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2012 Fiscal Year Annual Research Report

アクチンフィラメントの構造と動態:特にカルシウム調節のメカニズムの解明

Research Project

Project/Area Number 20227008
Research InstitutionNagoya University

Principal Investigator

前田 雄一郎  名古屋大学, 理学(系)研究科(研究院), 特任教授 (10321811)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 成田 哲博  名古屋大学, 理学(系)研究科(研究院), 助教 (30360613)
Project Period (FY) 2008-06-04 – 2013-03-31
Keywordsアクチン / アクチンフィラメント / アクチンのトレッドミリング / 筋収縮のカルシウム調節 / トロポニン / 遺伝性心疾患 / X線繊維回折 / 高分解能構造解析
Research Abstract

アクチン線維の構造と動態の研究で、H23年度より取り組んできた新規課題で多くの進展があった(一部はH24年度中に論文として発表した)。(1)複合体の構造を解明する研究:アクチン/ コフィリン線維の電子顕微鏡構造解析では、単粒子解析法を用いて近原子分解能(4A程度)の構造が得られ、分子間のループ・ループ間接触の詳細の解明が可能となった。アクチン・トロポミオシン・トロポニン複合体の電子顕微鏡構造解析では、試料調製法と画像解析法の改良によってトロポミオシンとトロポニン分子の位置と形態が区別可能となった。(2)アクチン線維キャッピング蛋白質 (CP) の多層的調節メカニズムの研究では、2種のペプチド(CARMILペプチドと twinfilinのC36ペプチド) とCPの複合体の結晶構造を解明した。CPに前者が結合するとCPをアクチン線維から解離させるが、後者は解離させない。しかも双方のCPへの結合は拮抗的である。これは双方のCP上の結合部位が、共にCP/アクチン結合部位とは異なり(アロステリックであり)、互いに部分的に重複していることに因る。計算科学およびNMRの専門家と共同で、双方のペプチド結合がCPに異なる作用を及ぼす理由の探究を開始した。(3)細胞内のアクチン線維網目構造の解析: 細胞内では蛋白質相互間に働く力が希薄溶液であるin vitro条件とは異なる。よって細胞内のアクチン線維の構造解明は重要である。ウィーンのSmallたちと共同して電子顕微鏡トモグラフィー法とその写真解析法を確立し、細胞内葉状仮足を形成するアクチン重合体の極性を決定する方法を確立し、ほとんどの重合体がB端を膜に向けていることを確認した(2012, J.Mol.Biol)。またArp2/3複合体が形成するアクチン重合体分岐構造を同定し、その分布を明らかにした (2012, J.Cell Sci)。

Current Status of Research Progress
Reason

24年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

24年度が最終年度であるため、記入しない。

  • Research Products

    (18 results)

All 2013 2012 Other

All Journal Article (6 results) (of which Peer Reviewed: 6 results) Presentation (11 results) (of which Invited: 2 results) Remarks (1 results)

  • [Journal Article] "Physicochemical analysis from real-time imaging of liposome tubulation reveals the characteristics of individual F-BAR domain proteins2013

    • Author(s)
      Takiguchi Kingo
    • Journal Title

      Langmuir.

      Volume: 8;29(1) Pages: 328-36

    • DOI

      10.1021/la303902q

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Direct determination of actin polarity in the cell2012

    • Author(s)
      Narita Akihiro
    • Journal Title

      J.Mol.Biol.

      Volume: 419 Pages: 359-68

    • DOI

      10.1016/j.jmb.2012.03.015

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Actin Branching in the initiation and maintenance of lamellipodia2012

    • Author(s)
      Vinzenz M
    • Journal Title

      J.Cell Science

      Volume: 125(11) Pages: 3775-85

    • DOI

      10.1242/jcs.107623

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] A novel actin-like filament structure from Clostridium tetani2012

    • Author(s)
      Narita Akihiro
    • Journal Title

      J. Biol.Chem

      Volume: 287(25): Pages: 21121-9

    • DOI

      10.1074/jbc.M112.341016

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Microtubule-like properties of the bacterial actin homolog ParM-R12012

    • Author(s)
      Narita Akihiro
    • Journal Title

      J. Biol.Chem

      Volume: 287(44) Pages: 37078-88

    • DOI

      10.1074/jbc.M111.319491

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Role of the actin A108-P112 loop in the polymerization and ATPase activities2012

    • Author(s)
      Iwasa Mitsusada
    • Journal Title

      J. Biol.Chem

      Volume: 287(52) Pages: 43270-6

    • DOI

      J. Biol.Chem

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] Inhibitation mechanism of actin capping protein by phosphatidylinositol bisphosphate2012

    • Author(s)
      Kato Fumika
    • Organizer
      第35回日本分子生物学会年会
    • Place of Presentation
      マリンメッセ福岡(福岡県)
    • Year and Date
      20121211-20121214
  • [Presentation] 分子ロボティクス---感覚と知能を備えた分子ロボットの創成---プロジェクト紹介「分子ロボットの運動」2012

    • Author(s)
      小林 聡
    • Organizer
      SSI2012講演会
    • Place of Presentation
      ウィル愛知(愛知県)
    • Year and Date
      20121123-20121123
  • [Presentation] 裏打ち蛋白質の添加による脂質二重膜内に形成されたドメインの安定化2012

    • Author(s)
      山田 駿介
    • Organizer
      「細胞を創る」研究会5.0
    • Place of Presentation
      東京工業大学(神奈川県)
    • Year and Date
      20121121-20121122
  • [Presentation] Conformational and energetic cycle of actin in polymerization and depolymerization2012

    • Author(s)
      Maeda Yuichiro
    • Organizer
      EMBO-FEBS Lecture Course, Novel Biophysical Approaches in the Investigation of the Cytoskeleton, The 27th European Cytoskeleton Forum Meeting
    • Place of Presentation
      Hotel Platinus Pecs(Hungary)
    • Year and Date
      20121103-20121107
    • Invited
  • [Presentation] 分子動力学法によるcapping protein(CP)の動的構造の解析 Structural fluctuations of capping proteins analyzed by molecular dynamics simulations"2012

    • Author(s)
      Koike R.
    • Organizer
      第50回日本生物物理学会
    • Place of Presentation
      名古屋大学(愛知県)
    • Year and Date
      20120922-20120924
  • [Presentation] 精製タンパク質の構造から in situ の構造まで:電顕を利用して From purified protein structures in situ structures using EM2012

    • Author(s)
      Miyazaki N.
    • Organizer
      第50回日本生物物理学会
    • Place of Presentation
      名古屋大学(愛知県)
    • Year and Date
      20120922-20120924
  • [Presentation] アクチン様トレッドミリングモータが満たすべき最小条件 Minimum requirements for the achin-like treadmilling motor system2012

    • Author(s)
      成田 哲博
    • Organizer
      第50回日本生物物理学会
    • Place of Presentation
      名古屋大学(愛知県)
    • Year and Date
      20120922-20120924
  • [Presentation] STEMトモグラフィー法を用いた細菌及び真核細胞内超分子複合体の可視化 Structural visualization of supramolecules in bacterial and eukaryotic cells using STEM tomography2012

    • Author(s)
      小池 雅文
    • Organizer
      第50回日本生物物理学会
    • Place of Presentation
      名古屋大学(愛知県)
    • Year and Date
      20120922-20120924
  • [Presentation] F-BARによるリポソームのチューブレーションのリアルタイム観察 Real-time observation of liposome by F-BAR2012

    • Author(s)
      瀧口 陽子
    • Organizer
      第50回日本生物物理学会
    • Place of Presentation
      名古屋大学(愛知県)
    • Year and Date
      20120922-20120924
  • [Presentation] 構造解析から迫るアクチンフィラメント動態Structural analysis of the actin filament in vitro and vivo2012

    • Author(s)
      成田 哲博
    • Organizer
      日本顕微鏡学会第68回学術講演会
    • Place of Presentation
      つくば国際会議場(茨城県)
    • Year and Date
      20120514-20120516
    • Invited
  • [Presentation] 重合能を持つ蛋白質の結合が膜ドメインの形成に与える影響の支持平面二重膜を用いた直接間接2012

    • Author(s)
      山田 駿介
    • Organizer
      日本膜学会第34回年会
    • Place of Presentation
      早稲田大学(東京都)
    • Year and Date
      20120507-20120509
  • [Remarks] 名古屋大学構造生物学研究センター

    • URL

      http://str.bio.nagoya-u.ac.jp:8080/Plone

URL: 

Published: 2014-07-24  

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