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2010 Fiscal Year Annual Research Report

大腸菌100Sリボソームの構造と形成および解消機構の解明

Research Project

Project/Area Number 20570167
Research InstitutionOsaka Medical College

Principal Investigator

吉田 秀司  大阪医科大学, 医学部, 准教授 (60288735)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 牧 泰史  大阪医科大学, 医学部, 講師 (60401733)
境 晶子  大阪医科大学, 医学部, 助教 (30225750)
Keywords100Sリボソーム / 大腸菌 / 極低温電子顕微鏡 / ストレス応答 / リボソームサイクル / 翻訳因子
Research Abstract

100Sリボソームの極低温(Cryo)電子顕微鏡による構造解析
大阪大学難波研究室の協力を得てCryo電子顕微鏡による大腸菌100Sリボソームの観察を実施した結果、70Sリボソームには存在しない領域に電子密度が観測された。そこで、この追加成分の同定を試みた。まず、対数増殖期の70Sリボソームに含まれる蛋白質を二次元電気泳動法で解析した。泳動には塩基性蛋白質の分離に優れたRFHR法を用いた。そして定常期において形成された100Sリボソームの蛋白質も解析し、対数期の70Sリボソームのものと比較した。その結果、複数の蛋白質スポットの変化が認められたが、その殆どは既知のものであり、追加成分の予想分子量の領域には変化がなかった。従って、未知の追加成分が蛋白質である可能性は低いと考え、次にリボソームに結合しているRNAを調べた。蛋白質の解析と同様に調製した試料を、低分子RNAを分離できる核酸泳動法を用いて解析した。その結果、100Sリボソーム特異的に現れるRNAバンドの存在を確認した。現在、このRNAを解析中である。
新規リボソーム結合蛋白質の探索
定常期特異的にリボソームに結合することを発見したYqjDの性質を調べた。その結果、以下のことが明らかとなった。(1)yqjD遺伝子を欠損しても明確な形質変化は現れなかった、(2)yqjD遺伝子を大量に発現すると生育阻害が見られた、(3)膜結合モチーフをもつC末端ドメインを欠損しても生育阻害が見られたが、N末端ドメインを欠損すると生育阻害が見られなくなった。現在、YqjDのN末端がリボソームの活性に影響を与えると予想して、機能を調べている。

  • Research Products

    (5 results)

All 2010 Other

All Journal Article (1 results) (of which Peer Reviewed: 1 results) Presentation (3 results) Remarks (1 results)

  • [Journal Article] Structure of the 100S ribosome in the Hibernation stage revealed by electron cryomicroscopy2010

    • Author(s)
      Takayuki Kato, Hideji Yoshida, Tomoko Miyata, Yasushi Maki, Akira Wada, Keiichi Namba
    • Journal Title

      Structure

      Volume: 18 Pages: 719-724

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] 100Sリボソームの構造とその特徴2010

    • Author(s)
      吉田秀司、加藤貴之、宮田知子、牧泰史、古池晶, 他3名
    • Organizer
      BMB 2010 (第33回日本分子生物学会年会・第83回日本生化学会年会)
    • Place of Presentation
      神戸国際会議場(神戸ポートアイランド)
    • Year and Date
      20101207-20101210
  • [Presentation] CryoEMにより明らかにされた100Sリボソームの特徴2010

    • Author(s)
      吉田秀司、加藤貴之、宮田知子、牧泰史、古池晶, 他3名
    • Organizer
      第12回日本RNA学会年会
    • Place of Presentation
      一橋記念講堂(東京)
    • Year and Date
      20100727-20100729
  • [Presentation] Structure of the 100S ribosome demonstrated by electron cryomicroscopy2010

    • Author(s)
      吉田秀司, 加藤貴之, 牧泰史, 古池晶, 上田雅美, 和田明, 難波啓一
    • Organizer
      Ribosome 2010
    • Place of Presentation
      オルビエート(イタリア)
    • Year and Date
      2010-05-04
  • [Remarks] 研究内容又は研究内容に関するwebページ

    • URL

      http://www.osaka-med.ac.jp/~yhide/

URL: 

Published: 2012-07-19  

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