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2009 Fiscal Year Annual Research Report

糖転移作用を支配する構造因子の分子解析と応用

Research Project

Project/Area Number 20380056
Research InstitutionHokkaido University

Principal Investigator

木村 淳夫  Hokkaido University, 大学院・農学研究院, 教授 (90186312)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 奥山 正幸  北海道大学, 大学院・農学研究院, 助教 (00344490)
Keywords糖転移 / 構造因子 / 分子解析
Research Abstract

糖質酵素が触媒する糖転移作用を制御できる新しい現象を3つ見出した。すなわち、1)長鎖オリゴ糖を生産する新規な転移酵素、2)触媒水の結合部位、3)受容体の結合部位、である。本研究の目的は、これらの現象を解析し、転移作用の分子機構を知り、応用研究に結びつけることにある。具体的には、i)それぞれの現象から「糖転移を支配する構造因子(蛋白質の部分構造)」の決定;ii)その機能の機構究明;iii)構造因子を他の酵素に移植;iv)有用な機能の利用、である。糖転移反応の改良・開発は要求が強いため、応用研究への発展を図る。計画は順調に進行しており、次の研究成果を得た。
長鎖オリゴ糖の生産酵素:1)酵素の結晶化とX線結晶構造解析:結晶化条件を検討した結果、良好な条件を確定でき、X線構造解析に使用できる結晶を得ることに成功した。立体構造を解析中である。2)構造因子の決定:長鎖オリゴ糖生成に関わる構造因子を相同酵素の立体構造から予想し、アミノ酸変異を導入した。触媒サイトにある芳香族残基の置換で糖転移活性が低下し、親酵素で僅かであった加水分解反応が上昇した。従って本残基が構造因子の1つと推定した。また他の候補として触媒部位から遠位にあるループに対する解析を行っている。触媒水の結合部位:3)小さな構造変化の導入:DDaseの立体構造から候補のアミノ酸を選び変異導入したが、加水分解と転移の両活性が減少した。本置換は触媒サイト内の他の残基にも影響を及ぼすと考えられた。受容体の結合部位:4)応用研究への発展:受容体結合サイトの改変で、生成オリゴ糖の構造を制御できることを示すため検討を行った。ハナバチ酵素と長鎖オリゴ糖生成酵素では実験を継続中であるが、糸状菌α-グルコシダーゼの受容体結合サイトに対する変異導入で、親酵素が生成しないオリゴ糖の生産が認められた。本オリゴ糖の構造を解析している。

  • Research Products

    (31 results)

All 2010 2009

All Journal Article (5 results) (of which Peer Reviewed: 5 results) Presentation (26 results)

  • [Journal Article] Construction of a fusion enzyme of dextransucrase and dextranase : Application for one-step synthesis of isomalto-oligosaccharides2009

    • Author(s)
      Kim YM
    • Journal Title

      Enzyme Microb Technol VOL.44

      Pages: 159-164

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Structural comparison of Streptococcus mutans dextran glucosidase with glucoside hydrolases in GH132009

    • Author(s)
      Hondoh H
    • Journal Title

      J Appl Glycosci VOL.56

      Pages: 111-117

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Catalytic mechanism of retaining α-galactosidase belonging to glycoside hydrolase family 972009

    • Author(s)
      Okuyama M
    • Journal Title

      J Mol Biol VOL.392

      Pages: 1232-1241

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] The first α-1, 3-glucosidase from bacterial origin belonging to glycoside hydrolase family 312009

    • Author(s)
      Kang MS
    • Journal Title

      Biochimie VOL.91

      Pages: 1434-1442

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Catalytic reaction mechanism based on α-secondary deuterium isotope effects in hydrolysis of trehalose by European honeybee trehalase2009

    • Author(s)
      Mori H
    • Journal Title

      Biosci Biotechnol Biochem VOL.73

      Pages: 2466-2473

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] α-グリコシダーゼの機能と構造に関する研究2010

    • Author(s)
      奥山正幸
    • Organizer
      日本農芸化学会2010年度大会
    • Place of Presentation
      東京大学(東京都)
    • Year and Date
      2010-03-28
  • [Presentation] Oligo-1, 6-glucosidaseの変異導入によるCI^-イオン依存型への改変2010

    • Author(s)
      寺田正明
    • Organizer
      日本農芸化学会2010年度大会
    • Place of Presentation
      東京大学(東京都)
    • Year and Date
      2010-03-28
  • [Presentation] 大腸菌組換えデキストリンデキストラナーゼのオリゴ糖に対する作用と触媒アミノ酸残基の解析2010

    • Author(s)
      貞廣樹里
    • Organizer
      日本農芸化学会2010年度大会
    • Place of Presentation
      東京大学(東京都)
    • Year and Date
      2010-03-28
  • [Presentation] GH family 31 α-グルコシダーゼにおける基質の鎖長認識機構の解明2010

    • Author(s)
      田上貴祥
    • Organizer
      日本農芸化学会2010年度大会
    • Place of Presentation
      東京大学(東京都)
    • Year and Date
      2010-03-28
  • [Presentation] Bacillus circulans T-3040株由来環状イソマルトオリゴ糖グルカノトランスフェラーゼの機能性領域の解析2010

    • Author(s)
      舟根和美
    • Organizer
      日本農芸化学会2010年度大会
    • Place of Presentation
      東京大学(東京都)
    • Year and Date
      2010-03-28
  • [Presentation] Effects of His-579 and Glu-580 on catalytic activity of cycloisomaltooligosaccharide glucanotransferase from Bacillus circulans T-30402010

    • Author(s)
      Kang HK
    • Organizer
      日本農芸化学会2010年度大会
    • Place of Presentation
      東京大学(東京都)
    • Year and Date
      2010-03-28
  • [Presentation] 環状イソマルトオリゴ糖グルカノトランスフェラーゼの結晶構造解析2010

    • Author(s)
      藤本瑞
    • Organizer
      日本農芸化学会2010年度大会
    • Place of Presentation
      東京大学(東京都)
    • Year and Date
      2010-03-28
  • [Presentation] オオムギβ-アミラーゼの澱粉粒への吸着および分析解に関する研究2009

    • Author(s)
      原口慶子
    • Organizer
      日本農芸化学会北海道支部平成21年度第二回合同学術講演会
    • Place of Presentation
      とかちプラザ(帯広市)
    • Year and Date
      2009-11-08
  • [Presentation] 糖質加水分解酵素ファミリー97酵素の配列類似性と機能類似性の関係2009

    • Author(s)
      奥山正幸
    • Organizer
      日本農芸化学会北海道支部平成21年度第二回合同学術講演会
    • Place of Presentation
      とかちプラザ(帯広市)
    • Year and Date
      2009-11-08
  • [Presentation] α-1,3グルコシド結合に高い特異性を示すα-glucosidase取得2009

    • Author(s)
      小林和之
    • Organizer
      日本農芸化学会北海道支部平成21年度第二回合同学術講演会
    • Place of Presentation
      とかちプラザ(帯広市)
    • Year and Date
      2009-11-08
  • [Presentation] 加水分解反応の抑制によりトレハロースを縮合蓄積させるトレハラーゼ変異酵素2009

    • Author(s)
      牧孝多朗
    • Organizer
      日本農芸化学会北海道支部平成21年度第二回合同学術講演会
    • Place of Presentation
      とかちプラザ(帯広市)
    • Year and Date
      2009-11-08
  • [Presentation] アズキ発芽種子由来D-酵素(VaDPE1)のマルトオリゴ糖に対する作用と一次構造の解析2009

    • Author(s)
      田中良幸
    • Organizer
      日本農芸化学会北海道支部平成21年度第二回合同学術講演会
    • Place of Presentation
      とかちプラザ(帯広市)
    • Year and Date
      2009-11-08
  • [Presentation] 変異導入によるisomaltooligosaccharide 6-α-glucosyltransferaseの基質特異性の完全改変:α-1,6結合認識をα-1,4結合認識に変換2009

    • Author(s)
      西村崇志
    • Organizer
      日本農芸化学会北海道支部平成21年度第二回合同学術講演会
    • Place of Presentation
      とかちプラザ(帯広市)
    • Year and Date
      2009-11-08
  • [Presentation] Streptococcus mutans由来dextran glucosidaseの部位特異的変異導入による糖転移活性の改変(1)2009

    • Author(s)
      本同宏成
    • Organizer
      平成21年度日本応用糖質科学会大会(第58回)
    • Place of Presentation
      弘前大学(弘前市)
    • Year and Date
      2009-09-16
  • [Presentation] Streptococcus mutans由来dextran glucosidaseの部位特異的変異導入による糖転移活性の改変(2)2009

    • Author(s)
      中塚大地
    • Organizer
      平成21年度日本応用糖質科学会大会(第58回)
    • Place of Presentation
      弘前大学(弘前市)
    • Year and Date
      2009-09-16
  • [Presentation] isomaltooligosaccharide 6-α-glucosyltransferaseの糖転移反応に関わる構造因子2009

    • Author(s)
      西村崇志
    • Organizer
      平成21年度日本応用糖質科学会大会(第58回)
    • Place of Presentation
      弘前大学(弘前市)
    • Year and Date
      2009-09-16
  • [Presentation] Improving activity of honeybee α-glucosidase III by substitution of Q349 and L350 position2009

    • Author(s)
      Ngiwsara L
    • Organizer
      平成21年度日本応用糖質科学会大会(第58回)
    • Place of Presentation
      弘前大学(弘前市)
    • Year and Date
      2009-09-16
  • [Presentation] テンサイα-glucosidaseのサブサイト+2および+3の形跡に重要なアミノ酸残基の決定2009

    • Author(s)
      田上貴祥
    • Organizer
      平成21年度日本応用糖質科学会大会(第58回)
    • Place of Presentation
      弘前大学(弘前市)
    • Year and Date
      2009-09-16
  • [Presentation] Bacteroides thetaiotaomicron由来SusBの触媒反応におけるCa^<2+>の役割2009

    • Author(s)
      吉田拓弥
    • Organizer
      平成21年度日本応用糖質科学会大会(第58回)
    • Place of Presentation
      弘前大学(弘前市)
    • Year and Date
      2009-09-16
  • [Presentation] Preliminary structure determination of polysaccharide extract from Rhizobium sp.2009

    • Author(s)
      Wongchawalit J
    • Organizer
      平成21年度日本応用糖質科学会大会(第58回)
    • Place of Presentation
      弘前大学(弘前市)
    • Year and Date
      2009-09-16
  • [Presentation] Dextrin dextranase and glucoamylase share the same active site structure in spite of different catalytic mechanisms2009

    • Author(s)
      Sadahiro J
    • Organizer
      15th European Carbohydrate Symposium
    • Place of Presentation
      University of Vienna(Vienna, Austria)
    • Year and Date
      2009-07-23
  • [Presentation] Transglucosylation pattern of wild-type and specificity-altered dextran glucosidase2009

    • Author(s)
      Hondoh H
    • Organizer
      15th European Carbohydrate Symposium
    • Place of Presentation
      University of Vienna(Vienna, Austria)
    • Year and Date
      2009-07-23
  • [Presentation] Specificity element recognizing long-chain substrates in GH family 31 α-glucosidase derived from sugar beet(Beta vulgaris L.)2009

    • Author(s)
      Tagami T,
    • Organizer
      8th Carbohydrate Bioengineering Meeting
    • Place of Presentation
      Congress Center(Naples, Italy)
    • Year and Date
      2009-05-12
  • [Presentation] Chemical rescue and glycosynthase reactions derived from nucleophile mutant of Lactobacillus johnsonii α-glucosidase2009

    • Author(s)
      Kang MS
    • Organizer
      8th Carbohydrate Bioengineering Meeting
    • Place of Presentation
      Congress Center(Naples, Italy)
    • Year and Date
      2009-05-12
  • [Presentation] Recognition of α-1, 4-glucosidic linkage in specificity-altered dextran glucosidase2009

    • Author(s)
      Hondoh H
    • Organizer
      8th Carbohydrate Bioengineering Meeting
    • Place of Presentation
      Congress Center(Naples, Italy)
    • Year and Date
      2009-05-12
  • [Presentation] Preliminary structure determination of water insoluble polysaccharied extracted from soil bacteria2009

    • Author(s)
      Wongchawalit J
    • Organizer
      8th Carbohydrate Bioengineering Meeting
    • Place of Presentation
      Congress Center(Naples, Italy)
    • Year and Date
      2009-05-11

URL: 

Published: 2011-06-16   Modified: 2016-04-21  

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