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2008 Fiscal Year Annual Research Report

シャペロニンGroELの第二のATP結合部位とその機能的役割

Research Project

Project/Area Number 20370066
Research InstitutionNational Institutes of Natural Sciences Okazaki Research Facilities

Principal Investigator

桑島 邦博  National Institutes of Natural Sciences Okazaki Research Facilities, 岡崎統合バイオサイエンスセンター, 教授 (70091444)

Keywords生物物理 / 分子機械 / 分子認識 / 生体分子 / 蛋白質 / 分子シャペロン / アロステリック転移 / シャペロニン
Research Abstract

蛋白質の細胞内フォールディングを介助する分子シャペロンとして知られる、大腸菌のシャペロニンGroELには、本来のATP結合部位の外に第二のATP結合部位の存在することが、われわれの最近の研究により明らかとなりつつある。本研究では、この第二ATP結合部位を、蛍光エネルギー移動、光親和性標識、質量分析、アミノ酸配列分析などの手法を用いて同定する。ATPによるGroELのアロステリック転移の速度論的解析を行い、第二ATP結合部位を考慮に入れたアロステリック・モデルを構築すると共に、GroELの分子シャペロン機能において第二ATP結合部位がどのような役割をはたしているかを明らかにする。以下の研究を行った。
(1)光親和性標識によるATP結合部位の同定:アジ化ATPアナログによる光親和性標識、蛋白質分解酵素による分解産物のHPLC解析、アミノ酸配列分析、質量スペクトル解析によって、光親和性標識されたアミノ酸がTyr360であることが明らかとなり、第二ATP結合部位はこの近くにあることが期待される。今後、第一ATP結合部位の光親和性標識、Mg^<2+>有無の影響から結合特異性の確認などを行う必要がある。
(2)アロステリック転移に及ぼすK^+の影響:今回、ATP結合によるGroELのアロステリック転移と第二ATP結合部位へのATP結合は溶液中のカリウムィォン(K^+)濃度に大きく依存することも明らかとなった。今後、アロステリック転移に及ぼすK^+濃度の影響を定量的に調べることが必要である。

  • Research Products

    (7 results)

All 2009 2008 Other

All Journal Article (3 results) (of which Peer Reviewed: 3 results) Presentation (2 results) Book (1 results) Remarks (1 results)

  • [Journal Article] Non-native α-helix formation is not necessary for folding of lipocalin : Comparison of burst-phase folding between tear lipocalin and β-lactoglobulin2009

    • Author(s)
      S. TSUKAMOTO
    • Journal Title

      Proteins (掲載確定印刷中)

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Sequential Action of ATP-dependent Subunit Conformational Change and Interaction between Helical Protrusions in the Closure of the Built-in Lid of Group II Chaperonins2008

    • Author(s)
      T. KANZAKI
    • Journal Title

      J. Biol. Chem. 283

      Pages: 34773-34784

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Probing force-induced unfolding intermediates of a single staphylococcal nuclease molecule and the effect of ligand binding2008

    • Author(s)
      T. ISHII
    • Journal Title

      Biochem. Biophys. Res. Commun. 375

      Pages: 586-591

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] Molecular Mechanisms of the Chaperone Function of GroEL2008

    • Author(s)
      桑島邦博
    • Organizer
      8th KIAS-Yonsei Conference on Protein Structure and Function
    • Place of Presentation
      Seoul, Korea.
    • Year and Date
      2008-10-11
  • [Presentation] Folding Mechanisms of Homologous Proteins : A Comparative Study between Lysozyme and α-Lactalbumin2008

    • Author(s)
      桑島邦博
    • Organizer
      ACS 236^<th> National Meeting Symposium
    • Place of Presentation
      Philadelphia, U. S. A.
    • Year and Date
      2008-08-21
  • [Book] Water and Biomolecules-Physical Chemistry of Life Phenomena2009

    • Author(s)
      K. Kuwajima
    • Total Pages
      307
    • Publisher
      Springer-Verlag, Berlin & Heidelberg
  • [Remarks]

    • URL

      http://gagliano.ims.ac.jp/Welcome.html

URL: 

Published: 2010-06-11   Modified: 2016-04-21  

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