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2008 Fiscal Year Annual Research Report

シロイヌナズナ無細胞転写解析法による光依存転写機構の解析

Research Project

Project/Area Number 20510188
Research InstitutionNagoya City University

Principal Investigator

湯川 泰  Nagoya City University, 大学院・システム自然科学研究科, 准教授 (70381902)

Keywordsシロイヌナズナ / 転写 / 無細胞系 / 光依存制御 / MM2d株 / 培養細胞 / 液胞除去 / 光合成
Research Abstract

真核生物の遺伝子の発現制御は主に転写レベルで行われている。現在、植物における遺伝子転写制御に関する分子生物学的知見は、in vitroで転写を解析できる手法の欠如ゆえ極めて乏しい。本研究では、顕花植物でポストゲノム情報および遺伝学的資産の整った、シロイヌナズナ(Arabidopsis thaliana)由来の無細胞転写系開発を目的としている。
シロイヌナズナは植物体が小さいという弱点を克服するため、本研究では材料として増殖の速い培養細胞(MM2d細胞)を用いることにした。まず始めに、MM2d細胞の培養条件を検討した結果、培地組成はタバコ培養細胞BY-2株に用いていた組成が成長速度および細胞の状態において良好であった。培養時間は4日間で200gの細胞を調製し、その後の実験に用いることにした。MM2d細胞は懸濁培養液中で小さな塊を作るため、プロトプラスト調製に必要な時間を延ばすことで効率化を図った。続いて、プロトプラストからの核を単離する際に必要な条件を検討した。細胞破砕法として、ナイロンメッシュおよびダウンスホモジナイザーを試したが、前者の結果が良好であった。単離した核から可溶性画分を抽出して、シロイヌナズナのU2snRNA遺伝子を用いて、Pol II依存の転写活性を検出することにより転写活性を検定した。検出法は、in vitroで合成されたU2snRNAに対する蛍光標識プライマーを作成し、逆転写により放射性同位元素を用いずに行った。当初は、実際に活性を検出するに至なかったが、プロトプラストからさらに液胞を除去することによって弱いながら転写活性を検出した。これらの結果は大きな前進であり、今後をさらに詳細に条件を検討することによって、比較的容易に活性向上を図れることを意味する。したがって、引き続き活性向上に努め、最終目標である光依存的な転写制御の解析を実現する。

  • Research Products

    (6 results)

All 2009 2008

All Presentation (6 results)

  • [Presentation] タバコ葉緑体翻訳反応における 5'非翻訳領域とコード領域の適合性検証2009

    • Author(s)
      大羽 由衣, 湯川 眞希, 杉浦昌弘, 湯川 泰
    • Organizer
      日本植物生理学会第50回年会
    • Place of Presentation
      名古屋
    • Year and Date
      2009-03-22
  • [Presentation] 葉緑体psbD-psbC翻訳開始機構の解析2008

    • Author(s)
      足達 由佳, 黒田 洋詩, 杉浦昌弘, 湯川 泰
    • Organizer
      第31回日本分子生物学会年会 第81回日本生化学会大会 合同大会
    • Place of Presentation
      神戸
    • Year and Date
      2008-12-10
  • [Presentation] イネ新規non-coding RNA の探索2008

    • Author(s)
      西田 満帆, 杉浦 昌弘, 湯川 泰
    • Organizer
      第31回日本分子生物学会年会 第81回日本生化学会大会 合同大会
    • Place of Presentation
      神戸
    • Year and Date
      2008-12-09
  • [Presentation] シロイヌナズナ培養細胞核由来の in vitro転写系の開発2008

    • Author(s)
      岩田 真也, 杉浦 昌弘, 湯川 泰
    • Organizer
      第31回日本分子生物学会年会 第81回日本生化学会大会 合同大会
    • Place of Presentation
      神戸
    • Year and Date
      2008-12-09
  • [Presentation] 葉緑体 in vitro翻訳系を用いた翻訳機構の解析2008

    • Author(s)
      黒田 洋詩, 湯川 眞希, 鈴木晴香, 湯川 泰, 杉浦 昌弘
    • Organizer
      大阪大学蛋白質研究所セミナー国際シンポジウム「葉緑体のすべてに迫る」
    • Place of Presentation
      大阪
    • Year and Date
      2008-10-14
  • [Presentation] シロイヌナズナ培養細胞核由来の in vitro転写系の開発2008

    • Author(s)
      岩田 真也, 杉浦 昌弘, 湯川 泰
    • Organizer
      日本遺伝学会第80回大会
    • Place of Presentation
      名古屋
    • Year and Date
      2008-09-05

URL: 

Published: 2010-06-11   Modified: 2016-04-21  

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