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2009 Fiscal Year Annual Research Report

Gq型G蛋白質共役光受容体のX線構造解析

Research Project

Project/Area Number 20054008
Research InstitutionNagoya University

Principal Investigator

村上 緑  名古屋大学, 理学研究科, 助教 (20324387)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 神山 勉  名古屋大学, 理学研究科, 教授 (30170210)
Keywordsロドプシン / X線結晶構造解析 / GPCR / 反応中間体
Research Abstract

ロドプシンが担う光情報変換機能の初期過程は、蛋白質内に含む発色団レチナールの11-cis型から全トランス型への光異性化反応である。バソ中間体において吸収した光エネルギーが活性部位レチナールに微小な歪みとして蓄えられ、ルミ中間体を経てメタ中間体で分子全体に広がる構造変化を惹起し、その結果、細胞質側表面に共役したG蛋白質に光情報が伝えられる。本研究課題では、バソ中間体およびその光異性体である9-シス型イソロドプシンの構造解析を行った。
イカロドプシン結晶に対し液体窒素温度下でさまざまな波長の光を照射すると、11-シス型基底状態、9-シス型イソロドプシン、全トランス型バソ中間体の3状態間で平衡状態を形成した。この平衡状態において、さまざまな光照射条件下での光異性体の形成率を見積もり、バソ中間体およびイソロドプシンの測定に最適な条件を見出した。さらに、3状態間遷移の速度定数を決定することができた。X線回折実験においては、ビームラインに設置されたオンライン顕微分光装置を用いて照射したX線量に依存する結晶の吸収変化を測定し、少量のX線量によって壊れていくタンパク質を定量的に解析し、X線照射下でのバソ中間体の残存率を正確に見積もった。これらの結果に基づき、バソ中間体とイソロドプシンのモデルを精度よく構築することができた。

  • Research Products

    (24 results)

All 2010 2009

All Journal Article (6 results) (of which Peer Reviewed: 6 results) Presentation (18 results)

  • [Journal Article] 無脊椎動物のロドプシン研究2010

    • Author(s)
      村上緑
    • Journal Title

      生物物理

      Volume: 50 Pages: 274-275

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Structural divergence and functional versatility of the rhodopsin superfamily2010

    • Author(s)
      Kouyama T, Murakami M
    • Journal Title

      Photochem Photobiol Sci.

      Volume: 9 Pages: 1458-1465

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] 光駆動イオンポンプの作動原理2010

    • Author(s)
      神山勉
    • Journal Title

      生物物理

      Volume: 50 Pages: 222-227

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Crystal structure of the light-driven chloride pump halorhodopsin from Natronomonas pharaonis2010

    • Author(s)
      Kouyama T, Kanada S, Takeguchi Y, Narusawa A, Murakami M, Ihara K
    • Journal Title

      J.Mol.Biol.

      Volume: 396 Pages: 564-579

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Structure of squid rhodopsin2009

    • Author(s)
      Murakami M, Kouyama T
    • Journal Title

      Research Frontiers 2008

      Pages: 30-31

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Crystal structures of different substates of bacteriorhodopsin's M Intermediate at various pH levels2009

    • Author(s)
      Yamamoto M, Hayakawa N, Murakami M, Kouyama T
    • Journal Title

      J.Mol.Biol.

      Volume: 393 Pages: 559-573

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] イカロドプシン光異性化反応産物のX線結晶構造解析2010

    • Author(s)
      村上緑, 神山勉
    • Organizer
      日本生物物理学会第48回年会
    • Place of Presentation
      仙台
    • Year and Date
      20100920-20100922
  • [Presentation] Natronomonas pharaonis由来の光駆動塩素イオンポンプ・ハロロドプシンのO中間体様青色状態の結晶構造2010

    • Author(s)
      金田創運, 神山勉
    • Organizer
      日本生物物理学会第48回年会
    • Place of Presentation
      仙台
    • Year and Date
      20100920-20100922
  • [Presentation] Natronomonas pharaonis由来の光駆動塩素イオンポンプ・ハロロドプシンのX線結晶構造解析2010

    • Author(s)
      神山勉, 金田創運, 張進, 竹口優, 村上緑, 井原邦夫
    • Organizer
      日本生物物理学会第48回年会
    • Place of Presentation
      仙台
    • Year and Date
      20100920-20100922
  • [Presentation] バクテリオロドプシンのLeu93の役割に関するX線結晶構造解析2010

    • Author(s)
      張進, 山崎芳和, 樋掛雅則, 村上緑, 井原邦夫, 神山勉
    • Organizer
      日本生物物理学会第48回年会
    • Place of Presentation
      仙台
    • Year and Date
      20100920-20100922
  • [Presentation] Crystal structure of halorhodopsin from Natronomonas pharaonis2010

    • Author(s)
      T.Kouyama
    • Organizer
      International Conference on Retinal Proteins
    • Place of Presentation
      Santa Cruz
    • Year and Date
      20100802-20100806
  • [Presentation] X-ray crystallography of the primary photoreaction intermediate of squid rhodopsin2010

    • Author(s)
      M.Murakami, T.Kouyama
    • Organizer
      International Conference on Retinal Proteins
    • Place of Presentation
      Santa Cruz
    • Year and Date
      20100802-20100806
  • [Presentation] イカロドプシン光反応初期中間体のX線結晶構造解析2010

    • Author(s)
      村上緑, 神山勉
    • Organizer
      日本薬学会第130年回
    • Place of Presentation
      岡山
    • Year and Date
      20100328-20100330
  • [Presentation] イカロドプシンの光化学反応:バソ中間体の構造解析から何がわかるか2010

    • Author(s)
      村上緑
    • Organizer
      分子研研究会「拡がるロドプシンの仲間から"何がわかるか"何をもたらすか"」
    • Place of Presentation
      岡崎
    • Year and Date
      20100323-20100324
  • [Presentation] 古細菌の光駆動イオンポンプ:反応中間体の構造解析からなにが分かるか2010

    • Author(s)
      神山勉
    • Organizer
      分子研研究会「拡がるロドプシンの仲間から"何がわかるか"何をもたらすか"」
    • Place of Presentation
      岡崎
    • Year and Date
      20100323-20100324
  • [Presentation] Crystallization of octopus rhodopsin2010

    • Author(s)
      J.Zhang, S.Kanada, M.Tsuda, T.Iwasa, T.Gotoh, M.Murakami, T.Kouyama
    • Organizer
      分子研研究会「拡がるロドプシンの仲間から"何がわかるか"何をもたらすか"」
    • Place of Presentation
      岡崎
    • Year and Date
      20100323-20100324
  • [Presentation] Natronomonas pharaonis由来光駆動塩素イオンポンプhalorhodopsin光反応中間体のX線結晶構造解析2010

    • Author(s)
      金田創運, 井原邦夫, 神山勉
    • Organizer
      分子研研究会「拡がるロドプシンの仲間から"何がわかるか"何をもたらすか"」
    • Place of Presentation
      岡崎
    • Year and Date
      20100323-20100324
  • [Presentation] X-ray analysis of the primary photochemical reaction of squid rhodopsin2010

    • Author(s)
      M.Murakami
    • Organizer
      International Symposium "Fifty Years of Biophysics Research at Nagoya University"
    • Place of Presentation
      Nagoya
    • Year and Date
      20100312-20100314
  • [Presentation] Crystallization of octopus rhodopsin2010

    • Author(s)
      J.Zhang, S.Kanada, M.Tsuda, T.Iwasa, T.Gotoh, M.Murakami, T.Kouyama
    • Organizer
      International Symposium "Fifty Years of Biophysics Research at Nagoya University"
    • Place of Presentation
      Nagoya
    • Year and Date
      20100312-20100314
  • [Presentation] Natronomonas pharaonis由来光駆動塩素イオンポンプハロロドプシンの結晶構造解析2009

    • Author(s)
      金田創運, 竹口優, 村上緑, 井原邦夫, 神山勉
    • Organizer
      日本生物物理学会第48回年会
    • Place of Presentation
      徳島
    • Year and Date
      20091030-20091101
  • [Presentation] タコロドプシンの結晶化2009

    • Author(s)
      張進, 金田創運, 津田基之, 岩佐達郎, 村上緑, 神山勉
    • Organizer
      日本生物物理学会第48回年会
    • Place of Presentation
      徳島
    • Year and Date
      20091030-20091101
  • [Presentation] バクテリオロドプシンミュータントL93Aの長寿命化した光反応中間体の結晶学的研究2009

    • Author(s)
      山崎芳和, 樋掛雅則, 村上緑, 井原邦夫, 神山勉
    • Organizer
      日本生物物理学会第48回年会
    • Place of Presentation
      徳島
    • Year and Date
      20091030-20091101
  • [Presentation] バクテリオロドプシンのM中間体の結晶構造のpH依存性2009

    • Author(s)
      神山勉, 山本昌孝, 早川直紀, 村上緑
    • Organizer
      日本生物物理学会第48回年会
    • Place of Presentation
      徳島
    • Year and Date
      20091030-20091101
  • [Presentation] イカロドプシンバソ中間体のX線結晶構造解析2009

    • Author(s)
      村上緑, 神山勉
    • Organizer
      日本生物物理学会第48回年会
    • Place of Presentation
      徳島
    • Year and Date
      20091030-20091101

URL: 

Published: 2012-07-19  

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