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2009 Fiscal Year Annual Research Report

石油流出時における日本沿岸環境プラスミドの海洋生態系に及ぼす影響評価手法の開発

Research Project

Project/Area Number 20510021
Research InstitutionIbaraki University

Principal Investigator

久留主 泰朗  Ibaraki University, 農学部, 教授 (60272118)

Keywordsプラスミド / Sphingomonad / Pseudomonas / 炭化水素分解遺伝子 / 16SrRNA
Research Abstract

今年度は,昨年度に引き続き、日本海側と太平洋側の3地点を設定し、日本海側は富山湾、太平洋側は東京湾と茨城県鹿島沖に観測定点を設置し、さらに季節変動を考慮し、3月と9月に試料採取を実施した。分離方法は、各測定地点の表層海水をサンプリングし、その後の炭化水素分解菌の純粋分離に供したで分離し、その系統解析と保有プラスミドの調査を行った。3海域からそれぞれ分離した炭化水素分解菌について16SrRNA遺伝子配列に基づいた系統解析結果を比較すると、各サンプリング時期または各海域から普遍的に分離された系統群はみられなかった。期間中に対象海域とその周辺で目立った石油の流出等環境中の炭化水素濃度に大きな変化は発生していないため、分離された系統群は年度を限定せずに検出可能な割合で生存していると思われる。また16SrRNA配列において既存種との相同性の低く、新種の可能性がある株を分離した。分離株の系統群において、既に炭化水素分解性が報告されている系統群は11群だった。また炭化水素分解能の報告のない系統群もいくつか分離した。アガロースゲル電気泳動により確認できたプラスミドは、大型プラスミドを25個、小型プラスミド10個あった。このうちPseudomonasについては既に炭化水素分解遺伝子群の確認されているプラスミドが報告されているが、Sphingomonadは全ゲノムが解読されている種から染色体上に炭化水素分解遺伝子群が確認されている。今後は、今年度確認された大型プラスミドについて炭化水素分解遺伝子群の検出試験を行う。

  • Research Products

    (4 results)

All 2009 Other

All Presentation (3 results) Remarks (1 results)

  • [Presentation] Sphingomonas 属細菌群を宿主とする高発現ベクターの構築2009

    • Author(s)
      福田敦史, 林宏恵, 久留主泰朗
    • Organizer
      第32回日本分子生物学会年会
    • Place of Presentation
      横浜市、パシフィコ横浜
    • Year and Date
      20091209-20091212
  • [Presentation] Sphingomonas 属細菌由来プラスミドの宿主内分配機構の解析2009

    • Author(s)
      大森孟道, 雄長誠, 林宏恵, 久留主泰朗
    • Organizer
      第32回日本分子生物学会年会
    • Place of Presentation
      横浜市、パシフィコ横浜
    • Year and Date
      20091209-20091212
  • [Presentation] Characterization of Novel Plasmids from Sphingomonad2009

    • Author(s)
      Kurusu Y, Ochou M, Saito M
    • Organizer
      ASM General 109^<th> Meeting
    • Place of Presentation
      Philadelphia, USA
    • Year and Date
      20090517-20090521
  • [Remarks]

    • URL

      http://info.ibaraki.ac.jp/scripts/websearch/index.htm

URL: 

Published: 2011-06-16   Modified: 2016-04-21  

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