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2008 Fiscal Year Annual Research Report

電場と動態:膜電位存在下でのイオンチャネルの機能と構造変化の1分子同時計測

Research Project

Project/Area Number 20679002
Research InstitutionUniversity of Fukui

Principal Investigator

清水 啓史  University of Fukui, 医学部, 助教 (50324158)

Keywordsイオンチャネル / 1分子計測 / 構造変化 / 放射光 / 機能 / 同時計測 / ダイナミクス
Research Abstract

膜蛋白質が膜電位存在下でどのような動態を示すのか、という根源的な問いに答えるべく、KcsAカリウムイオンチャネルを用いて1分子動態・機能同時測定系の開発を行った。研究プロジェクト全般を通じて取り組む以下の項目についての本年度の取り組みを記す。
「溶液交換可能な測定チャンバーの開発」X線照射によってバックグラウンドノイズの原因となる素材は測定チャンバーには使用できないため、ノイズの少ない素材の検討を行った。その結果、金粒子からの回折像を観測できる基板素材、素材厚を決定することに成功した。この素材を用いて試験微小流路を作製し、流路幅、流路高、送液速度のパラメータの最適化を検討中である。
「脂質膜平面でのKcsAチャネル蛋白質の固定法の確立」:本年度の目標は1分子蛍光観察システムを立ち上げることであった。蛍光の定量性、観測速度、感度といった問題点をひとつひとつ解決し、理想的な高速観測システムの構築に成功した。現在試験データの評価中である。
「高速度測定の実現」:従来法の30フレーム/秒という観測速度では構造変化全体は追跡できないことが示唆されていた。本年度、X線観測システムを刷新することにより、5000フレーム/秒という世界最高速度での1分子構造変化追跡システムを構築することに成功した。
「新規観測プローブの検討」:従来法の観測プローブは1粒子から1つの回折像が得られるのみであったため、運動が大きいと観測フレームから外れる問題点があった。新規観測プローブを探索したところ、1粒子から複数の回折像が得られる粒子作製法に到達した。現在、詳細な解析・検討を行っているところである。

  • Research Products

    (9 results)

All 2009 2008

All Journal Article (3 results) (of which Peer Reviewed: 1 results) Presentation (6 results)

  • [Journal Article] Topological mapping of the asymmetric drug binding to the human ether-a-go-go-related gene product (HERG) potassium channel by use of tandem dimers2008

    • Author(s)
      Toshihiko Myokai, Sunghi Ryu, Hirofumi Shimizu, Shigetoshi Oiki
    • Journal Title

      Molecular Pharmacology 73

      Pages: 1645-41

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Kチャネルのイオン透過機構 : 新しい流動電位測定法により明らかになったイオン-水流束比2008

    • Author(s)
      老木成稔, 安藤博之, 久野みゆき, 清水啓史, 岩本真幸
    • Journal Title

      生物物理 48

      Pages: 246-252

  • [Journal Article] Twisting Conformational Changes of Single KcsA Potassium Channel upon Gating using Diffracted X-ray Tracking2008

    • Author(s)
      Hirofumi Shimizu, Masayuki Iwamoto, Yuji C. Sasaki, Shigetoshi Oiki
    • Journal Title

      Research Frontiers 2007

      Pages: 42-43

  • [Presentation] KcsAカリウムイオンチャネル開閉ねじれ運動のX線1分子計測2009

    • Author(s)
      清水啓史, 老木成稔
    • Organizer
      表面・界面を観る非線形分光の新しい展開
    • Place of Presentation
      和光
    • Year and Date
      2009-03-23
  • [Presentation] KcsAカリウムチャネルの開閉に伴うねじれ構造変化の1分子動画計測2008

    • Author(s)
      清水啓史, 岩本真幸, 今野卓, 二瓶亜三子, 佐々木裕次, 老木成稔
    • Organizer
      日本生化学会
    • Place of Presentation
      神戸
    • Year and Date
      20081209-20081212
  • [Presentation] Global Twisting Motion of Single Molecular KcsA Potassium Channel Upon Gating2008

    • Author(s)
      Hirofumi Shimizu, Masayuki Iwamoto, Amiko Nihei, Takashi Konno, Yuji C. Sasaki, Shigetoshi Oiki
    • Organizer
      New Approaches to Complexity of Protein Dynamics by Single Molecule Measurements : Experiments and Theories
    • Place of Presentation
      大阪
    • Year and Date
      20081207-20081209
  • [Presentation] Visualization of conformational changes of single molecular Kcs A potassium channels revealed global twisting motions upon gating2008

    • Author(s)
      Hirofumi Shimizu. Masayuki Iwamoto, Amiko Nihei, Takashi Konno, Yuji C. Sasaki, Shigetoshi Oiki
    • Organizer
      日本生物物理学会
    • Place of Presentation
      福岡
    • Year and Date
      20081203-20081205
  • [Presentation] KcsAカリウムイオンチャネルの構造ダイナミクス2008

    • Author(s)
      清水啓史
    • Organizer
      分子高次系機能解明のための分子科学 ミニ公開シンポジウム
    • Place of Presentation
      福井
    • Year and Date
      20080708-20080709
  • [Presentation] イオンチャネル開閉ねじれ運動の1分子動画計測2008

    • Author(s)
      清水啓史
    • Organizer
      ナノバイオテクノロジー研究会
    • Place of Presentation
      名古屋
    • Year and Date
      2008-06-19

URL: 

Published: 2010-06-11   Modified: 2016-04-21  

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