2010 Fiscal Year Self-evaluation Report
Integrated analysis of transcriptional regulation in cancer
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20221009
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| Research Category |
Grant-in-Aid for Scientific Research (S)
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| Allocation Type | Single-year Grants |
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| Research Field |
Applied genomics
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| Research Institution | The University of Tokyo |
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Principal Investigator |
ABURATANI Hiroyuki The University of Tokyo, 先端科学技術研究センター, 教授 (10202657)
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| Project Period (FY) |
2008 – 2012
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| Keywords | 機能ゲノミクス / ゲノム / エピゲノム / がん |
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| Research Abstract |
細胞が癌化するプロセスにおいて種々の遺伝子あるいはゲノム変異が蓄積し、転写ネットワークの制御に破綻を生じる。
多重な転写制御系を理解するためには、それぞれの転写因子およびその複合体のゲノム上での局在、クロマチン構造の変化、転写活性の多様性を測定し、転写応答にどのように反映されるかを解析する。
(1)染色体機能解析
1.シストローム解析
2.エピゲノム解析
3.転写産物解析(トランスクリプトーム)
(2)ゲノム多様性に基づく転写制御領域同定
(3)転写制御ネットワークの統合解析
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[Journal Article] Tissue-specific emethylation in CpG-poor promoters during cellular differentiation.2011
Author(s)
Nagae G, Isagawa T, Shiraki N, Fujita T, Yamamoto S, Tsutsumi S, Nonaka A, Yoshiba S, Matsusaka K, Midorikawa Y, Ishikawa S, Soejima H, Fukayama M, Suemori H, Nakatsuji N, Kume S, Aburatani H.
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Journal Title
Hum Mol Genetics accepted
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[Journal Article] Genome-wide single nucleotide polymorphism arrays in endometrial carcinomas associate extensive chromosomal instability with poor prognosis and unveil frequent chromosomal imbalances involved in P13-kinase pathway.2010
Author(s)
Murayama-Hosokawa S, Oda K, Nakagawa S, Ishikawa S, Yamamoto S, Shoji K, Ikeda Y, Uehara Y, Fukayama M, McCormick F, Yano T, Taketani Y, Aburatani H.
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Journal Title
Oncogene 29(13)
Pages: 1897-1908
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[Journal Article] PH domain-only protein PHLDA3 is a p53-regulated repressor of Akt.2009
Author(s)
Kawase T, Ohki R, Shibata T, Tsutsumi S, Kamimura N, Inazawa J, Ohta T, Ichikawa H, Aburatani H, Tashiro F, Taya Y.
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Journal Title
Cell 136(3)
Pages: 535-550
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[Journal Article] High-resolution haracterization of a patocellular carcinoma genome.
Author(s)
Totoki Y, Tatsuno K, Yamamoto S, Arai Y, Hosoda F, Ishikawa S, Tsutsumi S, Sonoda K, Totsuka H, Shirakihara T, Sakamoto H, Wang L, Ojima H, Shimada K, Kosuge T, Okusaka T, Kato K, Kusuda J, Yoshida T, Aburatani H, Shibata T.
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Journal Title
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