2008 Fiscal Year Annual Research Report
超高速シーケンシング法による三日熱マラリア原虫近縁サルマラリア原虫のゲノム解読
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20390120
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| Research Institution | Osaka University |
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Principal Investigator |
田辺 和裄 Osaka University, 微生物病研究所, 特任教授 (40047410)
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| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
安永 照雄 大阪大学, 微生物病研究所, 教授 (20260630)
川合 覚 獨協医科大学, 医学部, 准教授 (70275733)
早川 敏之 大阪大学, 微生物病研究所, 特任助教 (80418681)
澤井 裕美 大阪大学, 微生物病研究所, 特任研究員 (60377124)
遠山 知子 大阪大学, 微生物病研究所, 特任研究員 (40456934)
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| Keywords | ゲノム解読 / Plasmodium cynomolgi / Plasmodium vivax / 三日熱マラリア原虫 / 比較ゲノム解析 / マラリア / サルマラリア原虫 / 進化 |
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| Research Abstract |
1.三日熱マラリア原虫(Plasmodium vivax)によって引き起こされる三日熱マラリアは、世界で毎年約8千万人が感染している。原虫の培養法が未確立なこともありP.vivaxの研究は遅れている。本研究ではP.vivaxに系統進化的に最も近縁なマカクサルマラリア原虫P.cynomolgiのゲノムを超高速シーケンシング法により解読し、ゲノム比較から、P.vivaxゲノムに独自な特徴、ヒト寄生化の遺伝的基盤を解明することを目指している。
2. P. vivaxがマカクサルに感染しないかどうかを調べた。P. vivax Sal-II株の凍結原虫を脾摘ニホンザル(Macaca fuscata)、カニクイザル(M. fasculata)に静注し、感染の成立をPCR診断で見たところ、感染が認められなかった。
3.ニホンザル(M. fuscata)にP. cynomolgi B株を感染させることに成功し、感染サルから原虫を得た。原虫ゲノムDNAを調製し、超高速シーケンシングシステム(GS FLX法)によって平均リード長250塩基、総塩基107Mb、冗長度約3.7倍、ゲノムの約8割をカバーするシーケンスを得た。
4.得られたリード群を阪大微研ゲノム情報解析分野の並列ワークステーションを使用してコンティグを作成し、P. vivax, P. knowlesiのゲノム情報を参照にP. cynomolgiのゲノム地図を作成した。
5.リードはP. vivax, P. knowlesiの遺伝子の大部分(約5千個)にマッピングできた。しかし、抗原変異に関与すると考えられているpir遺伝子群(P. vivaxのvir, P. knowlesiのSICAvar, kir)やPv-fam遺伝子群など、多重遺伝子族ではマップされていな箇所もあり、種間における遺伝子の欠失・挿入が示唆された。
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[Journal Article] Failure to detect Plasmodium vivax in West and Central Africa by PCR species typing2008
Author(s)
R. Cullelon, T. Mita, M, Ndounga, H. Unger, P. Cravo, G. Paganotti, N, Takahashi, A. Kaneko, H. Eto, H. Tinto, C. Karema, U. D'Alessandro, V. do Rosario, T. Kobayakawa, F. Ntoumi, R. Carter, K, Tanabe
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Journal Title
Malaria Journal 7
Pages: 174
Peer Reviewed
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[Presentation] アジアマカクマラリア原虫Plasmodium cynomolgiのゲノム解読2009
Author(s)
橘真一郎, 川合覚, 後藤直久, 中村昇太, 片貝祐子, 深井裕美, 東岸任弘, 北潔, 保富康宏, 堀井俊宏, 安永照雄, 田邉和裄
Organizer
第78回日本寄生虫学会大会
Place of Presentation
東京
Year and Date
2009-03-28
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