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2009 Fiscal Year Annual Research Report

湿度・温度に依存した構造転移における単結晶構造解析システムの開発

Research Project

Project/Area Number 20560015
Research InstitutionKitasato University

Principal Investigator

山村 滋典  Kitasato University, 理学部, 助教 (40286373)

Keywords湿度・温度 / 構造転移 / 水和物 / 結晶構造解析 / 生体分子 / ヌクレオチド / タンパク質
Research Abstract

報告者は、生体分子結晶等における湿度や温度に依存した水和構造の変化を、単結晶構造解析により原子レベルで解明するシステムの開発を目指している。温度、湿度の目標設定範囲は、温度:5~80℃、相対湿度:0~100%である。今年度は、X線回折装置に組み込んだシステムの室温(25℃)下での動作検証を行い、生体分子結晶としてタンパク質の一種であるタウマチンの正方晶を用いて、相対湿度2~95%での構造変化の追跡に成功した。
タウマチンは、分子量約22000、アミノ酸207残基からなり、結晶化条件により正方晶、六方晶、斜方晶、単斜晶が得られ、正方晶は湿度依存性が示唆されている。室温(25℃)下、相対湿度(rh)を95%から徐々に下げて格子定数の変化を追跡したところ、60%rh付近でa軸長が約59Åから8%程度減少(c軸長は約152から1%程度増加)するという大きな変化が見られ、その後も40%rh付近まで徐々にa軸長のみが減少することを見出した。40%rh以下では結晶性の低下により格子定数の決定には至らなかった。また、結晶の含水量は95%rhで59%程度と見積もられ、60%rhでは約14%減少、40%rhではさらに約6%減少したと推定された。既に報告されている相転移前の結晶構造では、c軸方向にタンパク質分子が蜜に配列しているのに対し、a軸方向にはタンパク質分子間に結晶水の領域が見られており、本研究で見出した格子定数の変化を解釈可能であることが分かった。

  • Research Products

    (9 results)

All 2010 2009

All Journal Article (1 results) (of which Peer Reviewed: 1 results) Presentation (8 results)

  • [Journal Article] Influence of magnetic field upon the conductance of a unicomponent crystal of a tetrathiafulvalene-based nitronyl nitroxide2010

    • Author(s)
      H.Komatsu, M.M.Matsushita, S.Yamamura, Y.Sugawara, K.Suzuki, T.Sugawara
    • Journal Title

      J.Am.Chem.Soc. 132(in press)

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] DNA・RNA構成分子の水和結晶中での水分子のゆらぎの解析2010

    • Author(s)
      菅原洋子、山村滋典
    • Organizer
      第1回MLFシンポジウム(依頼講演)
    • Place of Presentation
      いばらき量子ビーム研究センター(茨城県)
    • Year and Date
      2010-03-30
  • [Presentation] DNA・RNA構成分子の水和結晶中で水分子の動きを中性構造解析で見る2010

    • Author(s)
      山村滋典、菅原洋子
    • Organizer
      茨城県中性子ビームライン成果報告会(依頼講演)
    • Place of Presentation
      東京国際展示場(東京都)
    • Year and Date
      2010-02-18
  • [Presentation] ウシ膵臓由来β-トリプシンの新規菱面体晶の結晶構造解析2009

    • Author(s)
      奥田悠介、山村滋典、菅原洋子
    • Organizer
      日本結晶学会平成21年度年会
    • Place of Presentation
      関西学院大学(兵庫県)
    • Year and Date
      20091205-20091206
  • [Presentation] アデノシン5'-一リン酸二ナトリウム水和物における温度-湿度依存相転移2009

    • Author(s)
      高柳敬介、山村滋典、菅原洋子
    • Organizer
      日本結晶学会平成21年度年会
    • Place of Presentation
      関西学院大学(兵庫県)
    • Year and Date
      20091205-20091206
  • [Presentation] アデノシン5'-二リン酸一カリウム塩における二水和物-無水物間の相対湿度に依存した可逆的結晶構造転移2009

    • Author(s)
      穴井佑弥、山村滋典、菅原洋子
    • Organizer
      日本結晶学会平成21年度年会
    • Place of Presentation
      関西学院大学(兵庫県)
    • Year and Date
      20091205-20091206
  • [Presentation] 新規なRNaseA単斜晶の構造決定と結晶多形の解析2009

    • Author(s)
      田草川英昇、山村滋典、猿渡茂、菅原洋子、中迫雅由
    • Organizer
      日本結晶学会平成21年度年会
    • Place of Presentation
      関西学院大学(兵庫県)
    • Year and Date
      2009-12-06
  • [Presentation] ウリジン5'-一リン酸二ナトリウム水和物にみられる構造の乱れと相対湿度に依存した構造転移2009

    • Author(s)
      長谷川啓太、山村滋典、菅原洋子
    • Organizer
      日本結晶学会平成21年度年会
    • Place of Presentation
      関西学院大学(兵庫県)
    • Year and Date
      2009-12-06
  • [Presentation] グアノシン5'-一リン酸二ナトリウム水和物における湿度に依存した結晶構造変化2009

    • Author(s)
      山村滋典、室伏晃空、菅原洋子
    • Organizer
      第18回有機結晶シンポジウム
    • Place of Presentation
      東京大学(東京都)
    • Year and Date
      2009-11-09

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Published: 2011-06-16   Modified: 2016-04-21  

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