• Search Research Projects
  • Search Researchers
  • How to Use
  1. Back to project page

2008 Fiscal Year Annual Research Report

膜蛋白質の機能変換から観る機能-構造変化の連関性と分子論的理解

Research Project

Project/Area Number 20050012
Research InstitutionNagoya University

Principal Investigator

須藤 雄気  Nagoya University, 理学研究科, 助教 (10452202)

Keywords生物物理 / 分子認識 / シグナル伝達 / 膜タンパク質 / 受容体 / 光センサー
Research Abstract

1-1. 忌避応答光センサー蛋白質、SRIIの機能発現分子メカニズム
(1) 通常1s程度で崩壊する活性型中間体をOctyl-glucoside中、酸性下で2hrまで寿命延長させ、伝達蛋白質との親和性(Kd=5μM)やシップ塩基のpKa(15)を決定した[Biophys.J.2008]。阪大/水谷グループと共同で、機能・構造変化に必須のアミノ酸残基(Tyr174)の変化を検出するため、時間分解紫外共鳴ラマン測定を行っている。
1-2. デュアル光センサー蛋白質、SRIの機能発現メカニズム
(1) 蛋白質の不安定さが解析を行う上で障害であったが、真正細菌S.ruberより極めて安定なSRIを単離し分光学的解析を行った[J.Biol.Chem.2008]。(2)上記SRIを用い低温赤外分光測定を行い。これまで困難であった高波数領域の測定から、イオンポンプとセンシング蛋白質の構造・構造変化の違いを見出した[Biochemistry 2008]。(3)SrSRIのCl^-依存的光反応変化を見出した[論文投稿中]。現在、比較的良質な結晶を得て、結晶構造解析(阪大・今田博士との共同研究)を開始している。さらにSRIの伝達蛋白質(HtrI)の取得にも成功しており。複合体解析も可能になってきた。また、SRI-HtrIを細菌に組み込み、光センシングする系を立ち上げ、機能解析も簡便に行える下地が出来つつある。機能変換に向けて順調に進展している。

  • Research Products

    (15 results)

All 2009 2008

All Journal Article (7 results) (of which Peer Reviewed: 5 results) Presentation (8 results)

  • [Journal Article] 真正細菌から得られた2つの機能を持つフォトクロミック光受容体ホモログ2009

    • Author(s)
      須藤雄気
    • Journal Title

      生物物理 49

      Pages: 25-26

  • [Journal Article] Structural Changes of Salinibacter Sensory Rhodopsin I upon Formation of the K and M Photointermediates2008

    • Author(s)
      D. Suzuki, Y. Sudo, Y. Furutani, H. Takahashi, M. Homma, and *H. Kandori
    • Journal Title

      Biochemistry 47

      Pages: 12750-12759

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Salinibacter Sensory Rhodopsin : Sensory Rhodopsin I-like Protein From a Eubacterium2008

    • Author(s)
      T. Kitajima-Ihara, Y. Furutani, D. Suzuki, K. Ihara, H. Kandori, M. Homma, and *Y. Sudo
    • Journal Title

      J. Biol. Chem. 283

      Pages: 23533-23541

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Steric Constraint in the Primary Photoproduct of Sensory Rhodopsin II is a Prerequisite for Light-Signal Transfer to Htrll2008

    • Author(s)
      M. Ito, Y. Sudo, Y. Furutani, T. O kitsu, A. Wada, M. Homma, J. L. Spudich, and *H. Kandori
    • Journal Title

      Biochemistry 47

      Pages: 6208-6215

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Protein-protein interaction of a Pharaonis halorhodopsin mutant forming a complex with Pharaonis halobacterial transducer protein II detected by Fourier-transform infrared spectroscopy2008

    • Author(s)
      Y. Furutani, M. Ito, Y. Sudo, N. K amo, and *H. Kandori
    • Journal Title

      Photochem. Photobiol. 84

      Pages: 874-879

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] A Long-lived M-like State of Phoborhodopsin That mimics the Active State2008

    • Author(s)
      *Y. Sudo, T. Nishihori, M. Iwamot o, K. Shimono, C. Kojima, and N. Kamo
    • Journal Title

      Biophys. J. 95

      Pages: 753-760

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] A Long-lived M-Iike State of Phoborhodopsin That mimics the Active State2008

    • Author(s)
      D. Suzuki, T.KitajimaIhara, Y. Fu rutani, K. Ihara, H. Kandori, M. H omma, and *Y. Sudo
    • Journal Title

      Communicative & Integrative Biology [review] 1

      Pages: 150-152

  • [Presentation] 光を利用した細菌の営みを分子レベルで解き明かす2009

    • Author(s)
      須藤雄気
    • Organizer
      東京工業大学・集中講義セミナー
    • Place of Presentation
      長津田、日本
    • Year and Date
      2009-01-29
  • [Presentation] 古細菌型ロドプシンを例に、タンパク質の構造と機能の相関性を考える2008

    • Author(s)
      須藤雄気[Invited]
    • Organizer
      日本生物物理学会、第45回年会・シンポジウム
    • Place of Presentation
      福岡、日本
    • Year and Date
      20081203-05
  • [Presentation] べん毛モーター固定子複合体中でイオン透過経路を形成するアミノ酸残基の推定2008

    • Author(s)
      須藤雄気,安倍-吉住玲,小嶋誠司,本間道夫
    • Organizer
      日本生物物理学会、第45回年会
    • Place of Presentation
      福岡、日本
    • Year and Date
      20081203-05
  • [Presentation] 細菌のべん毛モーターを駆動する固定子複合体中のイオン透過経路の解析2008

    • Author(s)
      須藤雄気, 北出祐也, 寺島浩行, 吉住玲, 小嶋勝, 小嶋誠司, 古谷祐詞, 神取秀樹, 本間道夫
    • Organizer
      日本生体エネルギー研究会・第34研究会
    • Place of Presentation
      東京、日本
    • Year and Date
      20081106-08
  • [Presentation] The Relationship between Chemical Reactions and Photo-signal Relay in Membrane Embedded Photoreceptors2008

    • Author(s)
      Y. Sudo [Invited]
    • Organizer
      18 th International Conference on Fine Chemistry and Functional Polymers (FCFP) and 4 th IUPAC international Conference on Novel Materials and Synthesis
    • Place of Presentation
      Zhenjiang, China
    • Year and Date
      2008-10-16
  • [Presentation] べん毛モーターの回転駆動力を生み出すイオンチャネル複合体(PomA/PomB)におけるイオン透過経路の解析2008

    • Author(s)
      須藤雄気、北出祐也、吉住玲、古谷祐詞、小嶋勝、小嶋誠司、神取秀樹、本間道夫
    • Organizer
      生理研研究会
    • Place of Presentation
      岡崎、日本
    • Year and Date
      2008-09-06
  • [Presentation] べん毛モーターを駆動する固定子複合体中のイオン透過経路の推定2008

    • Author(s)
      須藤雄気、吉住玲、小嶋誠司、本間道夫
    • Organizer
      第5回、21世紀大腸菌研究会
    • Place of Presentation
      藤枝、日本
    • Year and Date
      2008-07-28
  • [Presentation] The Molecular Mechanism for the Signaling from Sensory Rhodopsins to Their Cognate Transducer Proteins2008

    • Author(s)
      Y. Sudo [Invited]
    • Organizer
      13 th International Conference on Retinal Proteins (13 th ICRP)
    • Place of Presentation
      Barcelona, Spain
    • Year and Date
      2008-06-18

URL: 

Published: 2010-06-11   Modified: 2016-04-21  

Information User Guide FAQ News Terms of Use Attribution of KAKENHI

Powered by NII kakenhi