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2010 Fiscal Year Final Research Report

Structure and function of streptococcal system for heparin degradation/import and its involvement in infectious diseases

Research Project

  • PDF
Project/Area Number 20580078
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research (C)

Allocation TypeSingle-year Grants
Section一般
Research Field Applied microbiology
Research InstitutionKyoto University

Principal Investigator

HASHIMOTO Wataru  Kyoto University, 大学院・農学研究科, 准教授 (30273519)

Research Collaborator MURATA Kousaku  京都大学, 大学院・農学研究科, 教授 (90142299)
Project Period (FY) 2008 – 2010
Keywords連鎖球菌 / 宿主細胞外マトリックス / グリコサミノグリカン / 多糖リアーゼ / 不飽和グルクロニルヒドロラーゼ / 侵入・感染
Research Abstract

Pathogenic streptococci produce unsaturated glucuronyl hydrolase (UGL) together with polysaccharide lyase responsible for completely degrading glycosaminoglycans, and the streptococcal UGLs prefer sulfated substrates. This suggests that the substrate specificity is feasible for bacterial infection through degradation of mammalian extracellular matrices with sulfate groups. The motif "R-//-Sxx(S)xK" in UGL is prerequisite for degradation of sulfated substrates.

  • Research Products

    (30 results)

All 2011 2010 2009 2008 Other

All Journal Article (7 results) (of which Peer Reviewed: 7 results) Presentation (14 results) Book (1 results) Remarks (8 results)

  • [Journal Article] Structural determinants in streptococcal unsaturated glucuronyl hydrolase for recognition of glycosaminoglycan sulfate groups.2011

    • Author(s)
      Yusuke Nakamichi, Yukie Maruyama, Bunzo Mikami, Wataru Hashimoto, Kousaku Murata.
    • Journal Title

      J.Biol. Chem. 286(8)

      Pages: 6262-6271

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Crystal structure of exotype alginate lyase Atu3025 from Agrobacterium tumefaciens.2010

    • Author(s)
      Akihito Ochiai, Masayuki Yamasaki, Bunzo Mikami, Wataru Hashimoto, Kousaku Murata.
    • Journal Title

      J.Biol. Chem. 285(32)

      Pages: 24519-24528

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Bacterial supersystem for alginate import/metabolism and its environmental and bioenergy applications.2010

    • Author(s)
      Wataru Hashimoto, Shigeyuki Kawai, Kousaku Murata.
    • Journal Title

      Bioengineered Bugs 1(2)

      Pages: 97-109

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Crystal structure of family 14polysaccharide lyase with pH-dependent modes of action.2009

    • Author(s)
      Kohei Ogura, Masayuki Yamasaki, Takashi Yamada, Bunzo Mikami, Wataru Hashimoto, Kousaku Murata.
    • Journal Title

      J.Biol. Chem. 284(51)

      Pages: 35572-35579

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Substrate specificity of streptococccal unsaturated glucuronyl hydrolases for sulfated glycosaminoglycan.2009

    • Author(s)
      Yukie Maruyama, Yusuke Nakamichi, Takafumi Itoh, Bunzo Mikami, Wataru Hashimoto, Kousaku Murata.
    • Journal Title

      J.Biol. Chem. 284(27)

      Pages: 18059-18069

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Structural determinants responsible for substrate recognition and mode of action in family 11polysaccharide lyases.2009

    • Author(s)
      Akihito Ochiai, Takafumi Itoh, Bunzo Mikami, Wataru Hashimoto, Kousaku Murata.
    • Journal Title

      J.Biol. Chem. 284(15)

      Pages: 10181-10189

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Substraterecognitionbyfamily 7 alginate lyase from Sphingomonas sp. A1.2008

    • Author(s)
      Kohei Ogura, Masayuki Yamasaki, Bunzo Mikami, Wataru Hashimoto, Kousaku Murata.
    • Journal Title

      J.Mol. Biol. 380(2)

      Pages: 373-385

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] 連鎖球菌由来不飽和グルクロニルヒドロラーゼのグリコサミノグリカン二糖に対する硫酸基認識2011

    • Author(s)
      中道優介、丸山如江、三上文三、橋本渉、村田幸作
    • Organizer
      日本農芸化学会2011年度大会
    • Place of Presentation
      京都女子大学
    • Year and Date
      2011-03-27
  • [Presentation] 連鎖球菌におけるグリコサミノグリカン分解・輸送・代謝に関わる遺伝子クラスター2011

    • Author(s)
      橋本渉、丸山如江、中道優介、村田幸作
    • Organizer
      日本農芸化学会2011年度大会
    • Place of Presentation
      京都女子大学
    • Year and Date
      2011-03-26
  • [Presentation] 硫酸化グリコサミノグリカンに作用する連鎖球菌由来不飽和グルクロニルヒドロラーゼの基質認識機構2010

    • Author(s)
      中道優介、丸山如江、三上文三、橋本渉、村田幸作
    • Organizer
      日本農芸化学会2010年度関西支部大会
    • Place of Presentation
      近畿大学
    • Year and Date
      2010-10-03
  • [Presentation] 細菌由来多糖分解酵素の構造と機能2010

    • Author(s)
      橋本渉、村田幸作
    • Organizer
      第11回関西グライコサイエンスフォーラム
    • Place of Presentation
      大阪市立大学
    • Year and Date
      2010-05-15
  • [Presentation] Structural determinants responsible for mode of action in polysaccharide lyases for biofuel production.2009

    • Author(s)
      落合秋人、三上文三、橋本渉、村田幸作
    • Organizer
      日本生化学会2009年度大会
    • Place of Presentation
      神戸国際会議場
    • Year and Date
      2009-10-24
  • [Presentation] Anovel streptococcal unsaturated glucuronyl hydrolase specific for sulfated glycosaminoglycans.2009

    • Author(s)
      中道優介、丸山如江、三上文三、橋本渉、村田幸作
    • Organizer
      日本生化学会2009年度大会
    • Place of Presentation
      神戸ポートピアホテル
    • Year and Date
      2009-10-24
  • [Presentation] 多糖の輸送・分解に関わる細菌由来超分子の構造と機能2009

    • Author(s)
      橋本渉、伊藤貴文、三上文三、村田幸作
    • Organizer
      日本生化学会2009年度大会
    • Place of Presentation
      神戸ポートピアホテル
    • Year and Date
      2009-10-21
  • [Presentation] アルギン酸リアーゼvAL-1(S)は反応pHにより異なる作用様式(エンド/エキソ型)を示す2009

    • Author(s)
      小倉康平、山崎正幸、橋爪貴也、山田隆、三上文三、橋本渉、村田幸作
    • Organizer
      日本生物工学会2009年度大会
    • Place of Presentation
      名古屋大学
    • Year and Date
      2009-09-24
  • [Presentation] ファミリーPL-14多糖リアーゼvAL-1(S)の構造・機能相関2009

    • Author(s)
      小倉康平、山崎正幸、橋爪貴也、山田隆、三上文三、橋本渉、村田幸作
    • Organizer
      日本農芸化学会2009年度大会
    • Place of Presentation
      マリンメッセ福岡
    • Year and Date
      2009-03-28
  • [Presentation] 褐藻アルギン酸の糖化に関わる細菌由来エキソ型リアーゼの構造・機能相関2009

    • Author(s)
      落合秋人、三上文三、橋本渉、村田幸作
    • Organizer
      日本農芸化学会2009年度大会
    • Place of Presentation
      マリンメッセ福岡
    • Year and Date
      2009-03-28
  • [Presentation] Structural determinants responsible for substrate recognition and mode of action in polysaccharide lyases.2008

    • Author(s)
      落合秋人, 三上文三, 橋本渉, 村田幸作
    • Organizer
      Korea-Japan Joint Meeting on Biotechnology
    • Place of Presentation
      石川県立大学
    • Year and Date
      2008-12-12
  • [Presentation] 細菌における多糖の輸送と分解.構造・機能・移植2008

    • Author(s)
      橋本渉、三上文三、村田幸作
    • Organizer
      日本応用糖質科学会第28回近畿支部会
    • Place of Presentation
      京都大学
    • Year and Date
      2008-10-31
  • [Presentation] クロレラウイルスCVK-1由来ファミリー14多糖リアーゼのX線結晶構造2008

    • Author(s)
      小倉康平、山崎正幸、橋爪貴也、山田隆、三上文三、橋本渉、村田幸作
    • Organizer
      日本農芸化学会2008年度関西支部大会
    • Place of Presentation
      京都学園大学
    • Year and Date
      2008-09-13
  • [Presentation] サルモネラ菌由来マンノースイソメラーゼYihSの機能と立体構造2008

    • Author(s)
      伊藤貴文、三上文三、橋本渉、村田幸作
    • Organizer
      日本農芸化学会関西支部第454回例会
    • Place of Presentation
      京都府立大学
    • Year and Date
      2008-05-31
  • [Book] In "Alginates: Biology & Applications"Microbiology Monographs.(13 : Ed. Bernd Rehm)(Spring)2009

    • Author(s)
      Wataru Hashimoto, Yukie Maruyama, Takafumi Itoh, Bunzo Mikami, Kousaku Murata.
    • Total Pages
      73-94
    • Publisher
      Bacterial system for alginate uptake and degradation.
  • [Remarks] 2010年8月12日、「京都大学オープンキャンパス2010」の開催にあたり、本成果を含めた研究内容を高校生やその保護者に紹介した。

  • [Remarks] 2010年9月14日文部科学省の「平成23年度科学・技術関係予算についてのパブリック・コメント」募集に際し、科学技術研究に関する意見を提出した。

  • [Remarks] 2010年10月23、24日、「京都大学宇治キャンパス祭」にて、一般市民向けに研究内容を紹介するパンフレットとポスターの作成に協力した。

  • [Remarks] Yusuke Nakamichi, Yukie Maruyama, Ryuichi Takase, Yu Nishitani, Bunzo Mikami, Wataru Hashimoto, and Kousaku Murata. Loop movement over the active cleft in streptococcal unsaturated glucuronyl hydrolase. SPring-8 User Experiment Report, 2010A1279.

  • [Remarks] Yusuke Nakamichi, Yukie Maruyama, Bunzo Mikami, Wataru Hashimoto, and Kousaku Murata. Crystal structure of unsaturated glucuronyl hydrolase from Streptcoccus agalactiae. PDB ID, 3ANJ, 20100902

  • [Remarks] Yusuke Nakamichi, Yukie Maruyama, Bunzo Mikami, Wataru Hashimoto, and Kousaku Murata. Crystal structure of unsaturated glucuronyl hydrolase mutant D175Nfrom Streptcoccus agalactiae. PDB ID, 3ANI, 2010年9月2日.

  • [Remarks] Yusuke Nakamichi, Yukie Maruyama, Bunzo Mikami, Wataru Hashimoto, and Kousaku Murata. Crystal structure of unsaturated glucuronyl hydrolase mutant D175Nfrom Streptcoccus agalactiae complexed with dGlcA-GalNAc6S PDB ID, 3ANK, 20100902

  • [Remarks] Yusuke Nakamichi, Yukie Maruyama, Takafumi Itoh, Akihito Ochiai, Kohei Ogura, Bunzo Mikami, Wataru Hashimoto, and Kousaku Murata. Crystal structure of streptococcal unsaturated glucuronyl hydrolase in complex with sulfated substrate. SPring-8 User Experiment Report, 2009B1201.

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Published: 2012-01-26   Modified: 2016-04-21  

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