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2009 Fiscal Year Annual Research Report

イオンチャネルの構造-機能ダイナミクス:ゲーティング構造変化の単一分子解析

Research Project

Project/Area Number 20247016
Research InstitutionUniversity of Fukui

Principal Investigator

老木 成稔  University of Fukui, 医学部, 教授 (10185176)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 岩本 真幸  福井大学, 医学部, 助教 (40452122)
清水 啓史  福井大学, 医学部, 助教 (50324158)
今野 卓  福井大学, 医学部, 准教授 (50225637)
Keywordsチャネル / 構造変化 / ゲーティング / 構造機能相関 / 一分子計測
Research Abstract

すでに確立した1分子蛋白質構造変化測定法(DXT法)の原理に遡って、実験法の改善を行った。目的は従来の毎秒30フレームという記録速度を各段に上げることである。本法に不可欠な高輝度放射光施設での実験を国内のSPring-8のみならず、フランス(ESRF:ヨーロッパ放射光施設、グルノーブル)とスイス(SLS:スイス光源施設、ヴィリゲン)に展開した。代表・分担研究者4人で高速度カメラなどの高精度装置を持ち込み、各施設に約1週間滞在して実験を行った。各施設とも白色X線源を備えており、さらに、X線の特性を多様にコントロールすることができた。その結果、背景ノイズが減少し、信号雑音比を想像以上に改善することができた。このことで記録速度を毎秒5000フレームにまで上げることに成功した。現在、継続して実験を行い、データを取得中である。一方、研究室レベルの実験では脂質平面膜法により、KcsAカリウムチャネルの単一チャネル電流を記録し、詳細に解析しつつある。脂質平面膜にたった一分子のチャネル分子を再構成するのは決して容易ではないが、この困難な実験を行うことによって重要なゲーティングに関する情報を得ることができた。特にpH依存性ゲーティングに関して、2009年に解明されたKcsAチャネルの全長構造を参考にしつつ、その分子機構を検討しつつある。脂質平面膜法による1分子機能測定と、DXT法による1分子構造変化測定の結果を統合的に解析することによってチャネルの1分子ダイナミクス研究をさらに推進したい。

  • Research Products

    (12 results)

All 2010 2009

All Journal Article (4 results) (of which Peer Reviewed: 4 results) Presentation (7 results) Book (1 results)

  • [Journal Article] Single Molecular Gating Dynamics for KcsA Potassium Channel2010

    • Author(s)
      Oiki, S., H.Shimizu, M.Iwamoto, T.Konno
    • Journal Title

      Adv.Chem.Phys. (印刷中)

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Docking Model of Drug Binding to the Human Ether-a-go-go Potassium Channel Guided by Tandem Dimer Mutant Patch-Clamp Data : A Synergic Approach2009

    • Author(s)
      Imai, Y.N., S.Ryu, S.Oiki
    • Journal Title

      J.Med.Chem. 52

      Pages: 1630-1638

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Temperature dependence of Proton Permeation through a Voltage-Gated Proton Channel2009

    • Author(s)
      Kuno, M., H.Ando, H.Morihata, H.Sakai, H.Mori, M.Sawada, S.Oiki
    • Journal Title

      J.Gen.Physiol. 134

      Pages: 191-205

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] X線一分子追跡法により明らかになったKcsAカリウムチャネルの開閉機構2009

    • Author(s)
      老木成稔
    • Journal Title

      放射光 22

      Pages: 183-191

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] Structural and Functional Fluctuations of the KcsA Potassium Channel2009

    • Author(s)
      Oiki, S, H.Shimizu, M.Iwamoto, T.Konno
    • Organizer
      The 3^<rd> International Symposium : Molecular Science of Fluctuations toward Biological Functions
    • Place of Presentation
      名古屋
    • Year and Date
      2009-12-21
  • [Presentation] チャネルゲーティングの1分子構造変化ダイナミクス2009

    • Author(s)
      老木成稔
    • Organizer
      中部日本生理学会
    • Place of Presentation
      金沢
    • Year and Date
      2009-12-07
  • [Presentation] Single-molecular measurements for structural and functional fluctuations of KcsA potassium channel2009

    • Author(s)
      老木成稔
    • Organizer
      第47回生物物理学会年会シンポジウム「生体分子の揺らぎをはかる」
    • Place of Presentation
      徳島
    • Year and Date
      2009-10-30
  • [Presentation] KcsA カリウムチャネル構造機能相関の1分子解析2009

    • Author(s)
      老木成稔
    • Organizer
      第82日本生化学会大会. シンポジウム
    • Place of Presentation
      神戸
    • Year and Date
      2009-10-17
  • [Presentation] チャネル蛋白質の1分子測定でみえる構造と機能 : イオン透過とゲーティング2009

    • Author(s)
      老木成稔
    • Organizer
      生物物理若手の会第49回夏の学校
    • Place of Presentation
      千歳
    • Year and Date
      2009-08-03
  • [Presentation] Real time monitoring of structural changes in K-channel gating2009

    • Author(s)
      老木成稔
    • Organizer
      IUPS PSJ
    • Place of Presentation
      京都
    • Year and Date
      2009-07-28
  • [Presentation] Dynamics of KcsA Potassium Channel During pH-dependent Gating2009

    • Author(s)
      Oiki, S, H.Shimizu, M.Iwamoto, T.Konno
    • Organizer
      International Symposium on "Reaction Dynamics of Many-Body Chemical Systems"
    • Place of Presentation
      京都
    • Year and Date
      2009-06-23
  • [Book] "Cell Signaling Reactions : Single-Molecular Kinetic Analysis"(Eds. Y. Sako and M. Ueda)(Springer)2010

    • Author(s)
      S.Oiki
    • Publisher
      Single-Channel Structure-Function Dynamics : The Gating of Potassium Channels(印刷中)

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Published: 2011-06-16   Modified: 2016-04-21  

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