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2008 Fiscal Year Annual Research Report

RAT-U13snoRNA複合体構造解析によるリボソーム成熟機構の解明

Research Project

Project/Area Number 20247007
Research InstitutionHokkaido University

Principal Investigator

田中 勲  Hokkaido University, 大学院・先端生命科学研究院, 教授 (70093052)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 姚 閔  北海道大学, 大学院・先端生命科学研究院, 准教授 (40311518)
KeywordsX線結晶構造解析 / RNA-タンパク質相互作用 / snoRNA / リボソーム生合成 / アセチル化
Research Abstract

リボソームは翻訳の基幹装置であり, その生合成機構の解明は, 生命現象解明の中心的課題である. 本研究では, rRNAの成熟過程を, アセチル基転移酵素とガイドsnoRNAの複合体解析を通して解明することを研究目的としている. 連携研究者の鈴木勉(東大・院工)は, 最近, 真核生物においてrRNAのHelix45のアセチル化に関与する必須遺伝子を同定したが, この遺伝子は我々が構造解析したヘリカーゼ機能を持つtRNAアセチル基転移酵素TmcAのホモログをコードしている. 我々はこれらの事実から, このTmcAホモログは備え持つヘリケースドメインによりHelix45の2次構造を解きつつ, U13をガイドとしてpre-18SrRNAに結合し, アセチル化を施しているという新しい概念を持つに至った. 本申請では, このTmcAホモログ(RAT: RNA AcetylTransferase)がU13をガイドとしてpre-18SrRNAを認識し, その2次構造を解き, アセチル化を行う分子機構を解明し, 次いで, そのアセチル化を認識したrRNA切断酵素がpre-18SrRNAをプロセシングするまでの分子機構を解明する.
本年度は, 真核生物由来TmcAの発現・精製系の確立を目指して研究を進めた. そのためマウス由来のTmcAのホモログ(mTmcA)をコードする遺伝子を含むベクターを購入し, PCRにより増幅した. mTmcAは115kDaを超えるタンパク質であり, 可溶化, 精製が困難であるため, GSTとの融合タンパク質として発現させる系を構築し, QuikChangeキットを用いて, GSTとmTmcAの間にHis-tagを挿入した. mTmcAの発現を確認したところ, 不溶性画分に発現が確認された. 次いで酵母Pchiaを用いたmTmcAの発現系を構築し, アフィニティークロマトグラフィーにより, GST融合しているmTmcAを調製することができた. 精製過程を最適化することにより, 安定な分子を大量に調製することが可能となった. さらに, 精製されたmTmcAのATPase活性を確認した。一方, バイオインフォマティクスを用いてmTmcAと相互作用する分子群を探索した結果, mTmcAはリボソームrRNA18Sの生合成に関連する因子UTP7, UTP22, KRR1, ENP1, ENP2, NOP4と相互作用し, rRNA18Sの生合成に関与する可能性を示唆した.

  • Research Products

    (4 results)

All 2009 2008

All Presentation (4 results)

  • [Presentation] 翻訳駆動エネルギー生産部位「ストーク」の構造機能解析2009

    • Author(s)
      田中勲
    • Organizer
      日本農芸化学会2009年度大会
    • Place of Presentation
      福岡市
    • Year and Date
      20090327-29
  • [Presentation] Pyrococcus horikoshii由来アラニルtRNA合成酵素の結晶構造2009

    • Author(s)
      徳永啓太
    • Organizer
      第26回PFシンポジウム
    • Place of Presentation
      つくば市
    • Year and Date
      20090324-25
  • [Presentation] リボソームGTPaseセンターを構成するストークタンパク質複合体2008

    • Author(s)
      内海利男
    • Organizer
      BMB2008(第31回日本分子生物学会年会・第81回日本生化学会大会合同大会)
    • Place of Presentation
      神戸市
    • Year and Date
      20081209-12
  • [Presentation] The structure of archaeal ribosomal stalk complex2008

    • Author(s)
      Isao Tanaka
    • Organizer
      XXI Congress of the International Union of Crystallography (IUCr2008)
    • Place of Presentation
      Osaka, Japan
    • Year and Date
      20080823-31

URL: 

Published: 2010-06-11   Modified: 2016-04-21  

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