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2008 Fiscal Year Annual Research Report

細胞内プリオンタンパク質の立体構造、ダイナミクス、及び立体構造変換反応の解明

Research Project

Project/Area Number 20059016
Research InstitutionGifu University

Principal Investigator

桑田 一夫  Gifu University, 人獣感染防御研究センター, 教授 (00170142)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 山口 圭一  岐阜大学, 人獣感染防御研究センター, 学術研究補佐員 (90432187)
武藤 淳二  岐阜大学, 人獣感染防御研究センター, 助教 (80432186)
Keywordsプリオン / in vivo NMR / 立体構造 / ダイナミクス / 構造変換
Research Abstract

プリオンの立体構造やダイナミクスは、現在まで主に溶液中または結晶中で決定がなされてきた(Kuwata et.al., Biochemistry, 2001, 2003)。近年に至り、細胞外でもラフトの周辺でかつ、膜にアンカーしたプリオンに対して構造変換反応が起きることが分かってきた。さらに、標識したプリオンを細胞に注入すると、ゴルジ装置周辺への集積などが見られる。プリオンが細胞内において特異的な挙動を示すことは、プリオンが何らかの特異的な構造を有し、細胞内過程がプリオンの毒性・感染性に関連を有する可能性を示している(Kuwata et.al., Proc. Natl Acad. Sci., U. S. A., 2003)。本研究では、細胞内におけるプリオンの立体構造を解析し、その動的性質や生理機能、毒性発現メカニズム、細胞内局在と立体構造との相関などを解明する。また、抗プリオン薬の作用機構を細胞内トラフィッキングの観点から明らかにする。
本年は、リコンビナント・プリオンタンパク質を蛍光物質であるCy3でラベルし、培養神経細胞(GT1-7)にマイクロインジェクションし、蛍光顕微鏡で観測することに成功した。また、アフリカツメガエルの卵母細胞の抽出液に、タンパクを溶かした100mM nmr buffer(pH4.5, protease inhibitor & NaN3)を混ぜて、NMR測定サンプルを調製(final 90μM protein)し、細胞内環境に近い状態のプリオンのNMRスペクトルを観測することに成功した。タンパク質の沈澱のために信号強度は減少したが、プリオンのNMRスペクトルを観測する事ができた。プリオンタンパク質は、他の細胞内蛋白質等と相互作用するため、非常に多くの残基に化学シフトの変化が観測された。しかし、興味深いことに、ピークのブロードニングなどはなく、運動性に関しては、水溶液に近い状態で存在していることが分かった。

  • Research Products

    (34 results)

All 2009 2008 Other

All Journal Article (10 results) (of which Peer Reviewed: 10 results) Presentation (22 results) Book (1 results) Remarks (1 results)

  • [Journal Article] DFT studies on redox properties of copper-chelating cuprizone : Unusually high-valent copper(III) state2009

    • Author(s)
      Norifumi Yamamoto, et.al.
    • Journal Title

      Journal of Molecular Structure THEOCHEM 895

      Pages: 52-56

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] A Variety of Anti-Prion Compounds Discovered through an in silico Sereen Based on PrPc Structure : A Correlation Between Anti-Prion Activity and Binding Affinity2009

    • Author(s)
      Junji Hosokawa - Muto, et.al.
    • Journal Title

      Antimicrobial Agents and Chemotherapy (AAC)

      Pages: 765-771

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Cold destabilization and temperature jump of the murine prion protein mPrP(23-231)2009

    • Author(s)
      Tomoharu Matsumoto, et.al.
    • Journal Title

      Biochimica et Biophysica Acta(BBA)Proteins and Proteomics

      Pages: 669-673

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Theoretical study of the prion protein based on the fragment molecular orbital method2009

    • Author(s)
      Takeshi Ishikawa, et.al.
    • Journal Title

      Journal of Computational Chemistry (in press)

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Critical role of CD44 in hepatotoxin-mediated liver injury2008

    • Author(s)
      Kimura K, et.al.
    • Journal Title

      Journal of Hepatology 48

      Pages: 952-961

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Critical Region for Amyloid Fibril Formaition of Mouse Prion Protein : Unusual Amyloidogenic Properties of Helix 2 Peptide2008

    • Author(s)
      Kei-ichi Yamaguchi, et.al.
    • Journal Title

      Biochemistry 47

      Pages: 13242-13251

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Positioning of autoimmune TCR-Ob. 2F3 and TCR-Ob. 3D1 on the MBP85-99/HLA-DR2 complex2008

    • Author(s)
      Zenichiro Kato, et.al.
    • Journal Title

      Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A 105

      Pages: 15523-15528

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] プリオン2008

    • Author(s)
      桑田一夫
    • Journal Title

      蛋白質・核酸・酵素 53

      Pages: 991

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] プリオン病治療薬の論理的開発をめざして-蛋白質のダイナミクス解析から構造変換制御物質の探索へRational drug discovery for prion diseases-2008

    • Author(s)
      桑田一夫
    • Journal Title

      蛋白質核酸酵素 53

      Pages: 727-732

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] ダイナミクスと安定性が交叉する領域の熱力学-量子暗号熱力学とプリオン-2008

    • Author(s)
      桑田一夫
    • Journal Title

      熱測定 35

      Pages: 140-147

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] IDENTIFICATION OF A VARIETY OF ANTI-PRION COMPOUNDS THAT ACT AS CHEMICAL CHAPERONS2009

    • Author(s)
      Yuji O. Kamatari
    • Organizer
      新学術領域研究「揺らぎと生体機能」第2回公開シンポジウム
    • Place of Presentation
      岡崎コンファレンスセンター
    • Year and Date
      20090316-17
  • [Presentation] ENZYME INHIBITORS AND ACTIVATORS FOUND BY IN SILICO SCREEN FOR LYSOZYME2009

    • Author(s)
      Hironori K. Nakamtira
    • Organizer
      新学術領域研究「揺らぎと生体機能」第2回公開シンポジウム
    • Place of Presentation
      岡崎コンファレンスセンター
    • Year and Date
      20090316-17
  • [Presentation] プリオン立体構造変換の物理2009

    • Author(s)
      桑田一夫
    • Organizer
      第64回日本物理学会年会
    • Place of Presentation
      立教大学
    • Year and Date
      2009-03-29
  • [Presentation] GN8-プリオン蛋白質間相互作用の分子動力学シミュレーションによる解析2008

    • Author(s)
      石倉孝一
    • Organizer
      第46回日本生物物理学会年会
    • Place of Presentation
      福岡国際会議場
    • Year and Date
      20081203-05
  • [Presentation] 抗プリオン化合物の作用機構による分類2008

    • Author(s)
      早野陽介
    • Organizer
      第46回日本生物物理学会年会
    • Place of Presentation
      福岡国際会議場
    • Year and Date
      20081203-05
  • [Presentation] シーディングによるマウスPrPアミロイド線維の伝播2008

    • Author(s)
      山口圭一
    • Organizer
      第46回日本生物物理学会年会
    • Place of Presentation
      福岡国際会議場
    • Year and Date
      20081203-05
  • [Presentation] ケミカルシャペロンとして働く抗プリオン化合物群の同定2008

    • Author(s)
      鎌足雄司
    • Organizer
      第46回日本生物物理学会年会
    • Place of Presentation
      福岡国際会議場
    • Year and Date
      20081203-05
  • [Presentation] プリオン病における毒性作用の発現機構 : 遷移金属イオンの生体作用を軸とした分子論的解析2008

    • Author(s)
      山本典史
    • Organizer
      第46回日本生物物理学会年会
    • Place of Presentation
      福岡国際会議場
    • Year and Date
      20081203-05
  • [Presentation] β2ミクログロブリンのフラグメントが形成するアミロイド線維構造の構造解析2008

    • Author(s)
      Yuichi Yoshimura
    • Organizer
      第46回日本生物物理学会年会
    • Place of Presentation
      福岡国際会議場
    • Year and Date
      20081203-05
  • [Presentation] 4塩基コドン法によるピンポイント蛍光標識ブリオン蛋白質の作製2008

    • Author(s)
      武藤淳二
    • Organizer
      第56回日本ウイルス学会学術集会
    • Place of Presentation
      岡山コンベンションセンター
    • Year and Date
      20081026-28
  • [Presentation] 抗インフルエンザ薬の開発を目指したNucleoprotein結合化合物のスクリーニング2008

    • Author(s)
      上田敦史
    • Organizer
      第56回日本ウイルス学会学術集会
    • Place of Presentation
      岡山コンベンションセンター
    • Year and Date
      20081026-28
  • [Presentation] Theorctical study of molecular interaction in prion protein based on fragment molecular orbital method2008

    • Author(s)
      石川岳志
    • Organizer
      CBI2008
    • Place of Presentation
      National Center of Sciences Building, Hitotsubashi Memorial Hall, Tokyo
    • Year and Date
      20081022-24
  • [Presentation] Small anti-HIV compounds found with in silico screening and MTT assay2008

    • Author(s)
      Hironori K, Nakamura
    • Organizer
      CBI2008
    • Place of Presentation
      National Center of Scicnces Building, Hitotsubashi Memorial Hall, Tokyo
    • Year and Date
      20081022-24
  • [Presentation] A variety of anti-prion compounds discovered by an in silico screening based on PrPc structure : a correlation between anti-prion activity and binding affinity2008

    • Author(s)
      桑田一夫
    • Organizer
      Prion 2008
    • Place of Presentation
      Auditorium Hotel Madrid
    • Year and Date
      20081008-10
  • [Presentation] Dynamics Based Design of Anti-Prion Compounds Uncovered the Hot Spots for Prion's Pathogenic Conversion Reaction2008

    • Author(s)
      桑田一夫
    • Organizer
      EHRLICH II 2^<nd> WORLD CONFERENCE ON MAGIC BULLETS Celebrating the 100th Anniversary of the Nobel Prize Awarded to Paul Ehrlich
    • Place of Presentation
      Germany Nuernberg
    • Year and Date
      20081003-05
  • [Presentation] 大規模な化合物データベースを用いたプリオン病治療薬リード化合物の探索〜抗プリオン活性を示す多様な低分子化合物の発見2008

    • Author(s)
      武藤淳二
    • Organizer
      第146回日本獣医学会学術集会
    • Place of Presentation
      ワールドコンペンションセンターサミット(シーガイア)
    • Year and Date
      20080924-26
  • [Presentation] Thermodynamics of quantum cryptography for representation of prion2008

    • Author(s)
      桑田一夫
    • Organizer
      2008年プリオン研究会Prion Symposium 2008
    • Place of Presentation
      サホロリゾート
    • Year and Date
      20080829-30
  • [Presentation] in silicoスクリーニングによる多様な抗プリオン病リード化合物の同定2008

    • Author(s)
      武藤淳二
    • Organizer
      2008年プリオン研究会Prion Symposium 2008
    • Place of Presentation
      サホロリゾート
    • Year and Date
      20080829-30
  • [Presentation] The low-lying excited states : from identification to drug discovery2008

    • Author(s)
      鎌足雄司
    • Organizer
      22^<nd> Annual Symposium of The Protein Society
    • Place of Presentation
      Manchestr Grand Hyatt San Diego
    • Year and Date
      20080719-23
  • [Presentation] A novel evaluation scheme for anti-prion activity : Application to in silico screening2008

    • Author(s)
      中村寛則
    • Organizer
      22^<nd> Annual Symposium of The Protein Society
    • Place of Presentation
      Manchestr Grand Hyatt San Diego
    • Year and Date
      20080719-23
  • [Presentation] 部分ペプチドを用いたプリオンのアミロイド線維形成部位の系統的スクリーニング2008

    • Author(s)
      山口圭一
    • Organizer
      第72回日本生化学会中部支部例会・シンポジウム
    • Place of Presentation
      岐阜大学医学部記念会館
    • Year and Date
      2008-05-24
  • [Presentation] アミノ酸部位をピンポイント蛍光標識したプリオン蛋白質の作製2008

    • Author(s)
      武藤淳二
    • Organizer
      第72回日本生化学会中部支部例会・シンポジウム
    • Place of Presentation
      岐阜大学医学部記念会館
    • Year and Date
      2008-05-24
  • [Book] ウイルスハンドブックNo.16中枢神経系ウイルスウイルスハンドブック2008

    • Author(s)
      桑田一夫
    • Total Pages
      44-45
    • Publisher
      株式会社日本医学館
  • [Remarks]

    • URL

      http://www1.gifu-u.ac.jp/~ceid/

URL: 

Published: 2010-06-11   Modified: 2016-04-21  

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