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2009 Fiscal Year Annual Research Report

海洋で繰り広げられるウイルス対宿主の分子生態学的チェイスゲームに関する研究

Research Project

Project/Area Number 20247002
Research InstitutionFisheries Research Agency

Principal Investigator

長崎 慶三  Fisheries Research Agency, 瀬戸内海区水産研究所赤潮環境部, 室長 (00222175)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 外丸 裕司  独立行政法人 水産総合研究センター, 瀬戸内海区水産研究所赤潮環境部, 研究員 (10416042)
福山 恵一  大阪大学, 大学院・理学研究科, 教授 (80032283)
和田 啓  大阪大学, 大学院・理学研究科, 助教 (80379304)
KeywordsRNAウイルス / 渦鞭毛藻 / 宿主特異性 / レアコドン / コートタンパク質 / タンパク質発現系 / 共進化 / ヘテロカプサ・サーキュラリスカーマ
Research Abstract

赤潮原因藻ヘテロカプサ・サーキュラリスカーマ株とを宿主とするプラス鎖RNAウイルスHcRNAV株のコートタンパク質遺伝子を大腸菌で発現させたところ、目的タンパク質は不溶性の融合タンパク質として発現された。そこで、SDS-PAGEで分離したコートタンパク質を電気的にゲルから抽出し、さらに有機溶媒で脱SDS化およびリフォールディングを試みることで、可溶性コートタンパク質の精製に最終的に成功した。精製したコートタンパク質の分子サイズは、動的光散乱法では粒径分布20~50nmと推算され、ウイルス様粒子を再構成している可能性が示唆された。現在、この粒子の形状を電子顕微鏡で精査するとともに、収量の向上を試みている。また現在、得られた発現タンパク質をウサギに対して接種することで得られた抗血清の活性・特異性について測定中である。さらに、これまでにウイルス感受性という点で大きく異なると考えられてきたUA型およびCY型のヘテロカプサ株の両方に感染するウイルス株を探索した結果、従来株とは異なる感染特異性を持つHcRNAV群の存在が明らかとなった。すなわち、大まかに言うとHcRNAVは少なくともCY型とUA型の2タイプから構成され、さら細かくみるとUA型は3群(以上)に分けられる可能性が示唆された。これらの結果は、現場環境中のヘテロカプサとウイルスの関係が従来考えられていたものよりもかなり複雑である可能性を示す重要な知見である。今後、これら計4群のコートタンパク質のアミノ酸配列、さらに立体構造を推定・比較することで、ウイルス対宿主の進化的チェイスゲームに関する新たな知見が得られるものと期待される。

  • Research Products

    (13 results)

All 2010 2009 Other

All Journal Article (3 results) (of which Peer Reviewed: 3 results) Presentation (9 results) Remarks (1 results)

  • [Journal Article] Virus resistance of the bloom-forming dinoflagellate Heterocapsa circularisquama to its single-stranded RNA virus infection2009

    • Author(s)
      Tomaru, Y., Mizumoto, H., Nagasaki, K.
    • Journal Title

      Environ.Microbiol. 11

      Pages: 2915-2923

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Co-occurrence of DNA- and RNA-viruses infecting the bloom-forming dinoflagellate, Heterocapsa circularisquama, on the Japan coast2009

    • Author(s)
      Tomaru, Y., Takao, Y., Mizumoto, H., Nagasaki, K.
    • Journal Title

      Plankton Benthos Res. 4

      Pages: 129-134

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] 近年の原生生物ウイルス研究がもたらした新しい知見―分子生態学・分類学から分子進化学まで―2009

    • Author(s)
      長崎慶三・外丸裕司
    • Journal Title

      ウイルス 59

      Pages: 31-36

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] 原生生物の寄生・共生者(ウイルスを中心に)2010

    • Author(s)
      長崎慶三・外丸裕司
    • Organizer
      2010年春 日本プランクトン学会シンポジウム「原生生物の多様性と生態的機能」
    • Place of Presentation
      東京海洋大学
    • Year and Date
      2010-03-30
  • [Presentation] 渦鞭毛藻感染性ウイルスHcDNAVと既知ウイルス群との系統学的比較2010

    • Author(s)
      長崎慶三・豊田健介・中山奈津子・外丸裕司・白井葉子・Jean-Michel Claverie・緒方博之
    • Organizer
      日本藻類学会第34回大会
    • Place of Presentation
      筑波大学
    • Year and Date
      2010-03-20
  • [Presentation] The ocean is a treasury of strange viruses2009

    • Author(s)
      長崎慶三, 豊田健介, 中山奈津子, 緒方博之, Claverie, J.M., 外丸裕司
    • Organizer
      International Symposium on Marine Genomics 2009
    • Place of Presentation
      沖縄サザンプラザ海邦
    • Year and Date
      2009-12-17
  • [Presentation] 渦鞭毛藻ウイルス研究の最前線2009

    • Author(s)
      長崎慶三・外丸裕司・中山奈津子・豊田健介・高尾祥丈・緒方博之
    • Organizer
      第25回日本微生物生態学会講要
    • Place of Presentation
      広島大学
    • Year and Date
      2009-11-21
  • [Presentation] 原生生物のRNAウイルス学-ICTVへの3つの「科」の提唱-2009

    • Author(s)
      長崎慶三・高尾祥丈・本多大輔・外丸裕司
    • Organizer
      第57回日本ウイルス学会学術集会
    • Place of Presentation
      都市センターホテル
    • Year and Date
      2009-10-26
  • [Presentation] 水圏環境中における宿主-ウイルスの感染現象を巡る多様性獲得について2009

    • Author(s)
      長崎慶三・外丸裕司・川見寿枝・和田啓・福山恵一
    • Organizer
      第11回日本進化学会大会
    • Place of Presentation
      北海道大学
    • Year and Date
      2009-09-03
  • [Presentation] Complex interrelationship between marine microalgae and their viruses2009

    • Author(s)
      Nagasaki, K., Kawami, H., Mizumoto, H., Takao, Y., Tomaru, Y.
    • Organizer
      American Society for Virology 28th Annual Meeting
    • Place of Presentation
      ブリティッシュコロンビア大学
    • Year and Date
      2009-07-13
  • [Presentation] 有害赤潮原因藻ヘテロカプサに感染する海産ウイルスHcRNAVの結晶構造解析に向けたコートタンパク質の発現系の確立2009

    • Author(s)
      和田啓・橘川麻衣・外丸裕司・長崎慶三・福山恵一
    • Organizer
      第9回日本蛋白質科学会年会講演
    • Place of Presentation
      熊本全日空ホテル
    • Year and Date
      2009-05-21
  • [Presentation] Algal virus variation" vs."Algal host variation"2009

    • Author(s)
      長崎慶三, 川見寿枝, 外丸裕司
    • Organizer
      3rd annual meeting of the Scientific Committee on Ocean Research(SCOR)Working Group on the Role of Viruses in Marine Ecosystems
    • Place of Presentation
      デラウェア大学
    • Year and Date
      2009-05-15
  • [Remarks]

    • URL

      http://feis.fra.affrc.go.jp/HABD/HACS/index.html

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Published: 2011-06-16   Modified: 2014-09-19  

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