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2008 Fiscal Year Annual Research Report

がんの発生・進展に関与するDNAメチル化・ヒストンメチル化修飾の解析

Research Project

Project/Area Number 20590325
Research InstitutionAichi Cancer Center Research Institute

Principal Investigator

近藤 豊  Aichi Cancer Center Research Institute, 分子腫瘍学部, 室長 (00419897)

KeywordsDNAメチル化 / ヒストン修飾 / マイクロアレイ / 悪性胸膜中皮腫
Research Abstract

がんのエピジェネティクス異常のうち、DNAメチル化は発がん過程の早期から進行がんにいたるまで様々な遺伝子の発現抑制を介して関与していると考えられている。悪性胸膜中皮腫(中皮腫)は、早期診断法が確立しておらず極めて不良な疾患である。これまで悪性胸膜中皮腫においてDNAメチル化によるがん抑制遺伝子の不活化が報告されてはいるが、他の固形腫瘍と比べるとその詳細の解明は非常に遅れている。本研究では、中皮腫の発がん過程におけるDNAメチル化ならびにヒストン修飾異常の関与を明らかとし、さらに診断への応用を目指して研究を行った。中皮腫20症例においてMethylated CpG island Amplification-microarray法(MCAM法)を用いて、DNAメチル化標的遺伝子を網羅的に解析した。さらに我々が樹立した中皮腫細胞株を用いてDNAメチル化標的遺伝子をMCAM法で、ヒストンH3K27トリメチル化(H3K27me3)の標的遺伝子をクロマチン免疫沈降-マイクロアレイ法(ChIP-chip法)で解析した。中皮腫症例では平均377遺伝子がメチル化していた。一部の遺伝子はDNAメチル化非依存的に不活化されていることが強く疑われ、中皮腫細胞株を用いた解析からH3K27me3による不活化機構と考えた。本年度の研究から中皮腫の発生過程において、エピジェネティックな遺伝子不活化機構としてDNAメチル化とH3K27me3が深く関与しており、それらの標的遺伝子は異なるエピジェネティック治療薬により再活性化されることを見出した。さらにMCAM法により中皮腫特異的なDNAメチル化マーカーを同定した。今後胸水等の臨床検体を用いた検討を予定している。

  • Research Products

    (13 results)

All 2009 2008

All Journal Article (7 results) (of which Peer Reviewed: 7 results) Presentation (5 results) Book (1 results)

  • [Journal Article] Downregulation of Histone H3 Lysine 9 Methyltransferase G9a Induces Centrosome Disruption and Chromosome Instability in Cancer Cells2008

    • Author(s)
      Kondo Y
    • Journal Title

      PloS One 3

      Pages: e2037

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Gene silencing in cancer by histone H3 lysine 27 tri-methylation independent of promoter DNA methylation2008

    • Author(s)
      Kondo Y
    • Journal Title

      Nat Genet. 40

      Pages: 741-750

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] The DNA demethylating agent 5-aza-2'-deoxycytidine activates NY-ESO-1 antigenicity in orthotopic human glioma2008

    • Author(s)
      Natsume A
    • Journal Title

      Int J Cancer 122

      Pages: 2542-53

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Roles of ASH1 in DKK1 and E-cadherin repression and neuroendocrine differentiation in lung cancer2008

    • Author(s)
      Osada H
    • Journal Title

      Cancer Res. 68

      Pages: 1647-55

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] An Sp1/Sp3 binding polymorphism confers methylation protection2008

    • Author(s)
      Boumber YA
    • Journal Title

      PLoS Genet. 4

      Pages: e1000162

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Variable DNA methylation patterns associated with progression of disease in hep atocellular carcinomas2008

    • Author(s)
      Gao W
    • Journal Title

      Carcinogenesis 29

      Pages: 2139-46

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Synergistic induction of NY-ESO-1 antigen expression by a novel histone deacetyl ase inhibitor, valproic acid with 5-aza-2'-deoxycytidine, in glioma cells2008

    • Author(s)
      Oi S
    • Journal Title

      J Neurooncol 109

      Pages: 117-22

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] Cross-talk of DNA methylation and histone methylation in human cancers2009

    • Author(s)
      Kondo Y
    • Organizer
      Avison Biomedical Symposium 2009 "At the Front of Epigenetic Research"
    • Place of Presentation
      Seoul, Korea
    • Year and Date
      2009-01-17
  • [Presentation] Role of histone methylation in human cancers2008

    • Author(s)
      Kondo Y
    • Organizer
      Northeastern Asian Symposium on "Cancer Epigenetics"
    • Place of Presentation
      Jeju, Korea
    • Year and Date
      2008-11-05
  • [Presentation] プロモーターアレイを用いたヒト腫瘍におけるDNAメチル化解析 (Array-based approach for identification of DNA methylation targets in human cancers)2008

    • Author(s)
      近藤豊
    • Organizer
      第67回日本癌学会学術総会
    • Place of Presentation
      名古屋
    • Year and Date
      2008-10-29
  • [Presentation] Role of histone H3 lysine 27 tri-methylation in human cancers2008

    • Author(s)
      Kondo Y
    • Organizer
      The 2nd Shanghai Symposium of Epigenetics in Development and Diseases and The 3rd Annual Meeting of Asian Epigenome Alliance
    • Place of Presentation
      Shanghai, China
    • Year and Date
      2008-07-05
  • [Presentation] Gene Silencing in Cancer by Histone H3 Lysine 27 Tri-methylation Independent of Promoter DNA Methylation2008

    • Author(s)
      Kondo Y
    • Organizer
      AACR special conference in Cancer Research, Cancer Epigenetics
    • Place of Presentation
      Boston, USA
    • Year and Date
      2008-05-31
  • [Book] エピジェネティクス実験プロトコール「Pyrosequencing (パイロシークエンス法)」2008

    • Author(s)
      近藤豊
    • Total Pages
      15
    • Publisher
      羊土社

URL: 

Published: 2010-06-11   Modified: 2016-04-21  

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