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2008 Fiscal Year Annual Research Report

土壌細菌のカタボライト調節機構全容の解明

Research Project

Project/Area Number 20580070
Research InstitutionTohoku University

Principal Investigator

大坪 嘉行  Tohoku University, 大学院・生命科学研究科, 助教 (40342761)

Keywords土壌細菌 / カタボライト調節 / PCB分解菌
Research Abstract

Burkholderia multivorans ATCC 17616において活性測定が容易なGFPをレポーターとしたプロモーター活性定量系を構築した。グルコース代謝系およびガラクトース代謝系の各種遺伝子の破壊株を作製し、このレポーター系を利用してカタボライト調節への影響を検討した。その結果、フォスフォグルコン酸デヒドラターゼ遺伝子の破壊株で、グルコン酸およびフオスフオグルコン酸による抑制が相当緩和されること、ガラクトン酸デヒドラターゼ遺伝子の破壊株でガラクトースによる抑制が緩和されることを見いだした。これらの結果から、グルコースやガラクトースがある程度細胞内で代謝されることで抑制のシグナルが生じていることが示唆された。また大腸菌などでカタボライト調節に関与していることが明らかになっているPTS系のhpr遺伝子の破壊株を作製し解析したところ、抑制炭素源の有無によらずプロモーター活性が上昇していることが見いだされた。この結果からATCC 17616株においてHprが何らかの形でBphQの活性調節に関わる可能性が示唆された。これらの研究と平行してDNA配列の解析ソフトを作成し公開するとともに順次アップデートをおこなった。

  • Research Products

    (26 results)

All 2009 2008 Other

All Journal Article (6 results) (of which Peer Reviewed: 6 results) Presentation (19 results) Remarks (1 results)

  • [Journal Article] 環境細菌ゲノムの構造と可塑性難分解性化合物分解の総合職と専門職の場合-2009

    • Author(s)
      大坪嘉行, ら
    • Journal Title

      化学と生物 47

      Pages: 35-42

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Pleiotropic roles of iron-responsive transcriptional regulator Fur in Burkholderia multivorans2008

    • Author(s)
      S. Yuhara, et.al.
    • Journal Title

      Microbiology 154

      Pages: 1763-1774

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Insertion sequence-based cassette PCR : cultivation-independent isolation of γ-hexachlorocyclohexane-degrading genes from soil DNA2008

    • Author(s)
      G. Fuchu, et.al.
    • Journal Title

      Appl. Microbiol. Biotechnol 79

      Pages: 627-632

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Construction of signature-tagged mutant library,in Mesorhizobium loti as a powerful tool for functional genomics2008

    • Author(s)
      Y. Shimoda, et.al.
    • Journal Title

      DNA Research 15

      Pages: 297-308

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Characterization of the traD operon of naphthalene-catabolic plasmid NAH7 : a host-range modifier in conjugative transfer2008

    • Author(s)
      R. Miyazaki, et.al.
    • Journal Title

      J. Bacteriol. 190

      Pages: 6281-6289

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] GenomeMatcher : A graphical user interface for DNA sequence comparison2008

    • Author(s)
      Y. Ohtsubo, et.al.
    • Journal Title

      BMC Bioinformatics 9

      Pages: 376

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] 有機塩素系殺虫剤gamma-HCHモデル汚染土壌由来のHCH分解菌の単離と解析2009

    • Author(s)
      遠藤諒, ら
    • Organizer
      日本農芸化学会2009年度大会
    • Place of Presentation
      福岡
    • Year and Date
      20090327-29
  • [Presentation] 芳香族化合物による土壌の汚染化に対する土壌細菌集団の応答2009

    • Author(s)
      遠藤諒, ら
    • Organizer
      日本農芸化学会2009年度大会
    • Place of Presentation
      福岡
    • Year and Date
      20090327-29
  • [Presentation] Sphingomonas sp.MM-1株のgamma-HCH分解関連プラスミドの構造解析2009

    • Author(s)
      田端理朗, ら
    • Organizer
      日本農芸化学会2009年度大会
    • Place of Presentation
      福岡
    • Year and Date
      20090327-29
  • [Presentation] Burkholderia multivorans ATCC 17616株のカタボライト調節における抑制基質認識メカニズムの解明2009

    • Author(s)
      鈴木信太郎, ら
    • Organizer
      日本農芸化学会2009年度大会
    • Place of Presentation
      福岡
    • Year and Date
      20090327-29
  • [Presentation] 比較ゲノムソフトウエアGenomeMatcherとその付属機能2009

    • Author(s)
      大坪嘉行, ら
    • Organizer
      日本農芸化学会2009年度大会
    • Place of Presentation
      福岡
    • Year and Date
      20090327-29
  • [Presentation] Pseudoalteromomas atlantica AR06株の産生するアルギン酸リアーゼAlyAの解析2009

    • Author(s)
      松嶋良次, ら
    • Organizer
      日本農芸化学会2009年度大会
    • Place of Presentation
      福岡
    • Year and Date
      20090327-29
  • [Presentation] IncP-7群プラスミドの分配機構による宿主特異性2009

    • Author(s)
      宮腰昌利, ら
    • Organizer
      日本農芸化学会2009年度大会
    • Place of Presentation
      福岡
    • Year and Date
      20090327-29
  • [Presentation] Agrobacterium tumefaciens C58株由来の新規ハロアルカンデハロゲナーゼDatAの解析2009

    • Author(s)
      石塚真祐子, ら
    • Organizer
      日本農芸化学会2009年度大会
    • Place of Presentation
      福岡
    • Year and Date
      20090327-20090329
  • [Presentation] Burkholderia multivorans ATCC 17616の愛媛土壌特異的発現遺伝子の鹿島台土壌における発現誘導性の検討2009

    • Author(s)
      山本泰弘, ら
    • Organizer
      日本農芸化学会2009年度大会
    • Place of Presentation
      福岡
    • Year and Date
      20090327-20090329
  • [Presentation] Burkholderia multivorans ATCC 17616株のFurを介した一酸化窒素(NO)に対する適応機構2009

    • Author(s)
      湯原悟志, ら
    • Organizer
      第3回日本ゲノム微生物学会総会
    • Place of Presentation
      東京
    • Year and Date
      20090305-20090307
  • [Presentation] 自己伝達性プラスミドの接合伝達過程における転写誘導2009

    • Author(s)
      宮腰昌利, ら
    • Organizer
      第3回日本ゲノム微生物学会総会
    • Place of Presentation
      東京
    • Year and Date
      20090305-07
  • [Presentation] GenomeMatcher : 比較ゲノムソフトウエアとその付属機能2009

    • Author(s)
      大坪嘉行, ら
    • Organizer
      第3回日本ゲノム微生物学会総会
    • Place of Presentation
      東京
    • Year and Date
      20090305-07
  • [Presentation] ナフタレン分解プラスミドNAH7の接合伝達に関与する受容菌側因子の解析2009

    • Author(s)
      井上慧, ら
    • Organizer
      日本農芸化学会2009年度大会
    • Place of Presentation
      福岡
    • Year and Date
      20090305-07
  • [Presentation] Analysis of alginate lyase and its gene from Pseudoalteromonas atlantica AR062008

    • Author(s)
      R. Matsushima, et.al.
    • Organizer
      5th World Fisheries Congress
    • Place of Presentation
      Yokohama, Japan
    • Year and Date
      20081020-24
  • [Presentation] Reconstruction of transcription networks by the conjugative transfer of IncP plasmids2008

    • Author(s)
      M.Miyakoshi, et al.
    • Organizer
      International Plasmid Biology Conference 2008
    • Place of Presentation
      Gdansk, Poland
    • Year and Date
      20080830-20080905
  • [Presentation] Characterization of the traD operon in Incp-9 plasmid NAH7 : a host-range modifier in conjugative transfer2008

    • Author(s)
      R.Miyazaki, et al.
    • Organizer
      International Plasmid Biology Conference 2008
    • Place of Presentation
      Gdansk, Poland
    • Year and Date
      20080830-20080905
  • [Presentation] Characterization of plasmids from gamma-hexachlorocyclohexane-degrading bacterium Sphingomonas sp. MM-12008

    • Author(s)
      M. Tabata, et.al.
    • Organizer
      International Plasmid Biology Conference 2008
    • Place of Presentation
      Gdansk, Poland
    • Year and Date
      20080830-0905
  • [Presentation] 分子遺伝学的手法による細菌の土壌環境適応戦略の解明2008

    • Author(s)
      大坪嘉行, ら
    • Organizer
      日本生物工学会大会シンポジウム
    • Place of Presentation
      仙台
    • Year and Date
      20080827-20080829
  • [Presentation] Molecular genetic approaches for elucidating adaptive strategies of bacteria in soil2008

    • Author(s)
      永田, et al.
    • Organizer
      ISSM satellite symposium "Environmental genomics"
    • Place of Presentation
      Tokyo, Japan
    • Year and Date
      2008-11-15
  • [Remarks]

    • URL

      http://www.ige.tohoku.ac.jp/joho/gmProject/gmhomeJp.html

URL: 

Published: 2010-06-11   Modified: 2016-04-21  

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