2008 Fiscal Year Annual Research Report
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20770062
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| Research Institution | University of Tsukuba |
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Principal Investigator |
坂口 美亜子 University of Tsukuba, 大学院・生命環境科学研究科, 研究員 (50400651)
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| Keywords | 分子系統 / 原生生物 / 太陽虫 / 最尤法 / 分子進化 |
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| Research Abstract |
有中心粒太陽虫の一種Raphidiophrys contractilisを材料として、この生物グループと他の真核生物グループとの系統関係を明らかにし、また真核生物における有中心粒太陽虫の系統的位置を解明することを目的として、すでに作製してあるR. contractilisのcDNAライブラリを用いて大規模データセットによる分子系統解析を行うことを目指した。得られたコロニーからプラスミド抽出を行って片鎖シーケンスによる遺伝子の配列を決定したところ、約100遺伝子の配列が得られた。そこで他の真核生物においてそれらに対応する遺伝子配列を各データベースから収集し、データセットを作成した。
まず前段階の解析として、43個のリボソームタンパク質遺伝子と6個の遺伝子(actin, α-tubulin, β-tubulin, elongation factor 2, heat shock protein 70及び90)を合わせた7779アミノ酸サイトを用いた最尤法による連結分子系統解析を行ったところ、他の真核生物グループ間の近縁性は従来の解析結果のように再現されたが、有中心粒太陽虫は他のどの生物グループとも近縁性を示さず、真核生物におけるこの生物グループの系統的位置は明らかとはならなかった。
今後はさらにデータセットを大きくし、情報量をさらに増やして連結遺伝子による再解析を行う予定である。
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