• Search Research Projects
  • Search Researchers
  • How to Use
  1. Back to project page

2010 Fiscal Year Annual Research Report

連鎖球菌におけるヘパリン分解・輸送系の構造・機能相関とその感染症への関与

Research Project

Project/Area Number 20580078
Research InstitutionKyoto University

Principal Investigator

橋本 渉  京都大学, 農学研究科, 准教授 (30273519)

Keywords連鎖球菌 / グリコサミノグリカン / 不飽和グルクロニルヒドロラーゼ / X線結晶構造解析 / コンドロイチン二糖 / 硫酸化糖 / 多糖リアーゼ / 部位特異的変異
Research Abstract

本研究では、連鎖球菌のヘパリン分解・輸送系に焦点を当て、細菌生理学と分子・構造生物学的解析により、その遺伝子クラスターの感染過程への関与及びヘパリンリアーゼ(HepC)と不飽和グルクロニルヒドロラーゼ(UGL)の構造・機能相関を明らかにする。本年度の成果は以下の通りである。
(1) ヘパリンリアーゼ
HepCの分子多様性を解析するため、各種DNA/タンパク質データベースを用いて、ホモログ遺伝子をもつ生物種を検索した。その結果、多数の連鎖球菌を始め、腸球菌、ウェルシュ菌やバクテロイデス菌など、哺乳類の細胞に感染する細菌群がHepC遺伝子をゲノムに持つことが分かった。また、それらの生物ゲノムにおけるHepCの遺伝子座位がUGL遺伝子の近傍に位置することを明らかにし、ヘパリン分解・輸送系に関わる遺伝子クラスターが哺乳類細胞との相互作用に深く関わることを示唆した。
(2) 不飽和グルクロニルヒドロラーゼ
UGLは、多糖リアーゼ反応により生じたビアルロン酸、コンドロイチン、ヘパリン由来不飽和二糖に作用するため、グルクロン酸とイズロン酸を含む全ての不飽和グリコサミノグリカン二糖を分解することが分かった。UGL変異体と基質との複合体の構造解析から、基質の認識に関わるループ(残基番号:219-236)がフレキシブルな構造をとることが明らかになった。ループに位置するThr-235は基質と相互作用し、その変異体T235Aでは基質との親和性が顕著に低下する。従って、ループの動的構造は、基質を活性部位に固定するために重要であることが示された。

  • Research Products

    (14 results)

All 2011 2010

All Journal Article (7 results) (of which Peer Reviewed: 7 results) Presentation (7 results)

  • [Journal Article] Heterosubunit composition and crystal structures of a novel bacterial M16B metallopeptidase2011

    • Author(s)
      Yukie Maruyama
    • Journal Title

      Journal of Molecular Biology

      Volume: 407 Pages: 180-192

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Structural determinants in streptococcal unsaturated glucuronyl hydrolase for recognition of glycosaminoglycan sulfate groups2011

    • Author(s)
      Yusuke Nakamichi
    • Journal Title

      Journal of Biological Chemistry

      Volume: 286 Pages: 6262-6271

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Crystal structure of bacterial cell-surface alginate-binding protein with an M_75 peptidase motif2011

    • Author(s)
      Yukie Maruyama
    • Journal Title

      Biochemical and Biophysical Research Communications

      Volume: 405 Pages: 411-416

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Mutational studies of the peptidoglycan hydrolase FlgJ of Sphingomonas sp.strain A12010

    • Author(s)
      Yukie Maruyama
    • Journal Title

      Journal of Basic Microbiology

      Volume: 50 Pages: 311-317

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Molecular identification of unsaturated uronate reductase prerequisite for alginate metabolism in Sphingomonas sp.A12010

    • Author(s)
      Ryuichi Takase
    • Journal Title

      Biochimica et Biophysica Acta

      Volume: 1804 Pages: 1925-1936

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Crystal structure of exotype alginate lyase Atu3025 from Agrobacterium tumefaciens2010

    • Author(s)
      Akihito Ochiai
    • Journal Title

      Journal of Biological Chemistry

      Volume: 285 Pages: 24519-24528

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] アルギン酸代謝酵素の構造と機能2010

    • Author(s)
      落合秋人
    • Journal Title

      ビタミン

      Volume: 84 Pages: 525-531

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] 連鎖球菌由来不飽和グルクロニルヒドロラーゼのグリコサミノグリカン二糖に対する硫酸基認識2011

    • Author(s)
      中道優介、丸山如江、三上文三、橋本渉、村田幸作
    • Organizer
      日本農芸化学会2011年度大会
    • Place of Presentation
      京都女子大学
    • Year and Date
      2011-03-27
  • [Presentation] 体腔形成細菌の分子育種による海洋バイオマスアルギン酸からのエタノール生産2011

    • Author(s)
      竹田浩之
    • Organizer
      日本農芸化学会2011年度大会
    • Place of Presentation
      京都女子大学
    • Year and Date
      2011-03-27
  • [Presentation] 連鎖球菌におけるグリコサミノグリカン分解・輸送・代謝に関わる遺伝子クラスター2011

    • Author(s)
      橋本渉、丸山如江、中道優介、村田幸作
    • Organizer
      日本農芸化学会2011年度大会
    • Place of Presentation
      京都女子大学
    • Year and Date
      2011-03-26
  • [Presentation] Sphingomoans属細菌A1株の細胞表層に局在するアルギン酸結合タンパク質の遺伝子発現とX線結晶構造解析2010

    • Author(s)
      橋本渉
    • Organizer
      日本農芸化学会関西支部大会
    • Place of Presentation
      近畿大学
    • Year and Date
      2010-10-03
  • [Presentation] 硫酸化グリコサミノグリカンに作用する連鎖球菌由来不飽和グルクロニルヒドロラーゼの基質認識機構2010

    • Author(s)
      中道優介
    • Organizer
      日本農芸化学会関西支部大会
    • Place of Presentation
      近畿大学
    • Year and Date
      2010-10-03
  • [Presentation] Sphingomonas属細菌A1株由来ペプチドグリカン分解酵素の立体構造に基づく触媒機構解析2010

    • Author(s)
      丸山如江
    • Organizer
      日本農芸化学会関西支部大会
    • Place of Presentation
      近畿大学
    • Year and Date
      2010-10-03
  • [Presentation] 細菌由来多糖分解酵素の構造と機能2010

    • Author(s)
      橋本渉
    • Organizer
      関西グライコサイエンスフォーラム
    • Place of Presentation
      大阪市立大学(招待講演)
    • Year and Date
      2010-05-15

URL: 

Published: 2012-07-19  

Information User Guide FAQ News Terms of Use Attribution of KAKENHI

Powered by NII kakenhi