• Search Research Projects
  • Search Researchers
  • How to Use
  1. Back to project page

2008 Fiscal Year Annual Research Report

光照射装置を組み込んだ固体NMRによる構造解析の研究

Research Project

Project/Area Number 20770080
Research InstitutionYokohama National University

Principal Investigator

川村 出  Yokohama National University, 大学院・工学研究院, 研究教員 (20452047)

Keywords固体NMR / 膜タンパク質 / 構造生命科学 / レチナール / バクテリオロドプシン / センサリーロドプシン
Research Abstract

レチナールを発色団にもつレチナール蛋白質はその異性化により、誘起される蛋白質構造変化によって機能を発現する。本研究ではタンパク質とレチナールの相互作用を調べ、その構造情報と機能の相関を明らかにすることが目的である。精度の高い局所的構造変化を観測するために、固体NMR測定中において試料を光励起できるシステムの構築などタンパク質中のレチナール異性化状態をコントロールする必要がある。そのため、本年度はIn situ光照射システムの構築とそれに関連する基礎的な構成の組み立て、および蛋白質のNMR信号の解析を行った。バクテリオロドプシンのレチナールを除去したバクテリオ-オプシンでは、BCループの信号が完全に消失し、野生型BRでもつ振幅が大きく、運動性の遅いBCループの運動が失われることがわかった。また、in vivoおよびin vitroでのレチナール再構成によって、BCループの構造が変化することがわかった。これらのことより、バクテリオロドプシンの正しいフォールディングにはそのBCループが関与し、レチナールとBCループの遠距離相互作用が示唆された。さらにバクテリオロドプシンおよびセンサリーロドプシンの ^<13>C標識レチナールについてのNMR信号を観測した。特にセンサリーロドプシンでは、In situ光照射システムと組み合わせ、界面活性剤中と脂質二重膜中での光活性中間体の観測を試みた結果、そのレチナールの化学シフトを観測することができた。

  • Research Products

    (8 results)

All 2009 2008 Other

All Journal Article (2 results) (of which Peer Reviewed: 2 results) Presentation (5 results) Remarks (1 results)

  • [Journal Article] Participation of the BC loop in the Correct Folding of Bacteriorhodopsin as Revealed by Solid-state NMR2009

    • Author(s)
      I. Kawamura, J. Tanabe, M. Ohmine, S. Yamaguchi, S. Tuzi, & A. Naito
    • Journal Title

      Photochemistry and Photobiology 85

      Pages: 624-630

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Dynamics Change of Phoborhodopsin and Transducer by Activation : Study Using D75N Mutant of the Receptor by Site-directed Solid-state ^<13>C NMR2008

    • Author(s)
      I. Kawamura, H. Yoshida, Y. Ikeda, S. Yamaguchi, S. Tuzi, H. Saito, N. Kamo, & A. Naito
    • Journal Title

      Photochemistry and Photobiology 84

      Pages: 921-930

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] レチナール再構成条件に依存したバクテリオロドプシンBCループのフォールディング2008

    • Author(s)
      川村出
    • Organizer
      BMB2008第81回日本生化学大会
    • Place of Presentation
      神戸ポートアイランド
    • Year and Date
      20081209-12
  • [Presentation] 固体NMRによるバクテリオロドプシンのレチナール異性化に依存したTyr残基の動的構造変化の解析2008

    • Author(s)
      川村出、田邉純子、西尾拓道、辻暁、内藤 晶
    • Organizer
      第47回NMR討論会
    • Place of Presentation
      筑波大学大学会館講堂
    • Year and Date
      20081112-20081114
  • [Presentation] Backbone Conformations of Retinal Protein as studied by Solid State NMR2008

    • Author(s)
      川村出
    • Organizer
      13^<th> International Conference Retinal Protein
    • Place of Presentation
      バルセロナ
    • Year and Date
      20080615-19
  • [Presentation] 固体NMRを用いたレチナール異性化に対するタンパク質の動的局所構造の解析2008

    • Author(s)
      川村出、田邉純子、西尾拓道、内藤晶
    • Organizer
      第8回蛋白質科学会年会
    • Place of Presentation
      タワーホール船堀
    • Year and Date
      20080610-20080612
  • [Presentation] 若手招待講演-固体NMRを用いた暗順応状態バクテリオロドプシンのTyr主鎖コンフォメーションによるレチナールータンパク質問相互作用の解析2008

    • Author(s)
      川村出
    • Organizer
      第46回生物物理学会年会
    • Place of Presentation
      福岡国際会議場
    • Year and Date
      2008-12-03
  • [Remarks] (横浜国立大学研究者総覧)

    • URL

      http://kenkyu-web.jmk.ynu.ac.jp/Profiles/0010/0001484/profile.html

URL: 

Published: 2010-06-11   Modified: 2016-04-21  

Information User Guide FAQ News Terms of Use Attribution of KAKENHI

Powered by NII kakenhi