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2010 Fiscal Year Self-evaluation Report

Development of an automatic analysis system at the protein-structuralmobility using the electron microscope

Research Project

  • PDF
Project/Area Number 20300107
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research (B)

Allocation TypeSingle-year Grants
Section一般
Research Field Bioinformatics/Life informatics
Research InstitutionNational Institute of Advanced Industrial Science and Technology

Principal Investigator

OGURA Toshihiko  National Institute of Advanced Industrial Science and Technology, バイオメディカル研究部門, 主任研究員 (70371028)

Project Period (FY) 2008 – 2011
Keywords電子顕微鏡 / 画像情報処理 / 生物サンプル / 3次元構造 / タンパク質
Research Abstract

本研究は電子顕微鏡によりタンパク質を撮影し、この画像情報より3次元構造を構築する単粒子構造解析法の新しいアルゴリズムや画像取得システムに関する開発を行う。タンパク質は、構造を変化させることで機能しているため、3次元的な構造変化を捉えることは極めて重要となる。本提案は、新たな画像情報処理アルゴリズムや新規の低ダメージ高コントラスト検出技術を開発することで、タンパク質の3次元構造の変化を簡便にかつ自動的に解析することを目的とする。さらに、本提案により開発したアルゴリズムを並列分散化し、解析速度を向上させることで、多くのタンパク質の構造変化と機能の解明を進める。新規の低ダメージ高コントラスト観察手法は、走査型電顕内に設置し、より高感度・高速の検出素子を使用することで、低電子線量で、かつ高速の観察を可能とする。これに加えて、サンプルを支持するサンプルホルダーを改良することで、より低ダメージでの解析を可能とする。

  • Research Products

    (5 results)

All 2011 2010 2009 2008

All Journal Article (5 results) (of which Peer Reviewed: 5 results)

  • [Journal Article] High-resolution x-ray observation of unstained samples by a newly developed SGXM2011

    • Author(s)
      Toshihiko Ogura
    • Journal Title

      Nanotechnology 21

      Pages: 295501(7)

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Keap1 is a forked-stem dimmer structure with two large spheres enclosing the intervening, double glycine repeat, and C-terminal domains2010

    • Author(s)
      Toshihiko Ogura, Kit I.Tong, Kazuhiro Mio, Yuusuke Maruyama, Hirofumi Kurokawa,Chikara Sato, Masayuki Yamamoto
    • Journal Title

      Proc.Natl.Acad.Sci.USA 107

      Pages: 2842-2847

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Direct observation of unstained wet biological samples by scanning-electron generation X-ray microscopy2010

    • Author(s)
      Toshihiko Ogura
    • Journal Title

      Biochem.Biophys.Res.Commun 391

      Pages: 198-202

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Measurement of the unstained biological sample by a novel scanning electron generation X-ray microscope based on SEM2009

    • Author(s)
      Toshihiko Ogura
    • Journal Title

      Biochem.Biophys.Res.Commun. 385

      Pages: 624-629

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] A high contrast method of unstained biological samples under a thin carbon film by scanning electron microscopy2008

    • Author(s)
      Toshihiko Ogura
    • Journal Title

      Biochem.Biophys.Res.Commun. 380

      Pages: 254-259

    • Peer Reviewed

URL: 

Published: 2012-02-13   Modified: 2016-04-21  

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