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2008 Fiscal Year Annual Research Report

高度好熱菌ゲノム情報維持の分子メカニズムの解明

Research Project

Project/Area Number 20570131
Research InstitutionOsaka University

Principal Investigator

増井 良治  Osaka University, 大学院・理学研究科, 准教授 (40252580)

Keywords高度好熱菌 / ミスマッチ修復 / 塩基除去修復 / MutS / MutL / ウラシルDNAグリコシラーゼ / RecJ / DNAポリメラーゼX
Research Abstract

ゲノム情報の正確な複製と子孫への伝達のために,細胞内には多様なゲノム情報安定維持機構が存在する。本研究では,高度好熱菌のミスマッチ修復系と塩基除去修復系の反応機構の分子メカニズムの解明を行った。まずMutLのヌクレアーゼ活性はC末端ドメインが担っているが,N末端ドメインにATPが結合すると非特異的な分解活性が抑制され,MutS存在下でミスマッチ特異的なDNA結合能を示すことを明らかにした。次にMutS2のC末端ドメインの結晶構造を決定し,DNase Iなどとの構造類似性を見いだした。しかし,MutS2は分岐構造をもつDNAを認識・分解することから,相同組換えの抑制に働くと考えられた。さらに,新奇な一本鎖DNA特異的3'-5'エキソヌクレアーゼとしてTTHB178を同定した。その遺伝子破壊株は野生型に比べて,高い自然突然変異率や過酸化水素に対する感受性を示したことから,TTHB178はミスマッチ修復などに働いていると考えられた。また,5'-3'エキソヌクレアーゼであるRecJ全長の結晶構造を決定し,その一本鎖DNA特異性の構造的基盤を解明した。塩基除去修復系では,ウラシルDNAグリコシラーゼUDGBとDNAとの複合体,およびAPエンドヌクレアーゼ(Endo IV)の結晶構造を決定し,互いの活性に及ぼす影響を再構成系を用いて調べた。さらに,脱塩基部位が除去されたあとのギャップをうめる酵素として,DNAポリメラーゼIではなくDNAポリメラーゼXが働くことを示した。また,DNAポリメラーゼXの3'-5'エキソヌクレアーゼ活性はC末端ドメインが担うことも示した。

  • Research Products

    (22 results)

All 2009 2008

All Journal Article (7 results) (of which Peer Reviewed: 6 results) Presentation (15 results)

  • [Journal Article] Bound nucleotide controls the endonuclease activity of mismatch repairenzyme MutL2008

    • Author(s)
      Fukui, K.
    • Journal Title

      The Journal of Biological Chemistry 283

      Pages: 12136-12145

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] An 06-methylguanine-DNA methyltransferase-like protein from Thermus thermophilusinteracts with a nucleotide excision repair protein.2008

    • Author(s)
      Morita, R.
    • Journal Title

      Journal of Biochemistry 144

      Pages: 267-277

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Crystal structure of MutS2 endonuclease domain and the mechanism of homologousrecombination suppression2008

    • Author(s)
      Fukui, K.
    • Journal Title

      The Journal of Biological Chemistry 283

      Pages: 33417-33427

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Crystal structure of a putative DNA methylase TTHA0409 from Thermus thermophilusHB82008

    • Author(s)
      Morita, R.
    • Journal Title

      Proteins 73

      Pages: 259-264

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Structural proteomics of metabolism-related proteins2008

    • Author(s)
      Kuramitsu, S.
    • Journal Title

      Tanpakushitu Kakusan Kosc 5t3

      Pages: 604-607

  • [Journal Article] Characterization of growth-supporting factors produced by Geobacillus toebii for thecommensal thermophile Symbiobacterium toebii.2008

    • Author(s)
      Kim, J. J.
    • Journal Title

      Journal of Microbiology and Biotechnology 18

      Pages: 490-496

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Isolation of uncultivable anaerobic thermophiles of the family Clostridiaceae requiringgrowth-supporting factors.2008

    • Author(s)
      Kim, J. J.
    • Journal Title

      Journal of Microbiology and Biotechnology 18

      Pages: 611-615

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] 高度好熱菌Thermus thermophilus HB8のDNA修復系およびRNA分解系2009

    • Author(s)
      増井良治
    • Organizer
      第3回日本ゲノム微生物学会年回
    • Place of Presentation
      中央大学後楽園キャンパス
    • Year and Date
      2009-03-05
  • [Presentation] DNAミスマッチ修復系初期反応におけるMutLエンドヌクレアーゼ活性の制御機構2008

    • Author(s)
      福井健二
    • Organizer
      第31回日本分子生物学会年会第81回日本生化学会大会 合同大会
    • Place of Presentation
      神戸ポートアイランド
    • Year and Date
      2008-12-12
  • [Presentation] 好熱菌由来endonuclease IV の3'-5' exonuclease活性発現機構の解析2008

    • Author(s)
      浅野瑠一
    • Organizer
      第31回日本分子生物学会年会第81回日本生化学会大会 合同大会
    • Place of Presentation
      神戸ポートアイランド
    • Year and Date
      2008-12-12
  • [Presentation] Thermus thermophilus HB8由来DNA修復系酵素Endonuclease v の分子機能解析2008

    • Author(s)
      井上真男
    • Organizer
      第31回日本分子生物学会年会第81回日本生化学会大会 合同大会
    • Place of Presentation
      神戸ポートアイランド
    • Year and Date
      2008-12-12
  • [Presentation] Thermus thermophilus HB8由来DNAポリメラーゼXの機能ドメイン解析2008

    • Author(s)
      中根修平
    • Organizer
      第31回日本分子生物学会年会第81回日本生化学会大会 合同大会
    • Place of Presentation
      神戸ポートアイランド
    • Year and Date
      2008-12-12
  • [Presentation] 高度好熱菌由来DNAメチル化酵素TTHA0409の構造解析2008

    • Author(s)
      森田理日斗
    • Organizer
      第31回日本分子生物学会年会第81回日本生化学会大会 合同大会
    • Place of Presentation
      神戸ポートアイランド
    • Year and Date
      2008-12-11
  • [Presentation] 高度好熱菌由来ウリジンキナーゼの基質認識機構の構造学的解析2008

    • Author(s)
      友池史明
    • Organizer
      第31回日本分子生物学会年会第81回日本生化学会大会 合同大会
    • Place of Presentation
      神戸ポートアイランド
    • Year and Date
      2008-12-11
  • [Presentation] RecJ-like family Iタンパク質の機能解析2008

    • Author(s)
      若松泰介
    • Organizer
      第31回日本分子生物学会年会第81回日本生化学会大会 合同大会
    • Place of Presentation
      神戸ポートアイランド
    • Year and Date
      2008-12-10
  • [Presentation] T. thermophilus HB8由来3'-5' exonuclease TTHB178の分子機能解析2008

    • Author(s)
      島田敦広
    • Organizer
      第31回日本分子生物学会年会第81回日本生化学会大会 合同大会
    • Place of Presentation
      神戸ポートアイランド
    • Year and Date
      2008-12-10
  • [Presentation] β-CASPファミリーに属する新規RNase, TTHA0252の構造機能解析2008

    • Author(s)
      石川大仁
    • Organizer
      第31回日本分子生物学会年会第81回日本生化学会大会 合同大会
    • Place of Presentation
      神戸ポートアイランド
    • Year and Date
      2008-12-09
  • [Presentation] β-CASPファミリーに属する新規RNase, TTHA0252の構造機能解析2008

    • Author(s)
      石川大仁
    • Organizer
      第8回日本蛋白質科学会年会
    • Place of Presentation
      タワーホール船橋
    • Year and Date
      2008-06-12
  • [Presentation] RecJ-likeファミリー1タンパク質の機能解析2008

    • Author(s)
      若松泰介
    • Organizer
      第8回日本蛋白質科学会年会
    • Place of Presentation
      タワーホール船橋
    • Year and Date
      2008-06-12
  • [Presentation] T. thermophilus HB8由来3'-5' exonuclease TTHB178 の分子機能解析2008

    • Author(s)
      島田敦広
    • Organizer
      第8回日本蛋白質科学会年会
    • Place of Presentation
      タワーホール船橋
    • Year and Date
      2008-06-12
  • [Presentation] 高度好熱菌Thermus thermophilus HB8株における転写制御 : 転写因子CRP/FNRファミリー蛋白質の機能解析2008

    • Author(s)
      新海暁男
    • Organizer
      第8回日本蛋白質科学会年会
    • Place of Presentation
      タワーホール船橋
    • Year and Date
      2008-06-12
  • [Presentation] Thermus thermophilus HB8由来DNAポリメラーゼXの分子機能解析2008

    • Author(s)
      中根修平
    • Organizer
      第8回日本蛋白質科学会年会
    • Place of Presentation
      タワーホール船橋
    • Year and Date
      2008-06-12

URL: 

Published: 2010-06-11   Modified: 2016-04-21  

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