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2009 Fiscal Year Annual Research Report

酵母Asna-1 ATPaseの立体構造解析

Research Project

Project/Area Number 20770078
Research InstitutionThe University of Tokyo

Principal Investigator

山形 敦史  The University of Tokyo, 放射光連携研究機構, 助教 (20463903)

Keywords蛋白質 / 構造生物学 / ATP加水分解酵素 / 膜タンパク質
Research Abstract

C末端に一回膜貫通ヘリックスを持つ膜タンパク質(TA protein)の膜挿入は、Get3 ATPaseによってエネルギー依存的に行われる。Get3による膜挿入メカニズムの解明を目指して当研究では大きく4つの研究を計画、実行した。
1、X線結晶解析によるGet3の立体構造解析
ADP結合型Get3と非結合型Get3の結晶構造を決定した。両構造とも開いた二量体構造を取り、二量体間に一個の金属イオンが結合していた。
2、Get3の結合金属種の同定
結晶構造解析における多波長異常分散法の利用と、ICP-AESを用いた解析により結合している金属イオンが亜鉛イオンであることが分かった。また亜鉛イオンと結合しているシステイン残基に変異を入れると、2量体が形成されず、亜鉛イオンとも結合できなくなることを示した。
3、TA protein結合部位の同定
共発現法によってTA proteinの一種であるSec22とGet3が安定な複合体を形成することを見いだした。さらに変異体を用いた解析により、Get3のhelical domainと呼ばれる部位にTA proteinが特異的に結合することが分かった。
4、ATP依存的な構造変化の解析
人為的に導入したシステイン残基を用いた架橋実験により、Get3がATP加水分解依存的に2量体構造を閉じる構造変化を起こすことを示した。

  • Research Products

    (7 results)

All 2010 2009 Other

All Journal Article (5 results) (of which Peer Reviewed: 5 results) Presentation (1 results) Remarks (1 results)

  • [Journal Article] Structural insight into the membrane insertion of tail-anchored proteins by Get32010

    • Author(s)
      山形敦史
    • Journal Title

      Genes to Cells 15

      Pages: 29-41

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Structural basis for the Rho- and phosphoinositide-dependent localization of the exocyst subunit Sec32010

    • Author(s)
      山下雅美
    • Journal Title

      Nature Structural & Molecular Biology 17

      Pages: 180-186

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Structural basis for specific recognition of Lys 63-linked polyubiquitin chains by NZF domains of TAB2 and TAB32009

    • Author(s)
      佐藤裕介
    • Journal Title

      THE EMBO JOURNAL 28

      Pages: 3903-3909

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Crystal structure of the NEMO ubiquitin-binding domain in complex with Lys 63-linked di-ubiquitin2009

    • Author(s)
      吉川梓
    • Journal Title

      FEBS Letters 583

      Pages: 3317-3322

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Structural basis for specific recognition of Lys 63-linked polyubiquitin chains by tandem UIMs of RAP802009

    • Author(s)
      佐藤裕介
    • Journal Title

      THE EMBO JOURNAL 28

      Pages: 2461-2468

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] Structural insight into the membrane insertion of tail -anchored proteins by the Asnal-family ATPase2009

    • Author(s)
      山形敦史
    • Organizer
      第32回日本分子生物学会年会
    • Place of Presentation
      パシフィコ横浜
    • Year and Date
      20091209-20091212
  • [Remarks]

    • URL

      http://www.iam.u-tokyo.ac.jp/srro/SRROLifeSciDivJp2/Welcome.html

URL: 

Published: 2011-06-16   Modified: 2016-04-21  

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