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2008 Fiscal Year Annual Research Report

RNA上に構築された色素ナノ組織体による光電変換システム

Research Project

Project/Area Number 20550129
Research InstitutionUniversity of Hyogo

Principal Investigator

中村 光伸  University of Hyogo, 大学院・工学研究科, 准教授 (50285342)

KeywordsRNA / π-アレイ / 自己組織化 / 光物性 / ナノ組織体 / 光電変換
Research Abstract

20年度は複数の色素分子(ピレン)を導入したRNA核酸の自己組織化により、RNAらせん状にピレン分子同士がπ電子のスタッキング構造を有するピレンアレイの構築を試み、その結果、下記の(1)〜(4)の成果を得た。
1.RNA自己組織化によるピレンアレイの構造制御:相補的な塩基配列を有する2つのマルチピレン修飾RNAをらせん形成させることにより、核酸のらせん軸に沿ってジッパー型のピレンアレイを構築することに成功した。さらにこのジッパー型ピレンアレイは温度により可逆的に構造を制御できることを明らかにした。
2.ピレンアレイの構造解析:吸収スペクトル、円二色性スペクトル測定よりピレン分子が二重らせんの外側に位置し、らせんに沿って一次元的にπ-スタッキングを介して会合していることを明らかにした。
3.ピレンアレイ蛍光挙動:RNA核酸上に構築されたピレンアレイは強いピレンエキシマー蛍光を示すことを見出した。ピレンエキシマー蛍光強度は導入するピレンの数に比例して増大すること、また発光波長がシフトすることを明らかにした。
4.ピレンアレイ蛍光消光過程:ピレンアレイから発せられるエキシマー蛍光はメチルビオロゲンにより電子移動消光され、その消光速度定数はピレンのモノマー蛍光よりも大きく、さらにピレンの増加に伴って消光速度定数も増加した。この結果は励起エネルギーがピレンアレイ上で非局在化していることを意味しており、高効率の光電変換システムへの応用が期待できる。

  • Research Products

    (17 results)

All 2009 2008 Other

All Journal Article (7 results) (of which Peer Reviewed: 7 results) Presentation (9 results) Remarks (1 results)

  • [Journal Article] Electronic detection of DNA mutation based on strand exchange reaction2009

    • Author(s)
      M. Watanabe, S. Kumamoto, M. Nakamura, K. Yamana
    • Journal Title

      Bioorganic and Medicinal Chemistry 17

      Pages: 1494-1497

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Zipper-like assembly of multi-pyrenes covalently attached to RNA sequenccs via duplex formation2008

    • Author(s)
      M. Nakamura, Y. Murakami, K. Yamana
    • Journal Title

      Nucleic Acids Research Symposium Series 52

      Pages: 707-708

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Efficient quenching of the excimer fluorescence derived from pyrene arrays on RNA duplexes2008

    • Author(s)
      K. Maie, M. Nakamura, K. Yamana
    • Journal Title

      Nucleic Acids Research Symposium Series 52

      Pages: 705-706

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Pyrene-Zipper Array Assembled via RNA Duplex Formation2008

    • Author(s)
      M. Nakamura, Y. Murakami, K. Sasa, H. Hayashi, K. Yamana
    • Journal Title

      J. Am. Chem. Soc. 130

      Pages: 6904-6905

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Target-induced strand release (TISR) from aptamer-DNA duplex : A general strategy for electronic detection of biomolecules ranging from asmall molecule to a large protein2008

    • Author(s)
      J. Yoshizumi, S. Kumamoto, M. Nakamura, K. Yamana
    • Journal Title

      The Analyst 132

      Pages: 323-325

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] 2'-Anthraquinone Conjugated Oligonucleotide as an Electrochemical Probe for DNA Mismatch2008

    • Author(s)
      S. Kumamoto, M. Watanabe, N. Kawakami, M. Nakamura, K. Yamana
    • Journal Title

      Bioconjug 19

      Pages: 65-69

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Bis-Pyrene-Labeled Molecular Beacon : A Monomer-Excimer Switching Probe for the Detection of DNA Base Alteration2008

    • Author(s)
      Y. Ohshita, Y. Fukunaga, M. N akamura, K. Yamana
    • Journal Title

      Bioorganic and Medicinal Chemistry 16

      Pages: 78-83

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] RNA二本鎖上に構築されたピレン会合体2009

    • Author(s)
      福田稔、真家賢治、中村光伸、高田忠雄、山名一成
    • Organizer
      日本化学会第89春季年会
    • Place of Presentation
      船橋
    • Year and Date
      20090327-20090330
  • [Presentation] ピレン修飾三リン酸誘導体の合成と評価2009

    • Author(s)
      谷水陽介、高田忠雄、中村光伸、山名一成
    • Organizer
      日本化学会第89春季年会
    • Place of Presentation
      船橋
    • Year and Date
      20090327-20090330
  • [Presentation] 光脱離性保護基を利用したDNA連結反応2009

    • Author(s)
      河野裕太、高田忠雄、中村光伸、山名一成
    • Organizer
      日本化学会第89春季年会
    • Place of Presentation
      船橋
    • Year and Date
      20090327-20090330
  • [Presentation] フェロセン共役核酸塩基の合成と性質2009

    • Author(s)
      長谷川裕介、高田忠雄、中村光伸、山名一成
    • Organizer
      日本化学会第89春季年会
    • Place of Presentation
      船橋
    • Year and Date
      20090327-20090330
  • [Presentation] 電子ドナー、アクセプター修飾RNAの合成と性質2009

    • Author(s)
      真家賢治、中村光伸、高田忠雄、山名一成
    • Organizer
      日本化学会第89春季年会
    • Place of Presentation
      船橋
    • Year and Date
      20090327-20090330
  • [Presentation] ポリメラーゼ伸長反応によるDNAの光機能化2009

    • Author(s)
      渡辺小百合、高田忠雄、中村光伸、山名一成
    • Organizer
      日本化学会第89春季年会
    • Place of Presentation
      船橋
    • Year and Date
      20090327-20090330
  • [Presentation] レドックス修飾DNAアプタマー固定化チップによる生体分子の電気化学検出2009

    • Author(s)
      林英理子, 高田忠雄, 中村光伸, 山名一成
    • Organizer
      日本化学会第8 9春季年会
    • Place of Presentation
      船橋
    • Year and Date
      2009-03-27
  • [Presentation] RNAに固定化したドナー・アクセプター間の光誘起電子移動2008

    • Author(s)
      真家賢治、高田忠雄、中村光伸、山名一成
    • Organizer
      第3回バイオ関連化学合同シンポジウム
    • Place of Presentation
      横浜
    • Year and Date
      20080918-20080920
  • [Presentation] RNA二重らせん形成により構築されるピレンアレイの蛍光特性2008

    • Author(s)
      中村光伸、村上陽平、山名一成
    • Organizer
      光化学討論会
    • Place of Presentation
      堺
    • Year and Date
      20080911-20080913
  • [Remarks]

    • URL

      http://www.eng.u-hyogo.ac.jp/msc/msc1/Yamana-group/index.htm

URL: 

Published: 2010-06-11   Modified: 2016-04-21  

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