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2010 Fiscal Year Annual Research Report

湿度・温度に依存した構造転移における単結晶構造解析システムの開発

Research Project

Project/Area Number 20560015
Research InstitutionKitasato University

Principal Investigator

山村 滋典  北里大学, 理学部, 講師 (40286373)

Keywords湿度・温度 / 構造転移 / 水和物 / 結晶構造解析 / 生体分子 / ヌクレオチド / タンパク質
Research Abstract

本研究は、生体分子結晶等における湿度や温度に依存した水和構造の変化を、単結晶構造解析により原子レベルで解明するシステムの開発を目的としている。今年度までに、回折装置に取り付けた単結晶に温度、湿度を調節した空気を吹き付けることで、温度、湿度制御下(設定範囲;温度:5~80℃、相対湿度:0~100%)での単結晶回折実験を実現可能とした。また、本システムを生体分子結晶である二種のタンパク質に適用し湿度依存性を明らかにした。
タンパク質結晶として、トリプシン(分子量23000、残基数223)について斜方晶低密度型(含水量58%)、斜方晶高密度型(含水量47%)、三方晶(含水量40%)の3晶形、および、キシラナーゼ(分子量20800、残基数190)について単斜晶(分子量20800、残基数190、含水量38%)を用い、振動写真法により湿度依存性を追跡した。トリプシンは、相対湿度を90%付近から下げていくと、斜方晶低密度型、高密度型では相対湿度70%付近で微結晶化し結晶性が低下した。三方晶では相対湿度60%付近で単結晶性は保持しているが回折強度が弱くなり結晶性の低下が見られた。三方晶については、その後相対湿度を90%に上げたが結晶性は戻らず不可逆な湿度依存性を示した。一方、キシラナーゼは、相対湿度を95%付近から下げると、相対湿度60%付近で結晶性の低下が見られたが、その後相対湿度を90%とすると結晶性が回復した。今回対象としたタンパク質は、乾燥により結晶性が失われるものであったが、湿潤に対して不可逆な場合と可逆な場合が存在した。

  • Research Products

    (9 results)

All 2011 2010

All Journal Article (1 results) (of which Peer Reviewed: 1 results) Presentation (8 results)

  • [Journal Article] New monoclinic form of bovine pancreatic ribonuclease A from a salt solution and comparison of intermolecular interactions in ribonucleases A2011

    • Author(s)
      H.Takusagawa, S.Yamamura, S.Endo, Y.Sugawara, T.Inagaki, M.Nakasako
    • Journal Title

      J.Cryst.Growth

      Volume: 319 Pages: 49-56

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] ウリジンヌクレオチド水和物結晶における疑似多形の解析2011

    • Author(s)
      穴井佑弥、山村滋典、菅原洋子
    • Organizer
      日本化学会第91回春季年会
    • Place of Presentation
      神奈川大学(神奈川県)
    • Year and Date
      2011-03-27
  • [Presentation] タンパク質結晶多形における分子間相互作用の解析2011

    • Author(s)
      奥田悠介、田草川英昇、山村滋典、猿渡茂、菅原洋子
    • Organizer
      日本物理学会第66回年次大会
    • Place of Presentation
      新潟大学(新潟県)
    • Year and Date
      2011-03-26
  • [Presentation] 茨城県生命物質構造解析装置iBIXによるウリジン5'-一リン酸ニナトリウム七水和物の中性子結晶構造解析2010

    • Author(s)
      山村滋典、菅原洋子、日下勝弘、山田太郎、大原高志、田中伊知朗
    • Organizer
      日本中性子科学会第10回年会
    • Place of Presentation
      東北大学(宮城県)
    • Year and Date
      2010-12-11
  • [Presentation] SPring-8/BL19B2に導入された湿度可変粉末回折装置によるグアノシン水和物の構造転移の観測2010

    • Author(s)
      山村滋典、三浦圭子、菅原洋子
    • Organizer
      日本結晶学会平成22年度年会
    • Place of Presentation
      大阪大学(大阪府)
    • Year and Date
      2010-12-05
  • [Presentation] SPring-8/BL19B2に導入した粉末回折その場脱水・水和転移実験のための湿度可変装置2010

    • Author(s)
      三浦圭子、大坂恵一、山村滋典、菅原洋子
    • Organizer
      日本結晶学会平成22年度年会
    • Place of Presentation
      大阪大学(大阪府)
    • Year and Date
      2010-12-03
  • [Presentation] RNaseA新規三斜晶の構造と分子間相互作用の解析2010

    • Author(s)
      田草川英昇、山村滋典、猿渡茂、菅原洋子、中迫雅由
    • Organizer
      日本結晶学会平成22年度年会
    • Place of Presentation
      大阪大学(大阪府)
    • Year and Date
      2010-12-03
  • [Presentation] アデノシン5'-一リン酸ナトリウム塩の水和物結晶にみられる結晶多形と相対湿度依存相転移2010

    • Author(s)
      高柳敬介、山村滋典、菅原洋子
    • Organizer
      日本結晶学会平成22年度年会
    • Place of Presentation
      大阪大学(大阪府)
    • Year and Date
      2010-12-03
  • [Presentation] Water-mediated crystal transformations of D-xylose isomerase and thaumatin2010

    • Author(s)
      S.Yamamura, A.Ishiguro, M.Ootaki, S.Endo, Y.Sugawara, T.Inagaki, M.Nakasako
    • Organizer
      The 3rd International Symposium on Diffraction Structural Biology
    • Place of Presentation
      パリ(フランス)
    • Year and Date
      2010-05-27

URL: 

Published: 2012-07-19  

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