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2008 Fiscal Year Annual Research Report

転移因子とArgonauteの軍拡競争からゲノムの進化を探る

Research Project

Project/Area Number 20221008
Research InstitutionKeio University

Principal Investigator

塩見 春彦  Keio University, 医学部, 教授 (60202107)

Keywords転位因子 / RNA サイレンシング / 小分子RNA / Argonaute / ゲノム / piRNA / 生殖幹細胞 / 脆弱X症候群
Research Abstract

小分子RNAとArgonauteタンパク質からなる複合体が関与する遺伝子発現制御(抑制)機構を総称してRNAサイレンシングと呼ぶ。ショウジョウバエには5種類のArgonauteが存在し、これらはほぼ全ての細胞で発現しているタイプ(AGOタイプ:AGO1, AGO2)と生殖細胞系で特異的に発現しているタイプ(PIWIタイプ:AGO3, Aub, Piwi)に分類される。我々はこれら5種類全てに対する特異的な」モノクローナル抗体を作製し、それらを用いて相互作用する内在性小分子RNAの同定を進めている。本年度の成果は、以下のとおりである。
1.体細胞においてAGO2は種々の転移因子に由来する小分子RNAと直接結合しており、AGO2自身が有するendonuclease活性(Slicer)により転移因子の転写産物を切断・分解することを示した。また、小分子RNAがDicer依存的に合成されることを示し、endo-siRNA(esiRNA)と命名した。以前、我々は生殖細胞系においてPIWIタイプArgonauteが転移因子に由来する小分子RNA(piRNA)と結合し、転移因子の発現を抑制することを示したが、今回の成果は体細胞においては違った種類のArgonauteと小分子RNAが転移因子の発現抑制に用いられていることを示している。
2.piRNAはesiRNAと同様に、その多くが転移因子に由来しているが、次世代シーケンサとそこから得られる大量情報の解析により、卵巣においてある転写因子(traffic jam: tj)の3'UTRに由来するpiRNAが多数存在すること、また、これらはPiwiと相互作用していることを見いだした。これらは新しいタイプのpiRNAであり、mRNA-derived piRNA(me-piRNA)と命名した。これらme-piRNAは細胞接着因子遺伝子の核酸配列と高い相補性を示し、実際、piwi変異体ではこの細胞接着因子mRNA量の増加が見られた。これはPiwi-piRNA複合体がタンパク質をコードする細胞の遺伝子の発現に関与することを示唆する最初の例である。

  • Research Products

    (27 results)

All 2009 2008 Other

All Journal Article (9 results) (of which Peer Reviewed: 9 results) Presentation (17 results) Remarks (1 results)

  • [Journal Article] On the road to reading the RNA interference code.2009

    • Author(s)
      Siomi, H., et al.
    • Journal Title

      Nature 457

      Pages: 396-404

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Fragile X carrier screening and FMRl allele distribution in the Japanese population.2009

    • Author(s)
      Otsuka, S., et al.
    • Journal Title

      Brain Dev. (in press)

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Overexpression of HMGA2 relates to reduction of the let-7 and its relationship to clinicopathological features in pituitary adenomas.2009

    • Author(s)
      Qian ZR, et al.
    • Journal Title

      Mod Pathol. 2

      Pages: 431-441

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Characterization of endogenous human Argonautes and their miRNA partners in RNA silencing.2008

    • Author(s)
      Azuma-Mukai, A., et al.
    • Journal Title

      Proc. Natl. Acad. Sci. 105

      Pages: 7964-7969

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Drosophila endogenous small RNAs bind to Argonaute2 in somatic cells.2008

    • Author(s)
      Kawamura, Y., et al.
    • Journal Title

      Nature 453

      Pages: 793-797

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Circadian phenotypes of Drosophila fragile X mutants in alternative genetic backgrounds.2008

    • Author(s)
      Sekine, T., et al.
    • Journal Title

      Zoological Science 25

      Pages: 561-571

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Interactions between transposable elements and Argonautes have (probably) been shaping the Drosophila genome throughout evolution.2008

    • Author(s)
      Siomi, H., et al.
    • Journal Title

      Curr Opin Genet Dev 18

      Pages: 181-187

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] How selfish retrotransposons are silenced in Drosophila germline andsomatic cells.2008

    • Author(s)
      Siomi, MC., et al.
    • Journal Title

      FEBS Lett. 582

      Pages: 2473-2478

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] How to define targets for small guide RNAs in RNA silencing : a biochemical approach.2008

    • Author(s)
      Siomi, MC., et al.
    • Journal Title

      Methods in Enzymology 449

      Pages: 345-355

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] RNAサイレンシングと生殖幹細胞2009

    • Author(s)
      塩見春彦
    • Organizer
      第41回ケムバイオシンポジウム
    • Place of Presentation
      東京
    • Year and Date
      2009-03-05
  • [Presentation] 小分子RNAによるゲノムの品質管理機構2009

    • Author(s)
      塩見春彦
    • Organizer
      順天堂大学第25回細胞生物学セミナー
    • Place of Presentation
      東京
    • Year and Date
      2009-01-21
  • [Presentation] Links between RNA silencing and retrotransposon suppression.2008

    • Author(s)
      H. Siomi
    • Organizer
      20^<th> FAOBMB Taipei Conference
    • Place of Presentation
      Yang-Ming University, Taiwan
    • Year and Date
      20081023-20081025
  • [Presentation] RNAi machineries that repress retrotransposons in Drosophila.2008

    • Author(s)
      H. Siomi
    • Organizer
      RiboClub 2008
    • Place of Presentation
      Sherbrooke, Quebec, Canada
    • Year and Date
      20080922-20080924
  • [Presentation] ショウジョウバエAG02に結合する内在性小分子RNAの解析2008

    • Author(s)
      塩見春彦
    • Organizer
      第10回RNAミーティング
    • Place of Presentation
      札幌
    • Year and Date
      20080723-20080725
  • [Presentation] RNAi-related pathways repress retrotransposons in germline and somatic cells in flies. (*Symposium Organizer)2008

    • Author(s)
      H. Siomi
    • Organizer
      The 21^<st> Naito Conference, Nuclear Dynamics and RNA [I]
    • Place of Presentation
      Yatsugatake, Japan
    • Year and Date
      20080624-20080627
  • [Presentation] Different types of small RNAs and Argonautes are utilized to repress retrotransposons in germline and somatic cells.2008

    • Author(s)
      H. Siomi
    • Organizer
      The 41^<st> Annual Meeting for the Japanese Society of Developmental Biologists
    • Place of Presentation
      Tokushima, Japan
    • Year and Date
      20080528-20080530
  • [Presentation] Links between RNA silencing and transposon suppression.2008

    • Author(s)
      H. Siomi
    • Organizer
      The 65^<th> KSBMB annual meeting
    • Place of Presentation
      Seoul, Korea
    • Year and Date
      20080507-20080509
  • [Presentation] Links between RNAi-related pathways and retrotransposon silencing in Drosophila.2008

    • Author(s)
      H. Siomi
    • Organizer
      National Institute of Biological Sciences
    • Place of Presentation
      Beijing, China
    • Year and Date
      2008-12-18
  • [Presentation] Links between RNAi-related pathways and retrotransposon silencing.2008

    • Author(s)
      H. Siomi
    • Organizer
      International symposium on the Expanding World of Post-transcriptional Regulation on Gene Expression at Tokyo Medical and Dental university
    • Place of Presentation
      Tokyo, Japan
    • Year and Date
      2008-12-13
  • [Presentation] RNA silencing : 核酸を標的認識分子として用いた免疫機構2008

    • Author(s)
      塩見春彦
    • Organizer
      第38回日本免疫学会学術総会
    • Place of Presentation
      京都
    • Year and Date
      2008-12-01
  • [Presentation] RNAサイレンシング : 小分子RNAが仲介する遺伝子発現制御機構2008

    • Author(s)
      塩見春彦
    • Organizer
      第18回アンチセンスシンポジウム
    • Place of Presentation
      岐阜
    • Year and Date
      2008-11-18
  • [Presentation] 小分子non-coding RNAによる転移因子の抑制2008

    • Author(s)
      塩見春彦
    • Organizer
      千里ライフサイエンスセミナー
    • Place of Presentation
      大阪
    • Year and Date
      2008-11-11
  • [Presentation] RNAサイレンシング : 小分子RNAによる遺伝子発現制御機構2008

    • Author(s)
      塩見春彦
    • Organizer
      第67回日本癌学会学術総会
    • Place of Presentation
      名古屋
    • Year and Date
      2008-10-30
  • [Presentation] 小分子RNAによる遺伝子発現制御機構 : その機能と異常2008

    • Author(s)
      塩見春彦
    • Organizer
      発生工学・疾患モデル研究会第70回定例会
    • Place of Presentation
      東京
    • Year and Date
      2008-09-10
  • [Presentation] RNAi分子経路とレトロトランスポゾン抑制経路との関連(*ワークショップオーガナイザー)2008

    • Author(s)
      塩見春彦
    • Organizer
      日本遺伝学会第80回大会
    • Place of Presentation
      名古屋
    • Year and Date
      2008-09-04
  • [Presentation] 内在性小分子RNAによる転移因子の抑制2008

    • Author(s)
      塩見春彦
    • Organizer
      第20回高遠シンポジウム
    • Place of Presentation
      高遠、長野
    • Year and Date
      2008-08-21
  • [Remarks]

    • URL

      http://web.sc.itc.keio.ac.jp/dmb/sindex.html

URL: 

Published: 2010-06-11   Modified: 2016-04-21  

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