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2008 Fiscal Year Annual Research Report

精神疾患患者死後脳における体系的遺伝子発現変動のゲノム要因の統合的解析

Research Project

Project/Area Number 20689022
Research InstitutionThe Institute of Physical and Chemical Research

Principal Investigator

岩本 和也  The Institute of Physical and Chemical Research, 精神疾患動態研究チーム, 研究員 (40342753)

Keywords死後脳 / 遺伝子発現 / 精神疾患 / 双極性障害 / 統合失調症
Research Abstract

本年度は、米国スタンレー財団より供与された約100例の凍結死後脳組織(統合失調症・双極性障害患者と健常者の前頭葉部位)から抽出したゲノムDNAを用い、Affymetrix社製500K SNPアレイ解析を行った。得られたデータから、各サンプルにおける遺伝子多型およびコピーナンバー多型を同定し、既に取得済みの同じ脳サンプルセットでの網羅的遺伝子発現データとの関連を調べ、遺伝子発現に影響を与えるであろう多型の同定を行った。健常者培養リンパ芽球では同様の研究が幾例か報告されており、それら他のグループの結果と比較すると、幾つかの多型は異種組織間でも遺伝子発現に影響を与えることを発見した。また、遺伝子発現に重要な多型の中には、近年活発に行われている双極性障害や統合失調症でのゲノムワイド関連研究で有意と判定されている多型が含まれているのを見出している。疾患との関連が疑われる多型に関しては、多型と遺伝子発現の関係をRT-PCR法を用い確認した。一方、コピーナンバー多型と遺伝子発現の関係については、従来予想されてきたよりも脳の遺伝子発現に与える影響は限定的であることを示唆する結果が得られている。今後、疾患と関係する遺伝子多型を中心に機能的な意義や、コピーナンバー多型が遺伝子発現に与える影響をさらに精査していくと共に、DNAメチル化などのepigeneticな情報を加味して精神疾患患者で見られる遺伝子発現変動の実態を明らかにしていきたい。

  • Research Products

    (9 results)

All 2008 Other

All Journal Article (3 results) (of which Peer Reviewed: 3 results) Presentation (6 results)

  • [Journal Article] Functional organization of the transcriptome in human brain.2008

    • Author(s)
      Michael C Oldham
    • Journal Title

      Nature Neuroscience 11

      Pages: 1271-1282

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Epigenetic profiling in schizophrenia and related mental disorders

    • Author(s)
      Kazuya Iwamoto
    • Journal Title

      Neuropsychobiology (in press)

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Expression of mitochondorial complex I subunit gene NDUFV2 in the lymphoblastoid cells derived from patients with bipolar disorder and schizophrenia

    • Author(s)
      Shinsuke Washizuka
    • Journal Title

      Neuroscience Research (in press)

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] DNA methylation analysis of neuronal and non-neuronal nuclei in the human prefrontal cortex : promoter tiling array analysis2008

    • Author(s)
      岩本和也
    • Organizer
      第31回日本分子生物学会・第81回日本生化学会合同大会
    • Place of Presentation
      神戸
    • Year and Date
      20081209-12
  • [Presentation] Exploring the effect of genetic variations on gene expression in human brain and its application to genetics of bipolar disorder.2008

    • Author(s)
      Kazuya Iwamoto
    • Organizer
      The 16th World Congress of Psychiatric Genetics
    • Place of Presentation
      Osaka
    • Year and Date
      20081011-15
  • [Presentation] DNA methylation analysis in the human brain : promoter tiling array analysis of neuronal and non-neuronal nuclei2008

    • Author(s)
      Kazuya Iwamoto
    • Organizer
      The 16th World Congress of Psychiatric Genetics
    • Place of Presentation
      Osaka
    • Year and Date
      20081011-15
  • [Presentation] ヒト脳遺伝子発現における遺伝的多型の影響評価と精神疾患研究への応用2008

    • Author(s)
      岩本和也
    • Organizer
      第53回人類遺伝学会
    • Place of Presentation
      横浜
    • Year and Date
      20080927-30
  • [Presentation] Epigenetic analysis in neuronal and non-neuronal cells and its application for psychiatric disease2008

    • Author(s)
      Kazuya Iwamoto
    • Organizer
      2^<nd> WFSBP Asia-Pacific Congress and 39^<th> Annual Meeting of JSBP
    • Place of Presentation
      Toyama
    • Year and Date
      20080911-13
  • [Presentation] DNA methylation analysis in human neuronal and non-neuronal cells2008

    • Author(s)
      岩本和也
    • Organizer
      第2回エピジェネティクス研究会年会
    • Place of Presentation
      三島
    • Year and Date
      20080509-10

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Published: 2010-06-11   Modified: 2016-04-21  

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