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2010 Fiscal Year Annual Research Report

マルチ銅還元酵素の研究の新展開

Research Project

Project/Area Number 20350078
Research InstitutionOsaka University

Principal Investigator

鈴木 晋一郎  大阪大学, 名誉教授 (70116052)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 野尻 正樹  大阪大学, 大学院・理学研究科, 助教 (20333346)
Keywords亜硝酸還元酵素 / 銅タンパク質 / ニキビ菌 / シトクロム c / 海洋性好冷菌 / ブルー銅タンパク質 / 組換体 / X線結晶構造解析
Research Abstract

1 ニキビ菌Propionibacterium acnes由来の亜硝酸還元酵素(PaNIR)の構造・機能の研究
今年度は、N末に膜貫通ドメインを含む本来のPaNIR遺伝子を用いた場合と、さらに、膜貫通ドメインをBacillus由来のMisticと呼ばれる膜蛋白質でドメイン置換した場合(Mistic-PaNIR)の両方で、大腸菌での発現実験を行った。Misticとは、Bacillus種から単離・同定された膜蛋白質で、他の膜蛋白質と遺伝子工学的に融合させることで高効率に組換え膜蛋白質として発現させる際に用いられる蛋白質である。その結果として、本来のPaNIRを用いたケースは発現に成功しなかったが、Misticと融合したMistic-PaNIRにおいて高い収量で発現させる事に成功した。続いて、各種クロマトグラフィーにより膜蛋白質として、Mistic融合PaNIRの部分精製を行った。その紫外・可視吸収スペクトルでは、一昨年度に作成した膜貫通ドメインを含まない膜貫通ドメイン欠損型PaNIRと比べ、吸光係数ならびに吸収バンドピーク強度比が大きく異なる結果となった。
2 海洋性好冷菌Pseudoalteromonas haloplanktis由来の亜硝酸還元酵素(PhNIR)の構造・機能の研究
今年度も昨年度から継続して、PhNIRの電子供与体であるシトクロムc_<4A>のX線結晶構造解析を行った。結晶化条件のさらなる探索を行い、現在、2.9Aの回折データ収集に成功し分子置換法により位相決定を試行している段階である。また、それと平行して、重原子同形置換法ならびにヘム鉄を利用した多波長異常分散法での位相決定を行うために適した結晶化(重原子ソーク)条件を探索中である。今後、本蛋白質の立体構造を決定する事で、PhNIRの分子間電子伝達機構におけるC末シトクロムドメインの役割・意義を見いだす事が出来ると考えている。

  • Research Products

    (12 results)

All 2011 2010

All Journal Article (2 results) (of which Peer Reviewed: 2 results) Presentation (10 results)

  • [Journal Article] Electroreduction of Nitrite to Nitrogen Oxide by a Copper-Containing Nitrite Reductase Model Complex Incorporated into Collagen Film2010

    • Author(s)
      Naoko Isoda, Hiroshi Yokoyama, Masaki Nojiri, Shinnichiro Suzuki, Kazuya Yamaguchi
    • Journal Title

      Bioelectrochemistry

      Volume: 77 Pages: 82-88

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Synthesis and Structural Characterization of Nitrite-Coordinating Co^<II> and Co^<III> Complexes as Models for the Reaction Center of Co-Substituted Nitrite Reductase2010

    • Author(s)
      Hiroshi Yokoyama, Aya Masuno, Makoto Misoo, Kazuya Yamaguchi, Shinnichiro Suzuki
    • Journal Title

      Journal of Coordination Chemistry

      Volume: 63 Pages: 762-775

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] Structure-Function Relationships of Copper Reductases in Denitrification2011

    • Author(s)
      鈴木晋一郎
    • Organizer
      International Symposium on Chemistry of Reductases IV
    • Place of Presentation
      名古屋大学(招待講演)
    • Year and Date
      2011-01-21
  • [Presentation] Role of the N-terminal cupredoxin domain of a hexameric nitrite reductase2010

    • Author(s)
      Ikebuchi, S., Koteishi, H., Yamaguchi, K., Suzuki, S., Nojiri, M.
    • Organizer
      The International Chemical Congress of Pacific Basin Societies
    • Place of Presentation
      Hawaii Convention Center, Hawaii, USA
    • Year and Date
      2010-12-15
  • [Presentation] 脱窒反応における蛋白質電子伝達機構の構造生物化学的研究2010

    • Author(s)
      野尻正樹
    • Organizer
      第64回 酵素工学研究会 講演会
    • Place of Presentation
      東京大学(招待講演)
    • Year and Date
      2010-11-19
  • [Presentation] 六量体銅型亜硝酸還元酵素におけるタイプ1銅含有N末ドメインの役割2010

    • Author(s)
      池淵紗織、城田フェリシア、小手石泰康、山口和也、鈴木晋一郎、野尻正樹
    • Organizer
      第4回 バイオ関連化学シンポジウム
    • Place of Presentation
      大阪大学
    • Year and Date
      2010-09-24
  • [Presentation] 新奇c型ヘム含有銅型亜硝酸還元酵素とチトクロムcの分子間電子伝達反応2010

    • Author(s)
      石川遼介、津田愛子、小手石泰康、山口和也、鈴木晋一郎、野尻正樹
    • Organizer
      第4回 バイオ関連化学シンポジウム
    • Place of Presentation
      大阪大学
    • Year and Date
      2010-09-24
  • [Presentation] 銅型亜硝酸還元酵素と電子供与タンパク質問の電子移動反応における過渡的複合体の構造解析2010

    • Author(s)
      小手石泰康、石本和大、山口和也、鈴木晋一郎、野尻正樹
    • Organizer
      第4回 バイオ関連化学シンポジウム
    • Place of Presentation
      大阪大学
    • Year and Date
      2010-09-24
  • [Presentation] Structural analysis of the transient complexes between nitrite reductase and its redox-partner protein during inter-protein electron transfer reaction2010

    • Author(s)
      Koteishi, H., Ishimoto, K., Suzuki, S., Nojiri, M
    • Organizer
      Gordon Research Conferences-Electron Transfer Processes and Energy Conversion
    • Place of Presentation
      Salve Regina University, USA
    • Year and Date
      2010-08-08
  • [Presentation] 亜硝酸還元酵素と電子供与蛋白質の分子間電子伝達反応における分子認識と反応制御機構の構造基盤2010

    • Author(s)
      野尻正樹
    • Organizer
      第10回 日本蛋白質科学会年会
    • Place of Presentation
      札幌コンベンションセンター(招待講演)
    • Year and Date
      2010-06-16
  • [Presentation] 部位特異的変異による銅含有亜硝酸還元酵素とシトクロムcの会合様式と電子移動への影響2010

    • Author(s)
      小手石泰康、石本和大、鐘木晋一郎、野尻正樹
    • Organizer
      第10回 日本蛋白質科学会年会
    • Place of Presentation
      札幌コンベンションセンター
    • Year and Date
      2010-06-16
  • [Presentation] 六量体銅型亜硝酸還元酵素におけるタイプ1銅含有N末ドメインの役割2010

    • Author(s)
      池淵紗織、城田フェリシア、小手石泰康、鈴木晋一郎、野尻正樹
    • Organizer
      第10回 日本蛋白質科学会年会
    • Place of Presentation
      札幌コンベンションセンター
    • Year and Date
      2010-06-16

URL: 

Published: 2012-07-19  

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