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2011 Fiscal Year Annual Research Report

分子マーカーによる動物プランクトン初期幼生の判別・自動計測と生態学的研究への応用

Research Project

Project/Area Number 20241003
Research InstitutionThe University of Tokyo

Principal Investigator

津田 敦  東京大学, 大気海洋研究所, 教授 (80217314)

Keywords分子マーカー / 動物プランクトン / 自動計測 / 生物海洋 / 環境計測 / 初期生活史
Research Abstract

昨年までに開発したReal time PCRに用いるNeocalanus plumchrus, N.flemingeriを目標としたプローブ・プライマーセットを用いることによって、今まで形態分類では種判別ができなかったが、群集から2種を判別することを可能にした。しかし、学会発表等で、種判別の基準が、抽出したDNA量依存であるとの指摘を受け、その対策を検討した。解決策としては、DNAを抽出した溶液のDNA濃度を測定し、リアルタイムPCRにおけるCt値との関係式を得て、関係式からの偏差を基準として種判別する方法を開発した。この手法によって、より正確な種判別が可能となった。新しい手法で種判別を行った結果は昨年得たものと同様であり、N.plumchrusでは、1月までは後期幼生が出現せず、ノープリウスIII期幼生が季節とともに増加し、3月に少数の後期幼生が観察された。すなわち、N.plumchrusはノープリウスIII期幼生で、成長を停滞(休眠)させ、あるトリガーで時間的に同期し成長を再開させることが明らかとなった。さらに今年度は、ノープリウス幼生だけでなく、雌成体の分析も行った結果、N.plumchrusは10月には1000m以深の深層で産卵し、ノープリウス幼生もこの深度に分布するが、季節の冬から春にかけては親の分布深度が200-500m程度に浅くなることが明らかとなった。ノープリウス幼生は産卵深度にほぼ留まると考えられ、結果としてノープリウス幼生分布範囲は、季節が進むと深層から200mまでと幅広くなることが明らかとなった。これに対して、N.flemingeriにおいても、成体雌の分布深度の季節に伴う浅化は観察され、秋から冬の分布深度は主に200-500mであるが、産卵盛期の2-3月では200m以浅に分布産卵していることが示唆された。
また、イメージングフローサイトメーター(FlowCAM)を用いた微小動物プランクトンの定量化を試み、濃縮方法と測定条件の検討を行い、白鳳丸航海で繊毛虫を対象として定量測定を実施した。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

当初、予定していたイメージングフローサイトメーターによる、自動測定は実現していないが、リアルタイムPCRを用いた種同定法は完成し、従来法では得られない生態学的知見が、次々と明らかになっている。

Strategy for Future Research Activity

当初の計画通りに滞りなく研究を進める。

  • Research Products

    (16 results)

All 2012 2011

All Journal Article (5 results) (of which Peer Reviewed: 4 results) Presentation (11 results)

  • [Journal Article] Increase of mineral dust particles in the surface waters of the northwestern North Pacific during an Asian dust event2011

    • Author(s)
      Iwamoto, Y.
    • Journal Title

      Geophysical Research Letter

      Volume: 38

    • DOI

      doi:10.1029/2010GL045906

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Major phylogenetic groups of marine bacteria differ in growth response to natural phytoplankton blooms in the western North Pacific2011

    • Author(s)
      Tada, Y.
    • Journal Title

      Applied and Environmental Microbiology

      Volume: 77 Pages: 4055-4065

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Morphological characters for practical identification of the copepodite stages of three sympatric Calanus species in the western North Pacific2011

    • Author(s)
      Nonomura, T
    • Journal Title

      Journal of Plankton Research

      Volume: 33 Pages: 1496-1509

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Life history of Eucalanus californicus Johnson (Copepoda : Clanoida) in the northwestern Pacific Ocean2011

    • Author(s)
      Shimode, S.
    • Journal Title

      Progress in Oceanography

      Volume: 96 Pages: 1-13

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] 夏季オホーツク西部海域における動物プランクトンの分布-クリオネの起源を追って-2011

    • Author(s)
      津田敦
    • Journal Title

      海洋と生物

      Volume: 34 Pages: 25-33

  • [Presentation] 亜寒帯北太平洋における動物プランクトンを中心とした低次生態系の動態に関する研究2012

    • Author(s)
      津田敦
    • Organizer
      日本海洋学会春季大会
    • Place of Presentation
      筑波大学(茨城県)(招待講演)
    • Year and Date
      2012-03-28
  • [Presentation] カイアシ類Neocalanus plumchrusの親潮域における初期生活史2012

    • Author(s)
      藤岡秀文
    • Organizer
      日本海洋学会春季大会
    • Place of Presentation
      筑波大学(茨城県)
    • Year and Date
      2012-03-26
  • [Presentation] 岩手県大槌湾における動物プランクト群集の津波による影響2012

    • Author(s)
      伊佐見啓
    • Organizer
      日本海洋学会春季大会
    • Place of Presentation
      筑波大学(茨城県)
    • Year and Date
      2012-03-26
  • [Presentation] 亜熱帯太平洋におけるEucalanidae科カイアシ類の成長に伴う鉛直移動と生活史戦略2011

    • Author(s)
      下出信次
    • Organizer
      東京大学大気海洋研究所共同利用研究集会、亜熱帯太平洋のプランクトン生態系および物質循環に関する比較海洋学
    • Place of Presentation
      東京大学農学部(東京都)
    • Year and Date
      2011-11-25
  • [Presentation] ITS2-28S rDNA配列による亜熱帯性カラヌス目カイアシ類の種同定と展望2011

    • Author(s)
      平井惇也
    • Organizer
      東京大学大気海洋研究所共同利用研究集会、亜熱帯太平洋のプランクトン生態系および物質循環に関する比較海洋学
    • Place of Presentation
      東京大学農学部(東京都)
    • Year and Date
      2011-11-25
  • [Presentation] Neocalanus and Calanus copepods in the western North Pacific, their distribution and life histories2011

    • Author(s)
      Tsuda, A
    • Organizer
      6th ADOES Workshop
    • Place of Presentation
      Qindao、China
    • Year and Date
      2011-11-18
  • [Presentation] 2009年夏季のアリューシャン列島周辺海域における動物プランクトン群集の時空間変動2011

    • Author(s)
      齋藤類
    • Organizer
      日本海洋学会2011年度秋季大会
    • Place of Presentation
      福岡、九州大学(福岡県)
    • Year and Date
      2011-09-25
  • [Presentation] 浮遊性カイアシ類Neocalanus属とCalanus属の分布特性と生活史2011

    • Author(s)
      下出信次
    • Organizer
      2011年度日本ベントス学会・日本プランクトン学会合同大会
    • Place of Presentation
      高知大学(高知県)
    • Year and Date
      2011-09-03
  • [Presentation] DNAシークエンスによる亜熱帯性Calanoidaカイアシ類の種同定技術の開発と展望2011

    • Author(s)
      平井惇也
    • Organizer
      2011年度日本ベントス学会・日本プランクトン学会合同大会
    • Place of Presentation
      高知大学(高知県)
    • Year and Date
      2011-09-03
  • [Presentation] Comparative study of the life histories of Eucalanidae copepods in the subtropical and subarctic Pacific2011

    • Author(s)
      Tsuda. A.
    • Organizer
      ESSAS Open Science Meeting
    • Place of Presentation
      Seattle, USA
    • Year and Date
      2011-05-21
  • [Presentation] Neocalanus vs. Calanus oceans. Comparative study on the life histories of Neocalanus and Calanus copepods, and their global distribution2011

    • Author(s)
      Tsuda. A.
    • Organizer
      ESSAS Open Science Meeting
    • Place of Presentation
      Seattle, USA
    • Year and Date
      2011-05-20

URL: 

Published: 2013-06-26  

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