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2009 Fiscal Year Annual Research Report

小分子RNAを含むリボヌクレオプロテイン複合体の機能の構造基盤の解明

Research Project

Project/Area Number 20770079
Research InstitutionThe University of Tokyo

Principal Investigator

西増 弘志  The University of Tokyo, 医科学研究所, 助教 (00467044)

Keywordsタンパク質 / 核酸 / 結晶構造
Research Abstract

グラム陽性細菌ではフラビン酵素TrmFOが5,10-メチレンテトラヒドロ葉酸(MTHF)をメチル基供与体としてT54形成を触媒する.しかし,その触媒機構は不明だった.そこで,高度好熱菌由来TrmFOの結晶構造を決定し,TrmFOが2つのドメインからなり,基質MTHFがFADの近傍に結合することを明らかにした.変異体解析を行い,ドメイン間のクレフトにtRNAが結合し,基質MTHFからメチル基が転移される反応機構を提唱した.TrmFO酵素は広く細菌に分布していることから,抗菌剤開発へとつながる可能性も期待される.
TYW2酵素はS-アデノシルメチオニン(SAM)のα-アミノα-カルボキシプロピル基(acp基)を,三環構造をもつ塩基imG-14に転移し,塩基yW-86を合成する.通常のメチル化酵素(MTase)と異なり,TYW2がSAMのメチル基ではくacp基を基質に転移する機構は謎だった.そこで,古細菌由来TYW2の結晶構造を決定し,立体構造に基づいた変異体解析を行い,TYW2の全体構造は通常のMTaseと類似しているが,SAMのacp基を基質分子に転移するのに適した構造をもつことを明らかにした.本研究により,活性部位構造のわずかな違いが,TYW2とMTaseの全く異なる酵素活性を規定していることが判明した.
ショウジョウバエAGO1,PIWI,AUB,AGO3を含む複数の真核生物由来Argonauteタンパク質を、バキュロウイルス/Sf9昆虫細胞系でHis-tag融合蛋白質として発現させ,NiNTAカラムで可溶性画分に精製することに成功した.

  • Research Products

    (4 results)

All 2010 2009

All Journal Article (2 results) (of which Peer Reviewed: 2 results) Presentation (2 results)

  • [Journal Article] Structural basis of AdoMet-dependent aminocarboxypropyl transfer reaction catalyzed by tRNA-wybutosine synthesizing enzyme, TYW22009

    • Author(s)
      M.Umitsu, H.Nishimasu, A.Noma, T.Suzuki, R.Ishitani, O.Nureki
    • Journal Title

      Proc.Natl.Acad.Sci.USA. 106

      Pages: 15616-15621

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Atomic structure of a folate/FAD-dependent tRNA T54 methyltransferase2009

    • Author(s)
      H.Nishimasu, R.Ishitani, K.Yamashita, C.Iwashita, A.Hirata, H.Hori, O.Nureki
    • Journal Title

      Proc.Natl.Acad.Sci.USA. 106

      Pages: 8180-8185

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] Atomic structure of a folate/FAD-dependent tRNA T54 methyltransferase2010

    • Author(s)
      西増弘志
    • Organizer
      23rd tRNA workshop
    • Place of Presentation
      Aveiro, Portugal
    • Year and Date
      2010-01-29
  • [Presentation] 葉酸/FAD依存性tRNA U54メチル化酵素TrmFOの機能と構造2009

    • Author(s)
      西増弘志、石谷隆一郎、山下光輝, 岩下知香子, 平田章、堀弘幸、濡木理
    • Organizer
      第11回RNAミーティング
    • Place of Presentation
      新潟・朱鷺メッセ
    • Year and Date
      2009-07-28

URL: 

Published: 2011-06-16   Modified: 2016-04-21  

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