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2009 Fiscal Year Annual Research Report

シャペロニンGroELの第二のATP結合部位とその機能的役割

Research Project

Project/Area Number 20370066
Research InstitutionNational Institutes of Natural Sciences Okazaki Research Facilities

Principal Investigator

桑島 邦博  National Institutes of Natural Sciences Okazaki Research Facilities, 岡崎統合バイオサイエンスセンター, 教授 (70091444)

Keywords生物物理 / 分子機械 / 分子認識 / 生体分子 / 蛋白質 / 分子シャペロン / アロステリック転移 / シャペロニン
Research Abstract

蛋白質の細胞内フォールディングを介助する分子シャペロンとして知られる、大腸菌のシャペロニンGroELには、本来のATP結合部位の外に第二のATP結合部位の存在することが、われわれの最近の研究により明らかとなりつつある。本研究では、この第二ATP結合部位を、蛍光エネルギー移動、光親和性標識、質量分析、アミノ酸配列分析、ストップトフロー蛍光法、滴定型熱量計などの手法を用いて同定する。昨年度までの研究で、アジ化ATPアナログによる光親和性標識と蛋白質分解酵素などによって、Tyr360が第二ATP結合部位の近くにあることが示唆された。また、ATP結合によるGroELのアロステリック転移と第二ATP結合部位へのATP結合は溶液中のカリウムイオン(K^+)濃度に大きく依存することも明らかとなった。以下の研究を行った。
(1)アロステリック転移に及ぼすK^+の影響:pH7.5,10mM MgCl_2の条件下で、KCl濃度を0,10,50mMに振って、GroEL(Y485W変異体)のATPによるアロステリック転移の速度過程をストップトフロー蛍光法を用いて調べた。その結果、速度定数のATP濃度依存性において、50mM KClで観測された第二のATP結合に対応するとされている二つ目のシグモイドが0と10mM KClでは全く観測されなかった。また、KClなしでは、ATPのアロステリック転移そのものが観測されないが、ATPの結合に伴う蛍光変化は観測された。
(2)滴定型熱量計(ITC)によるGroELへのATP結合測定:KCl非存在下ではGroELのアロステリック転移は起こらないが、ATP結合を観測することはできたので、この結合を、ITCを用いて観測することを試みた。5℃では明確な滴定曲線を観測できた。今後、さらに条件を変えて測定し、得られた結合定数を(1)の速度論的測定から得られたものと比較したい。

  • Research Products

    (10 results)

All 2010 2009 Other

All Journal Article (4 results) (of which Peer Reviewed: 4 results) Presentation (5 results) Remarks (1 results)

  • [Journal Article] Flexible recognition of the tRNA G18 methylation target site by Trm Hmethyltransferase through first binding and induced fit processes2010

    • Author(s)
      A.Ochi
    • Journal Title

      J.Biol.Chem. 285

      Pages: 9018-9029

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Adaptation of a hyperthermophilic group II chaperonin to relatively moderate temperatures2010

    • Author(s)
      T.Kanzaki
    • Journal Title

      Protein.Eng.Des.Sel. 23

      Pages: 393-402

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Different folding pathways taken by highly homologous proteins, goat α-lactalbumin and canine milk lysozyme2010

    • Author(s)
      T.Nakamura
    • Journal Title

      J.Mol.Biol. 396

      Pages: 1361-1378

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Non-native α-helix formation is not necessary for folding of lipocalin : comparison of burst-phase folding between tear lipocalin and B-lactoglobulin2009

    • Author(s)
      S.Tsukamoto
    • Journal Title

      Proteins 76

      Pages: 226-236

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] Is the folding pathway conserved in homologous proteins?2010

    • Author(s)
      K.Kuwajima
    • Organizer
      PepCon-2010
    • Place of Presentation
      Beijing International Convention Center, China
    • Year and Date
      20100321-20100323
  • [Presentation] Molecular Mechanisms of Protein Folding2010

    • Author(s)
      K.Kuwajima
    • Organizer
      2010 Annual Meeting of Asian CORE Program "Frontiers of Materials, Photo-, and Theoretical Molecular Sciences"
    • Place of Presentation
      Institute of Atomic and Molecular Sciences, Academia Sinica, Taiwan
    • Year and Date
      20100228-20100302
  • [Presentation] Hydrogen-exchange kinetics of the Escherichia coli chaperonin complex2009

    • Author(s)
      K.Kuwajima
    • Organizer
      2nd Japan-Korea Seminar on Biomolecular Sciences -Experiments and Simulations
    • Place of Presentation
      Nagoya University, Nagoya, Japan
    • Year and Date
      20091222-20091223
  • [Presentation] A minor component of native β2-microglobulin and its relationship to dialysis-related amyloidosis2009

    • Author(s)
      K.Kuwajima
    • Organizer
      The 9th KIAS-SNU Conference on Protein Structure and Function, Seoul National University
    • Place of Presentation
      Seoul National University, Seoul, Korea
    • Year and Date
      20091008-20091010
  • [Presentation] Hydrogen-exchange kinetics of the Escherichia coli chaperonin complex2009

    • Author(s)
      K.Kuwajima
    • Organizer
      Japan-Korea Symposium on Molecular Science 2009 "Chemical Dynamics in Materials and Biological Molecular Sciences"
    • Place of Presentation
      Awaji Yumebutai International Conference Center, Awajishima, Japan
    • Year and Date
      20090712-20090714
  • [Remarks]

    • URL

      http://gagliano.ims.ac.jp/Welcome.html

URL: 

Published: 2011-06-16   Modified: 2016-04-21  

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