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2009 Fiscal Year Annual Research Report

スプライシング異常による疾病発症メカニズムの分子論的基盤研究

Research Project

Project/Area Number 20310141
Research InstitutionThe Institute of Physical and Chemical Research

Principal Investigator

武藤 裕  The Institute of Physical and Chemical Research, RNA生物学研究チーム, チームリーダー (30192769)

KeywordsCUG-BP1 / 筋強直性ジストロフィー / U1 snRNP / RNA結合蛋白質 / Tra2β / 前頭側頭型痴呆症 / NMR / 質量分析
Research Abstract

昨年度に引き続き、筋強直性ジストロフィーの発症に関連すると思われる選択的スプライシング因子、CUG-BP1蛋白質のRNA結合ドメインについて高次構造解析の結果をまとめ、公表した(論文(3))。また、同様に、筋強直性ジストロフィーの発症に関与すると考えられるMBNL2蛋白質についてそのRNA結合ドメインの構造を解析し、公表した(論文(6))。これによると、MBNL2は4個あるRNA結合ドメインのうち、1-2と3-4がそれぞれひとつのドメインのように振る舞い、従来知られている様式とは異なる方法でRNAを結合することが明らかになった。基本因子については、質量分析計を用いた解析から、基本因子となるU1snRNPが、Hela細胞中では、U1-70KとSmBにおけるスプライシングバリアントのために、4種類存在していることが明らかになった。とくに、U1-70Kのバリアントについては、U1snRNP中で、構成要素のひとつであるU1C蛋白質との相互作用様式に変化が見られることが明らかになった(論文(1))。また、前頭側頭型痴呆症などに関連するTra2β蛋白質のRNA結合ドメインとその結合配列との複合体解析をおこなった。
Tra2β蛋白質は、人だけでなくショウジョウバエなどの真核生物にも見られる普遍的なスプライシング制御因子であるが、アミノ酸の類似が高いにも関わらず、異なった結合配列が報告されている。今回、異なった二種類の配列の対するNMR解析から、結合するRNA配列の構造の違いから、認識配列が変化することを明らかにした。この結果は、ひとつの蛋白質が、状況によって異なる配列を認識する可能性を示す興味ぶかいものである。

  • Research Products

    (14 results)

All 2009

All Journal Article (8 results) (of which Peer Reviewed: 8 results) Presentation (6 results)

  • [Journal Article] Isoforms of U1-70K control subunit dynamics in the human spliceosomal U1 sn RNP2009

    • Author(s)
      Hernadez H., et al.
    • Journal Title

      Pros One 4

      Pages: E7202(1-13)

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Structural and functional characterization of the NHR1 domain of the Drosophila Neuralized E3 ligase in the Notch signaling pathway2009

    • Author(s)
      He F., et al.
    • Journal Title

      J.M.B 393

      Pages: 478-495

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Structural basis for the sequence-specific RNA-recognition mechanism of human CUG-BP1 RRM32009

    • Author(s)
      Tsuda K., et al.
    • Journal Title

      Nucleic Acids Res. 37

      Pages: 5151-6155

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Characterization of a heat-stable enzyme possessing GTP-dependent RNA ligase activity from a hyperthermophilic archaeon, Pyrococcus furiosus2009

    • Author(s)
      Kanai A., et al.
    • Journal Title

      RNA 15

      Pages: 420-431

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Solution structure of the cysteine-rich domain in Fn14, a member of the tumor necrosis factor receptor superfamily2009

    • Author(s)
      He F., et al.
    • Journal Title

      Protein Science 18

      Pages: 650-656

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Solution structure of the RNA binding domain in the human muscleblind-like protein 22009

    • Author(s)
      He F., et al.
    • Journal Title

      Protein Science 18

      Pages: 81-90

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] AU-rich RNA-binding induces changes in the quaternary structure of AUH2009

    • Author(s)
      Kurimoto K., et al.
    • Journal Title

      Proteins 75

      Pages: 360-372

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Solution Structure of the GUCT Domain from Human RNA Helicase II/Guβ Reveals the RRM Fold, but Implausible RNA Interactions2009

    • Author(s)
      Ohnishi S., et al.
    • Journal Title

      Proteins 74

      Pages: 133-144

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] 構造生物学的研究によって明らかにされる"RNA recognition motif(RRM)"の多様性2009

    • Author(s)
      桑迫香奈子
    • Organizer
      RNAフロンティアミーティング2009
    • Place of Presentation
      葉山
    • Year and Date
      20090926-20090928
  • [Presentation] AU-rich RNA-binding induces changes in the quaternary structure of AUH2009

    • Author(s)
      桑迫香奈子
    • Organizer
      第32回日本分子生物学会年会
    • Place of Presentation
      横浜
    • Year and Date
      2009-12-09
  • [Presentation] Structural and functional characterization of the NHR1 domain of the Drosophila Neuralized E3 ligase in the Notch signaling pathway2009

    • Author(s)
      He, F.
    • Organizer
      第32回日本分子生物学会年会
    • Place of Presentation
      横浜
    • Year and Date
      2009-12-09
  • [Presentation] eIF4BとeIF4HのRNAに対する結合能の違い2009

    • Author(s)
      津田健吾
    • Organizer
      第32回日本分子生物学会年会
    • Place of Presentation
      横浜
    • Year and Date
      2009-12-09
  • [Presentation] miRNAの抑制に関わるタンパク質の構造解析2009

    • Author(s)
      高橋真梨
    • Organizer
      第32回日本分子生物学会年会
    • Place of Presentation
      横浜
    • Year and Date
      2009-12-09
  • [Presentation] Characterization of RNA aptamers against SRP19 protein having sequences different from SRP RNA2009

    • Author(s)
      Haraguchi, Y.
    • Organizer
      The 6th International symposium on Nucleic Acid Chemistry
    • Place of Presentation
      Gifu
    • Year and Date
      2009-09-27

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Published: 2011-06-16   Modified: 2016-04-21  

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