2010 Fiscal Year Annual Research Report
ナシ属初の自殖F2集団を用いた果実有用形質のマッピングと高機能新品種開発への応用
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20380021
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| Research Institution | Tottori University |
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Principal Investigator |
板井 章浩 鳥取大学, 農学部, 准教授 (10252876)
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| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
児玉 基一朗 鳥取大学, 農学部, 教授 (00183343)
山本 俊哉 独立行政法人農業・食品産業技術総合研究機構, 果樹研究所, 果樹ゲノムチーム長 (60355360)
村山 秀樹 山形大学, 農学部, 教授 (40230015)
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| Keywords | ナシ / 自殖F2 / シュクロース / インベルターゼ / SSR / 連鎖地図 / EST / SNP |
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| Research Abstract |
酸性インベルターゼ(AIV)をコードする遺伝子PpAIV2が成熟期のスクロース代謝において重要であり、PpAIV2の品種間のゲノム構造の差異および遺伝子の発現解析を行った。供試したニホンナシ35品種において、4kbおよび3kb付近に位置するバンドは中・低蓄積型の品種に特異的に検出され、高蓄積型の品種には全く見られないことを発見した。そこで,PCRを用いたより簡便なCAPSマーカーを開発する目的で、ゲノムライブラリーを作成し,プロモーター領域を含む10kb以上の領域のシーケンスを行った。シーケンス結果からプロモーター領域を増幅するようにプライマーを構築し,増幅断片を恥EcoRIで消化するCAPS法を用いて,シュクロース低・中・高蓄積型の31品種のバンドパターンを検定した.CAPS法の結果は,ゲノムのサザン解析の結果とすべて一致した.したがって,これら二つのバンドはスクロース低蓄積型判別マーカーとして利用できることが明らかとなった。またナシ自殖F2集団('おさ二十世紀'X'マックスレッドバートレット')を約500個体育成し、約200SSRマーカー以上が、実際F2個体でもマーカーは分離し、利用可能であることが明らかとなった。さらに次世代シーケンサーを用いたEST解析から、1000以上のSNPをニホンナシとセイヨウナシ間で見いだした。
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