article (3 results) (of which Peer Reviewed: 3 results) Presentation (22 results) Remarks (1 results)

  • [Journal Article] Atomic structure of a folate/FAD-dependent tRNA T54 methyltransferase2009

    • Author(s)
      H. Nishimasu, R. Ishitani, K. Y amashita, C. Iwashita, A. Hirata H. Hori, and O. Nureki
    • Journal Title

      Proc. Natl. Acad. Sci. USA (In press)

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Stabilization of tRNA (m^1G37) methyltransferase [TrmD] from Aquifex aeolicus by an intersubunit disulfide bond formation2008

    • Author(s)
      T. Toyooka, T. Awai, T. Kanai. T. Imanaka, and H. Hori
    • Journal Title

      Genes to Cells 13

      Pages: 807-816

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Broad substrate RNA specificity of Trml [tRNA (m^2_2G26) methyltransf erasel from Aauifex aeolicus2008

    • Author(s)
      T. Awai, and H. Hori
    • Journal Title

      IEEE : Micro-NanoMechatronics and Human Science 2008 CEP07768-CDR

      Pages: P1-10

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] 始原菌(古細菌)tRNAスプライシングエンドヌクレアーゼによる変則的イントロンの切断2009

    • Author(s)
      北嶋翼、平田章、岩下知香子、横堀伸一、渡邊洋一、堀弘幸
    • Organizer
      第7回科研費特定領域「バイオ操作」公開シンポジウム
    • Place of Presentation
      仙台
    • Year and Date
      2009-03-06
  • [Presentation] tRNA(Gm18)methyitransferase[TrmH]TybeI型酵素とTypeII型酵素の比較2008

    • Author(s)
      越智杏奈、堀引幸
    • Organizer
      第31回日本分子生物学会年会・第81回日本生化学会合同年会(BMB2008)
    • Place of Presentation
      神戸
    • Year and Date
      2008-12-09
  • [Presentation] Thermus thermophilusにおけるtRNAシュードウリジン55合成酵素TruBの重要性2008

    • Author(s)
      石田一雄、冨川千恵、越智杏奈、横川隆志、岩下知香子、堀弘幸
    • Organizer
      第31回日本分子生物学会年会・第81回日本生化学会合同年会(BMB2008)
    • Place of Presentation
      神戸
    • Year and Date
      2008-12-09
  • [Presentation] 葉酸依存性tRNA(U54)メチル化酵素[TrmFO]の試験管内アッセイ法の確立2008

    • Author(s)
      山下光輝, 岩下知香子, 西増弘志, 濡木理, 堀弘幸
    • Organizer
      第31回日本分子生物学会年会・第81回日本生化学会合同年会(BMB2008)
    • Place of Presentation
      神戸
    • Year and Date
      2008-12-09
  • [Presentation] 超好熱性古細菌Aeropyrum pernixにおけるtRNA^<Thr>「前駆体とRMA修飾の解析2008

    • Author(s)
      北嶋翼、岩下知香子、横堀伸一、堀弘幸
    • Organizer
      第31回日本分子生物学会年会・第81回日本生花学会合同年会(BMB2008)
    • Place of Presentation
      神戸
    • Year and Date
      2008-12-09
  • [Presentation] 真正細菌Aquifex aeolicus由来Trm1[tRNA(m^2_2G26 methyltransferase]の構造と基質認識メカニズム2008

    • Author(s)
      粟井貴子、Ihsanawati、木村聡、冨川千恵、越智杏奈、横川隆志、鈴木勉、横山茂之、別所義隆、堀弘幸
    • Organizer
      第31回日本分子生物学会年会・第81回日本生化学会合同年会(BMB2008)
    • Place of Presentation
      神戸
    • Year and Date
      2008-12-09
  • [Presentation] 無細胞翻訳系を用いた酵母由来ヘテロサブユニツトtRNA修飾酵素の合成と解析2008

    • Author(s)
      岡田和樹、宗吉裕樹、遠藤弥重太、堀弘幸
    • Organizer
      第31回日本分子生物学会年会・第81回日本生化学会合同年会(BMB2008)
    • Place of Presentation
      神戸
    • Year and Date
      2008-12-09
  • [Presentation] 酵母由来tRNA(m^7G46)メチル基転移酵素[Trm8-Trm82]の解析及び、ウリ類炭疽病菌Trm8オーソログAPH1遺伝子の比較解析2008

    • Author(s)
      宗吉裕樹、松本啓介、高野義孝、高柳直幸、遠藤弥重太、堀弘幸
    • Organizer
      第31回日本分子生物学会年会・第81回日本生化学会合同年会(BMB2008)
    • Place of Presentation
      神戸
    • Year and Date
      2008-12-09
  • [Presentation] 好熱菌由来tRNA(m^7G46)methyltransferase[TrmB]の触媒メカニズムの解明に向けた機能解析2008

    • Author(s)
      冨川千恵, 堀弘幸
    • Organizer
      第31回日本分子生物学会年会・第81回日本生化学会合同年会(BMB2008)
    • Place of Presentation
      神戸
    • Year and Date
      2008-12-09
  • [Presentation] tRNA修飾に対する翻訳伸長因子EF-Tuの影響2008

    • Author(s)
      中村仁, 堀弘幸
    • Organizer
      第31回日本分子生物学会年会・第81回日本生化学会合同年会(BMB2008)
    • Place of Presentation
      神戸
    • Year and Date
      2008-12-09
  • [Presentation] Broad substrate RNA specificity of Trml [tRNA (m^2_2G26) methyltransferase] from Aauifex aeolicus2008

    • Author(s)
      T. Awai, and H. Hori
    • Organizer
      2008 International Symposium on Micro-NanoMechatronics and Human Science
    • Place of Presentation
      Nagoya
    • Year and Date
      2008-11-06
  • [Presentation] Yeast tRNA (m^7G46) methyltransferase which contains two protein subunits (Trm8 and Trm82) synthesized in a wheat germ cell-free translation system2008

    • Author(s)
      Y. Muneyoshi, K. Matsumoto, C. Tomikawa, T. Toyooka, Anna Ochi, T. Masaoka, Y. Endo, and H. Hori
    • Organizer
      Protein Island Matsuyama International Symposium 2008
    • Place of Presentation
      Matsuyama
    • Year and Date
      2008-09-27
  • [Presentation] Effects of tRNA (m7G46) modification in an extreme thermophile, The rmus thermonhilus2008

    • Author(s)
      Chie Tomikawa, Takashi Yokogawa, Hiroyuki, Hori
    • Organizer
      FEBS Meeting
    • Place of Presentation
      Greek, sfetses
    • Year and Date
      2008-09-13
  • [Presentation] 超好熱性真正細菌Aquifex aeikucysの推定上のtrm1遺伝子産物の性質決定2008

    • Author(s)
      粟井貴子、木村聡、Ihsanawati、冨川千恵、越智杏奈.、別所義隆、横山茂之、横川隆志、鉾木勉、堀弘幸
    • Organizer
      高度好熱菌丸ごと一匹プロジェクト第7回連携研究会
    • Place of Presentation
      理研・播磨(SPring-8)
    • Year and Date
      2008-09-13
  • [Presentation] Thermus thermophilus tRNA(m^1A58)methylfransferase[Trml]の基質認識機構2008

    • Author(s)
      美濃地真之, 牛尾なつみ, 堀弘幸
    • Organizer
      高度好熱菌丸ごと一匹プロジェクト第7回連携研究会
    • Place of Presentation
      理研・播磨(SPring-8)
    • Year and Date
      2008-09-13
  • [Presentation] Thermus thremophilus 由来tRNA U54メチル化酵素TrmFo in vitroアッセイ法の確立2008

    • Author(s)
      山下光輝, 岩下知香子, 西増弘志, 濡木理, 堀泓幸
    • Organizer
      高度好熱菌丸ごと一匹プロジェクト第7回連携研究会
    • Place of Presentation
      理研・播磨(SRring-8)
    • Year and Date
      2008-09-13
  • [Presentation] tRNAシュードウリジン55合成酵素TruB遺伝子破壊株及び変異株の生育について2008

    • Author(s)
      石田一雄, 冨川千恵, 岩下知香子, 堀弘幸
    • Organizer
      高度好熱菌丸ごと一匹プロジェクト第7回連携研究会
    • Place of Presentation
      理研・播磨(SPring-8)
    • Year and Date
      2008-09-13
  • [Presentation] 真正細菌Aqifex aeolius由来Trm1[tRNA(m22G26)methyltransferase]はG26のみならずG27もメチル化する2008

    • Author(s)
      粟井貴子、木村聡、Ihsanawati、冨川千恵、越智杏奈、別所義隆、横山茂之、横川隆志、鈴木勉、堀弘幸
    • Organizer
      第10回日本RNA学会年会
    • Place of Presentation
      札幌
    • Year and Date
      2008-07-25
  • [Presentation] Thermus thermophilus HB8 tRNA(Gm18)methyltransferase[TrmH]C末端領域による基質認識メカニズム2008

    • Author(s)
      越智杏奈、堀弘幸
    • Organizer
      第10回日本RNA学会年会
    • Place of Presentation
      札幌
    • Year and Date
      2008-07-23
  • [Presentation] 高度好熱菌Thermus thermophilusにおけるtRNAm7G46修飾の役割は一体何か?2008

    • Author(s)
      冨川千恵、横川隆志、堀弘幸
    • Organizer
      第10回日本RNA学会年会
    • Place of Presentation
      札幌
    • Year and Date
      2008-07-23
  • [Presentation] 超好熱菌Aquifex aeolicus由来tRM(m1G37)メチル化酵素[TrmD]のサブユニット間ジスルフィド結合形成の役割2008

    • Author(s)
      豊岡峻、粟井貴子、金井保、今中忠行、堀弘幸
    • Organizer
      第10回日本RNA学会年会
    • Place of Presentation
      札幌
    • Year and Date
      2008-07-23
  • [Presentation] RNA転写後複合体ネットワークの試験管内再構成2008

    • Author(s)
      堀弘幸
    • Organizer
      第6回科研費特定領域「バイオ操作」公開シンポジウム
    • Place of Presentation
      京都
    • Year and Date
      2008-06-13
  • [Remarks]

    • URL

      http://wwi.ehime-u.ac.jp/~rachem/bchem/

URL: 

Published: 2010-06-11   Modified: 2016-04-21  

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