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2012 Fiscal Year Annual Research Report

転移因子とArgonauteの軍拡競争からゲノムの進化を探る

Research Project

Project/Area Number 20221008
Research InstitutionKeio University

Principal Investigator

塩見 春彦  慶應義塾大学, 医学部, 教授 (60202107)

Project Period (FY) 2008-05-12 – 2013-03-31
Keywords転移因子 / 小分子RNA / RNAi / RNAサイレンシング / ゲノム進化 / エピゲネティクス / 生殖細胞 / 生殖幹細胞
Research Abstract

RNAサイレンシングによる転移因子の抑制機構を理解するため、ショウジョウバエをモデル動物として用い解析を進めた。特に生殖細胞特異的なRNAサイレンシング経路であるPiwi-piRNA経路の解析を進め、その結果、以下の成果を得た。
1. piRNA生合成には2つの経路(primary processingとping-pong cycle)が存在する。primary processing経路はDicerに依存しないが、この経路において直接piRNA前駆体のプロセッシングに関与する因子は不明であった。primary processing経路におけるpiRNA前駆体の切断酵素(Zucchini)を同定し、その構造を解明した。Zucchiniは2量体を形成し、その境界面に1つの活性中心が形成される。また、この活性中心の溝は2本鎖RNAには狭すぎるが、1本鎖RNAがはまり込むのには充分の幅がある。生化学的解析から、実際、Zucchiniが1本鎖特異的なエンドヌクレアーゼであることを示した。さらに、活性中心のアミノ酸変異によりこの1本鎖RNA切断活性が失わた。卵巣由来の培養細胞(OSC)を用い、RNAiにてZucchiniをノックダウンするとpiRNA前駆体の蓄積がみられ、一方、転移因子の発現が上昇した。Zucchiniがミトコンドリア膜状に局在し、piRNAの成熟の場であるYb bodyの形成に必須であることを示し、ミトコンドリアとpiRNA生合成との関連を見いだした。
2. piRNA経路による転移因子の抑制には転写(核内)及び転写後(細胞質)レベルの2種類の抑制機構が存在するが、Piwi-piRNA複合体は細胞質で形成され、その後、核に移行し、転写レベルで転移因子の抑制に働く。Piwiをノックダウンした際、Pol IIの転移因子領域への蓄積(pol II ChIP)が見られた。

Current Status of Research Progress
Reason

24年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

24年度が最終年度であるため、記入しない。

  • Research Products

    (12 results)

All 2013 2012

All Journal Article (3 results) (of which Peer Reviewed: 3 results) Presentation (7 results) (of which Invited: 6 results) Book (2 results)

  • [Journal Article] Roles of R2D2, a cytoplasmic D2 body component, in the endogenous siRNA pathway in Drosophila.2013

    • Author(s)
      Nishida, KM.
    • Journal Title

      Molecular Cell

      Volume: 49 Pages: 680-691

    • DOI

      doi: 10.1016/j.molcel.2012.12.024

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Structure and function of Zucchini endoribonuclease in piRNA biogenesis.2012

    • Author(s)
      Nishimasu, H.
    • Journal Title

      Nature

      Volume: 491 Pages: 284-287

    • DOI

      doi: 10.1038/nature11509

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Biology of PIWI-interacting RNAs: new insights into biogenesis and function inside and outside of germlines2012

    • Author(s)
      Ishizu, H
    • Journal Title

      Genes and Development

      Volume: 26 Pages: 2361-2373

    • DOI

      doi: 10.1101/gad.203786.112

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] Small RNA-mediated transposon silencing2013

    • Author(s)
      H. Siomi
    • Organizer
      Radiation Effects research Foundation, International Workshop: RERF Radiation Research in the Post-genome Era
    • Place of Presentation
      Hiroshima, Japan
    • Year and Date
      20130307-20130308
    • Invited
  • [Presentation] piRNA biogenesis in the Drosophila ovary.2012

    • Author(s)
      H. Siomi
    • Organizer
      Cell Symposia: Functional RNAs
    • Place of Presentation
      Sitges, Spain
    • Year and Date
      20121202-04
  • [Presentation] Transposon silencing mediated by germline-specific small RNAs (piRNAs) in Drosophila.2012

    • Author(s)
      H. Siomi
    • Organizer
      The 84th annual Meeting of the Genetics Society of Japan, Symposium: “Epigenomic regulation of cell fate determination and homeostasis”
    • Place of Presentation
      Fukuoka, Japan
    • Year and Date
      20120924-20120925
    • Invited
  • [Presentation] piRNA-mediated silencing of transposable elements in the Drosophila ovary2012

    • Author(s)
      H. Siomi
    • Organizer
      The 63rd Fujihara Seminar, “A new horizon of retroposon research”
    • Place of Presentation
      Kyoto, Japan
    • Year and Date
      20120803-20120805
    • Invited
  • [Presentation] Maelstrom functions in both transposon silencing and microtubule organization in the Drosophila ovary2012

    • Author(s)
      H. Siomi
    • Organizer
      The 22nd CDB meeting, RNA sciences in cell and developmental biology II
    • Place of Presentation
      Kobe, Japan
    • Year and Date
      20120611-20120613
    • Invited
  • [Presentation] Small RNA-mediated silencing of transposable elements in the Drosophila ovary2012

    • Author(s)
      H. Siomi
    • Organizer
      Joint meeting of the 45th annual meeting of the Japanese Society of Developmental Biologists & the 64th annual meeting of the Japan Society for Cell Biology
    • Place of Presentation
      Kobe, Japan
    • Year and Date
      20120528-20120531
    • Invited
  • [Presentation] Biogenesis of PIWI-interaction RNAs nd transposon silencing in Drosophila2012

    • Author(s)
      H. Siomi
    • Organizer
      The 3rd Shanghai International Conference of Epigenetics in Development and Diseases/The 7th Annual Conference of Asian Epigenome Alliance/Genome Medicine Workshop on Epigenetic (-moic)s in Diseases
    • Place of Presentation
      Shanghai, China
    • Year and Date
      20120419-20120422
    • Invited
  • [Book] Trinucleotide Repeat Protocols (Methods in Molecular Biology)2013

    • Author(s)
      Miyoshi, K
    • Total Pages
      10
    • Publisher
      Springer
  • [Book] PIWI proteins and their Slicer activity in piRNA biogenesis and transposon silencing. The Enzymes Vol. 32: Part B: RNA endonucleases in RNAi and microRNA metabolism and their partners2012

    • Author(s)
      Sato, K
    • Total Pages
      25
    • Publisher
      Elsevier

URL: 

Published: 2014-07-24  

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