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2010 Fiscal Year Annual Research Report

ゲノムデータからの予測・発見・推論の統合化のための統計学と機械学習の融合

Research Project

Project/Area Number 20240028
Research InstitutionThe Institute of Statistical Mathematics

Principal Investigator

江口 真透  統計数理研究所, 数理・推論研究系, 教授 (10168776)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 栗木 哲  統計数理研究所, 数理・推論研究系, 教授 (90195545)
藤澤 洋徳  統計数理研究所, 数理・推論研究系, 准教授 (00301177)
逸見 昌之  統計数理研究所, 数理・推論研究系, 助教 (80465921)
小森 理  統計数理研究所, 予測発見戦略センター, 特任研究員 (60586379)
松浦 正明  (財)癌研究会, ゲノムセンター情報解析部門, 部門長 (40173794)
Keywordsゲノムデータ / 予測 / 機械学習 / パタン認識 / 高次元標本
Research Abstract

遺伝子多様性から本質的に起因する統計的課題:p ≫ n問題の解決するために多方面にわたる研究を行った.特に単一の遺伝子にだけに着目してその発現量と表現形との関連を調べるアプローチと,複数の遺伝子発現データを結合させて予測するアプローチを融合的発展させることに成功した.実際の個人化医療につなげる予測スコアーの具体化について一定の道筋がついた.その統計理論の整合及び,実際に国立がんセンターや三菱化学技術化学センターとの共同研究を通して経験を積み重ねた.
○4月にNational Taiwan Universityにおいて「Tutorial Workshop on Learning with Information Divergence Geometry」で講義を行い,数学研究科,情報科学研究科の大学院生に機械学習と統計学の適切な理解を提供して,融合的発展をさせる能力を備えることの動機付けを与える.
○6月の末からプラハに於いて開催されるICORS (International Conference on Robust Statistics)2010に出席して,教師なし学習のためのブースティング法について招待講演を行った.
○8月にライプチヒに於いて開催されるIGAIA (Information Geometry and its Applications) IIIについて情報幾何の立場から教師なし学習のためのブースティング法の幾何的な構造について招待講演を行った.
○11月に当研究所が招聘するジョン・コーパス教授(ウォーリック大学)と観察研究の統計推測とメタアナリシスについて集中的な考察・検討を行った.

  • Research Products

    (17 results)

All 2010

All Journal Article (4 results) (of which Peer Reviewed: 4 results) Presentation (13 results)

  • [Journal Article] A boosting method for maximizing the partial area under the ROC curve.2010

    • Author(s)
      O.Komori, S.Eguchi
    • Journal Title

      BMC Bioinformatics

      Volume: 11:314(online)

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] AUC maximization method in credit scoring.2010

    • Author(s)
      K.Miura, S.Yamashita, S.Eguchi
    • Journal Title

      J.Risk Model Validation

      Volume: 4,2 Pages: 3-25

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Robust extraction of local structures by the minimum beta-divergence method.2010

    • Author(s)
      N.H.Mollah, N.Sultana, M.Minami, S.Eguchi
    • Journal Title

      Neural Networks

      Volume: 23,2 Pages: 226-238

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Maximum regularized likelihood estimator of finite mixtures with a structural model.2010

    • Author(s)
      S.Eguchi, K.Yoshioka
    • Journal Title

      Communications in Statistics

      Volume: 39:8 Pages: 1498-1510

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] A Statistical Method for the Partial Area under the ROC Curve2010

    • Author(s)
      Osamu Komori, Shinto Eguchi
    • Organizer
      25^<th> International Biometric Conference
    • Place of Presentation
      Florianopolis, Brazil
    • Year and Date
      2010-12-07
  • [Presentation] Beyond maximum likelihood-towards new data analyzer-2010

    • Author(s)
      江口真透
    • Organizer
      The Applied Statistics Workshop 2010
    • Place of Presentation
      東京大学大学院経済学研究科小島ホール(招待講演)
    • Year and Date
      2010-10-29
  • [Presentation] Boosting for Maximization of the Partial Area under the ROC Curve2010

    • Author(s)
      小森理, 江口真透
    • Organizer
      統計モデルによる現象の解析,並びにその基礎理論
    • Place of Presentation
      山形テルサ 山形
    • Year and Date
      2010-10-23
  • [Presentation] Information geometry, statistics, and machine learning, Mathematical Sciences and Their Applications2010

    • Author(s)
      Shinto Eguchi
    • Organizer
      Mathematical Sciences and Their Applications
    • Place of Presentation
      上諏訪,長野(招待講演)
    • Year and Date
      2010-10-01
  • [Presentation] ロバストなサポートベクターマシンのクラス2010

    • Author(s)
      江口真透
    • Organizer
      統計関連学会連合大会
    • Place of Presentation
      早稲田大学 東京
    • Year and Date
      2010-09-08
  • [Presentation] ブースティングによる混合モデルの推定2010

    • Author(s)
      小森理, 江口真透
    • Organizer
      統計関連学会連合大会
    • Place of Presentation
      早稲田大学 東京
    • Year and Date
      2010-09-06
  • [Presentation] U-entropy and maximum entropy model2010

    • Author(s)
      Shinto Eguchi
    • Organizer
      Information Geometry and its Applications III
    • Place of Presentation
      Leipzig, Germany(招待講演)
    • Year and Date
      2010-08-02
  • [Presentation] 内部格付手法における回収率・期待損失率推計の統計モデル2010

    • Author(s)
      山下智志, 三浦翔, 江口真透
    • Organizer
      JAFEE 2010夏季大会
    • Place of Presentation
      成城大学
    • Year and Date
      2010-07-29
  • [Presentation] Boosting finite mixture model2010

    • Author(s)
      Shinto Eguchi
    • Organizer
      International Conference on Robust Statistics 2010
    • Place of Presentation
      Prague, Czech Republic(招待講演)
    • Year and Date
      2010-06-29
  • [Presentation] Boosting leaning algorithm and U-loss functions I and II2010

    • Author(s)
      Shinto Eguchi, Osamu Komori
    • Organizer
      Tutorial Workshop on Learning with Information Divergence Geometry
    • Place of Presentation
      National Taiwan University, Taipei, Taiwan(招待講演)
    • Year and Date
      2010-04-25
  • [Presentation] Pattern recognition from genome and omics data2010

    • Author(s)
      Osamu Komori, Shinto Eguchi
    • Organizer
      Tutorial Workshop on Learning with Information Divergence Geometry
    • Place of Presentation
      National Taiwan University, Taipei, Taiwan(招待講演)
    • Year and Date
      2010-04-25
  • [Presentation] Information divergence class and robust statistical methods I, II2010

    • Author(s)
      Shinto Eguchi, Osamu Komori
    • Organizer
      Tutorial Workshop on Learning with Information Divergence Geometry
    • Place of Presentation
      National Taiwan University, Taipei, Taiwan(招待講演)
    • Year and Date
      2010-04-24
  • [Presentation] Information geometry on model uncertainty2010

    • Author(s)
      Shinto Eguchi, Osamu Komori
    • Organizer
      Tutorial Workshop on Learning with Information Divergence Geometry
    • Place of Presentation
      National Taiwan University, Taipei, Taiwan(招待講演)
    • Year and Date
      2010-04-24

URL: 

Published: 2012-07-19  

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