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2009 Fiscal Year Annual Research Report

RNAの運命決定制御とヘテロクロマチンにおける転写装置の役割

Research Project

Project/Area Number 20052013
Research InstitutionKyoto University

Principal Investigator

村上 洋太  Hokkaido University, 大学院・先端生命科学研究院, 教授 (20260622)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 山口 雄輝  東京工業大学, 生命理工学部, 助教授 (50345360)
KeywordsRNAポリメラーゼII / 転写伸長 / ヘテロクロマチン / RNAプロセシング
Research Abstract

RNAは細胞の状況やクロマチン構造によりその運命が変化するが、その分子機構は明らかではない。研究代表の村上は分裂酵母を用いてRNAi依存性ヘテロクロマチン形成の契機となるnon-coding RNAの転写にかかわる因子の同定解析をおこなっている。本年度は転写伸長に共役してRNAの運命決定やクロマチン構造制御に深く関わるRNAポリメラーゼIIのCTDリン酸化とヘテロクロマチン形成の関連を解析した。その結果CTDの2番目のセリンのリン酸化がヘテロクロマチン形成に必要で有ることが示された。また、転写の初期段階の慎重制御に関与するSpt4タンパク質(下記山口のDISFのサブユニット)が欠失するとヘテロクロマチンによる転写抑制が機能しなくなることも見いだした。これらの結果はヘテロクロマチンないでの転写伸長制御がダイナミックにヘテロクロマチン形成・転写抑制に関わるという新規のコンセプトを示唆している。研究分担者である山口は、第1に、転写伸長因子DSIFによる伸長活性化のメカニズムについて生化学的解析を行ない、DSIFが他の転写伸長因子Tat-SF1およびPaf1複合体と協調的に転写伸長を活性化することを明らかにした。第2に、DSIFがリン酸化依存的にRNA品質管理因子Dom3と結合することについて機能・構造解析を進めた。コロンビア大学のTong研究室と共同で、DSIFのリン酸化ペプチドとDom3の共結晶構造を解析した。第3に、3'プロセシング因子CFImの機能・構造解析を行ない、CFImが(25)2-59-68というヘテロ4量体を形成すること、そして細胞内において多数の遺伝子上で選択的ポリ(A)付加を制御するユニークな役割を果たしていることを明らかにした。

  • Research Products

    (13 results)

All 2010 2009

All Journal Article (6 results) (of which Peer Reviewed: 6 results) Presentation (7 results)

  • [Journal Article] Dynamic regulation of heterochromatin via phosphorylation of HP1-family proteins2010

    • Author(s)
      Shimada, et al.
    • Journal Title

      Epigenetics 5

      Pages: 30-33

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Identification of a primary target of thalidomide teratogenicity2010

    • Author(s)
      Ito, et al.
    • Journal Title

      Science 327

      Pages: 1345-1350

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Role of N-end rule ubiquitin ligases UBR1 and UBR2 in regulating the leucine-mTOR signaling pathway2010

    • Author(s)
      Kume, et al.
    • Journal Title

      Genes Cells 15

      Pages: 339-349

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Repression of RNA Polymerase II elongation in vivo is critically dependent on the C-terminus of Spt52009

    • Author(s)
      Chen, et al.
    • Journal Title

      PLoS ONE 4

      Pages: e6918

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] DSIF, the Paf1 complex, and Tat-SF1 have non-redundant, cooperative roles in RNA polymerase II elongation2009

    • Author(s)
      Chen, et al.
    • Journal Title

      Genes Dev. 23

      Pages: 2765-2777

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Identification of dynamin-2-mediated endocytosis as a new target of osteoporosis drugs, bisphosphonates2009

    • Author(s)
      Masaike, et al.
    • Journal Title

      Mol.Pharmacol. 77

      Pages: 262-269

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] Potential role of transcription elongation factors and elongation control in differentiation and maintenance of ES cells2010

    • Author(s)
      Yuki Yamaguchi
    • Organizer
      Japan-Israel Workshop on Stem Cells
    • Place of Presentation
      Jerusalem, Israel
    • Year and Date
      2010-02-25
  • [Presentation] Dynamic Regulation of heterochromatin sturucture/function in the cell cycle2009

    • Author(s)
      村上洋太
    • Organizer
      第32回日本分子生物学会年会ワークショップ「染色体倍加装置のダイナミクス」
    • Place of Presentation
      神奈川県 横浜市
    • Year and Date
      20091209-20091212
  • [Presentation] Dynamic Regulation of Heterochrimatin2009

    • Author(s)
      Murakami, Y.
    • Organizer
      The fifth International Fission Yeast Meeting
    • Place of Presentation
      東京都
    • Year and Date
      20091026-20091031
  • [Presentation] トランスポゼース由来の分裂酵母CENP-Bホモログはキネトコアとヘテロクロマチンの境界で機能する。2009

    • Author(s)
      村上洋太
    • Organizer
      第82回日本生化学会大会 シンポジウム「トランスポゾンとの共生が織りなすゲノムシステムのダイナミクス」
    • Place of Presentation
      兵庫県 神戸市
    • Year and Date
      20091021-20091024
  • [Presentation] Dynamic Regulation of Heterochrimatin2009

    • Author(s)
      村上洋太
    • Organizer
      第24回 内藤カンファレンス"Nuclear Dynamics and RNA[II]
    • Place of Presentation
      北海道 札幌市
    • Year and Date
      20090623-20090626
  • [Presentation] Mechanism of phosphorylation-dependent elongation activation by DSIF2009

    • Author(s)
      Yuki Yamaguchi
    • Organizer
      EMBO Workshop on Messenger RNA 3' Ends & Gene Expression
    • Place of Presentation
      Oxford, UK
    • Year and Date
      2009-09-18
  • [Presentation] DSIF, the Paf1 complex, and Tat-SF1 have non-redundant, cooperative roles in RNA polymerase II elongation2009

    • Author(s)
      Yuki Yamaguchi
    • Organizer
      CSHL Meeting on Mechanisms of Eukaryotic Transcription
    • Place of Presentation
      New York, USA
    • Year and Date
      2009-08-27

URL: 

Published: 2011-06-16   Modified: 2016-04-21  

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