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2008 Fiscal Year Annual Research Report

ホヤ胚発生を支配する転写制御ネットワーク

Research Project

Project/Area Number 20687014
Research InstitutionKyoto University

Principal Investigator

佐藤 ゆたか  Kyoto University, 大学院・理学研究科, 准教授 (40314174)

Keywordsホヤ / 遺伝子調節ネットワーク
Research Abstract

ホヤは脊索動物でありながら、コンパクトなゲノムを持っている。また、胚の構造も単純であるため、ゲノムワイドかつ細胞単位のネットワークの研究が比較的行いやすいという特長がある。また、ホヤはオタマジャクシ型の幼生をつくるなど、脊索動物に基本的な体制を持っており、ホヤの発生の理解は脊索動物の起源の理解に直接つながる期待がある。本研究ではホヤの胚発生における遺伝子調節ネットワークの全貌を明らかにするため、以下の実験を行った。
1、ホヤ神経系後部における遺伝子調節ネットワークを明らかにするため、ホヤ神経系後部で発現する調節遺伝子について網羅的にその発現パターンを細胞の単位で記載した。そのデータをもとに網羅的ノックダウンを行い、調節遺伝子間のお互いの調節の関係を明らかにし、ネットワークの再構成を行った。その結果、ホヤの脳の後部領域においてはFGF8/17/18によるシグナルが脳の領域化に必要であることを突き止めた。
2、初期胚で発現する転写因子10個についてクロマチン免疫沈降法によって、in vivoでの結合領域をゲノムワイドに明らかにした。シス調節領域のレベルでの完全なネットワークの理解を行うため、データの解析中である。
3、母性因子による胚性の調節遺伝子の発現制御について、網羅的に調べるため、およそ100個の母性に発現する調節遺伝子について過剰発現などをおこなった。いくつかの遺伝子について、もっとも初期に発現する胚性の調節遺伝子の調節を行っている可能性が示唆されたので、精査中である。

  • Research Products

    (4 results)

All 2009 2008

All Journal Article (3 results) (of which Peer Reviewed: 3 results) Presentation (1 results)

  • [Journal Article] Gene regulatory networks in the early ascidian embryo2009

    • Author(s)
      Yutaka Satou, Nori Satoh, Kaoru S. Imai
    • Journal Title

      Biochimica et Biophysica Acta (掲載決定)

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Improved genome assembly and evidence-based global gene model set for the chordate Ciona intestinalis : new insight into intron and operon poputations2008

    • Author(s)
      Yutaka Satou, Katsuhiko Mineta, Michio Ogasawara, et.al.
    • Journal Title

      Genome Biology 9

      Pages: R152

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Gene regulatory networks underlying the compartmentalization of the Ciona central nervous system2008

    • Author(s)
      Kaoru S. Imai, Alberto Stolfi, Mike Levine, Yutaka Satou
    • Journal Title

      Development 136

      Pages: 285-293

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] Gene Regulatory Networks for the ascidian larval development2008

    • Author(s)
      Yutaka Satou
    • Organizer
      Frontiers In Developmental Biology (Joint Meeting of the French and Japanese Societies for Developmental Biology)
    • Place of Presentation
      Giens, フランス
    • Year and Date
      2008-09-15

URL: 

Published: 2010-06-11   Modified: 2016-04-21  

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