• Search Research Projects
  • Search Researchers
  • How to Use
  1. Back to project page

2009 Fiscal Year Annual Research Report

ヒトREV1、REV3、REV7超分子複合体の構造生物学的研究

Research Project

Project/Area Number 20770089
Research InstitutionYokohama City University

Principal Investigator

橋本 博  Yokohama City University, 生命ナノシステム科学研究科, 助教 (40336590)

KeywordsDNAポリメラーゼ / DNA複製 / DNA損傷 / 損傷乗り越えDNA合成 / X線結晶構造解析 / REV7 / REV3 / REV1
Research Abstract

DNA修復機構は,恒常的に生じるDNA損傷を修復し,ゲノムの安定性を維持している.しかしDNA複製中に生じた損傷に対する積極的な修復機構は知られていない.複製中に生じた損傷は複製型DNAポリメラーゼによるDNA複製を阻害するため,細胞は危機的な状況になる.損傷による複製停止を回避するための一つの戦略が損傷乗り越えDNA合成(TLS)である.TLSは,誤りがちなDNAポリメラーゼ(TLSポリメラーゼ)による損傷塩基を鋳型としたDNA合成であり,複製型ポリメラーゼに代わって,TLSポリメラーゼが一時的にDNA合成を行う.その後,再び複製型ポリメラーゼがDNA合成を再開し,DNA複製が完了する.
本研究対象であるREV7は真核生物で保存されたタンパク質で,TLSポリメラーゼであるREV1およびREV3と相互作用することが報告されている.また,遺伝学的な研究によって,REV1, REV3, REV7がTLSにおいて協同的に機能することが報告されているが,REV7の詳細な細胞機能や,3つのREVタンパク質がどのように損傷部位で協同的に機能するかは明らかになっていなかった.
本研究では,REV7の細胞機能,REVタンパク質によるTLSの作用機序を構造生物学的に明らかにするために,REV7とREV3フラグメント(1847-1898)との複合体のX線結晶構造解析を行った.さらに,複合体の立体構造に基づいたREVタンパク質の相互作用解析,動物細胞を用いたREV7の機能解析を行った.その結果,REV1, REV3, REV7は三者複合体を形成し,REV7が2つのTLSポリメラーゼ(REV1とREV3)を構造機能的に繋ぐアダプター分子として機能することを明らかにした.

  • Research Products

    (29 results)

All 2010 2009 Other

All Journal Article (7 results) (of which Peer Reviewed: 6 results) Presentation (21 results) Remarks (1 results)

  • [Journal Article] Crystal structure of human REV7 in complex with a human REV3 fragment and structural implication of the interaction between DNA polymerase ζ and REV12010

    • Author(s)
      Kodai Hara, Hiroshi Hashimoto, Yoshiki Murakumo, Shunsuke Kobayashi, Toshiaki Kogame, Satoru Unzai, Satoko Akashi, Shunichi Takeda, Toshiyuki Shimizu, Mamoru Sato
    • Journal Title

      J Biol Chem 285

      Pages: 12299-12307

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Purification, crystallization and initial X-ray diffraction study of human REV7 in complex with REV3 fragment2009

    • Author(s)
      Kodai Hara, Toshiyuki Shimizu, Satoru Unzai, Satoko Akashi, Mamoru Sato, ^*Hiroshi Hashimoto
    • Journal Title

      Acta Crystallogr Sect F Struct Biol Cryst Commun 65

      Pages: 1302-1305

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] The structure of the N-terminal regulatory domain of a plant NADPH oxidase and its functional implications2009

    • Author(s)
      Takashi Oda, Hiroshi Hashimoto, Naoyuki Kuwabara, Satoko Akashi, Kokoro Hayashi, Chojiro Kojima, Wong Hann Ling, Tsutomu Kawasaki, Ko Shimamoto, Mamoru Sato, ^*Toshiyuki Shimizu
    • Journal Title

      J Biol Chem 285

      Pages: 1435-1445

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Purification, crystallization and initial X-ray diffraction study of the zinc-finger domain of zebrafish Nanos2009

    • Author(s)
      ^*Hiroshi Hashimoto, Shigeta Kawaguchi, Kodai Hara, Keishi Nakamura, Toshiyuki Shimizu, Yutaka Tamaru, Mamoru Sato
    • Journal Title

      Acta Crystallogr Sect F Struct Biol Cryst Commun 65

      Pages: 959-961

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Conserved aromatic and basic amino acid residues in the pore region of Caenorhabditis elegans spastin play critical roles in microtubule severing2009

    • Author(s)
      Yuka Matsushita-Ishiodori, ^*Kunitoshi Yamanaka, Hiroshi Hashimoto, Masatoshi Esaki, ^*Teru Ogura
    • Journal Title

      Genes Cells 14

      Pages: 925-940

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Intrinsic Dynamics of Restriction Endonjuclease EcoO109I Studied by Molecular Dynamics Simulations and X-Ray Scattering Data Analysis2009

    • Author(s)
      Tomotaka Oroguchi, Hiroshi Hashimoto, Toshiyuki Shimizu, Mamoru Sato, ^*Mitsuori Ikeguchi
    • Journal Title

      Biophys J 96

      Pages: 2808-2822

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] 損傷乗り越え型DNAポリメラーゼとPCNAの相互作用2009

    • Author(s)
      菱木麻美, 橋本博
    • Journal Title

      日本結晶学会誌 51

      Pages: 286-291

  • [Presentation] ヒトREV7の構造生物学的研究2010

    • Author(s)
      原幸大, 橋本博, 村雲芳樹, 小林俊介, 小亀敏明, 雲財悟, 明石知子, 武田俊一, 清水敏之, 佐藤衛
    • Organizer
      第27回PFシンポジウム
    • Place of Presentation
      つくば
    • Year and Date
      20100308-20100309
  • [Presentation] ヒト由来DNAポリメラーゼ とREV1の相互作用に関する構造生物学的研究2009

    • Author(s)
      原幸大, 清水敏之, 村雲芳樹, 小林俊介, 小亀敏明, 武田俊一, 佐藤衛, 橋本博
    • Organizer
      第32回日本分子生物学会年会
    • Place of Presentation
      横浜
    • Year and Date
      20091209-20091212
  • [Presentation] PCNA G178S変異体の構造解析2009

    • Author(s)
      菱木麻美, 清水敏之, 明石知子, 雲財悟, 佐藤衛, 橋本博
    • Organizer
      日本結晶学会2009年年会
    • Place of Presentation
      西宮
    • Year and Date
      20091205-20091206
  • [Presentation] Crystal structure of leginsulin binding protein from carrot2009

    • Author(s)
      Takuya Yoshizawa, Hiroshi Hashimoto, Toshiyuki Shimizu, Satoru Unzai, Yuji Nishiuchi, Hisashi Hirano, Mamoru Sato
    • Organizer
      第47回 日本生物物理学会年会
    • Place of Presentation
      徳島
    • Year and Date
      20091030-20091101
  • [Presentation] Crystal structure of human REV7 in complex with REV3 fragment2009

    • Author(s)
      Kodai Hara, Toshiyuki Shimizu, Yoshiki Murakumo, Tomo Hanafusa, Haruo Ohmori, Mamoru Sato, Hiroshi Hashimoto
    • Organizer
      第47回 日本生物物理学会年会
    • Place of Presentation
      徳島
    • Year and Date
      20091030-20091101
  • [Presentation] Functional characterization and low resolution solution structure of copper pumping P-type ATPase from Thermus Thermophilus HB82009

    • Author(s)
      Naoyuki Kuwabara, Takashi Oda, Gen Shikauchi, Hiroshi Hashimoto, Mamoru Sato, Toshiyuki Shimizu
    • Organizer
      第47回 日本生物物理学会年会
    • Place of Presentation
      徳島
    • Year and Date
      20091030-20091101
  • [Presentation] Structural analysis of PCNA with G178S mutation2009

    • Author(s)
      Asami Hishiki, Toshiyuki Shimizu, Satoko Akashi, Satoru Unzai, Mamoru Sato, Hiroshi Hashimoto
    • Organizer
      第47回 日本生物物理学会年会
    • Place of Presentation
      徳島
    • Year and Date
      20091030-20091101
  • [Presentation] Solution structures of DNA recombination mediators Swi5 and Sfr1 in fission yeast studied by small-angle X-ray scattering2009

    • Author(s)
      Yuichi Kokabu, Tomotaka Oroguchi, Yasuto Murayama, Naoyuki Kuwabara, Tsutomu Yamane, Hiroshi Hashimoto, Satoru Unzai, Toshiyuki Shimizu, Hiroshi Iwasaki, Mitsunori Ikeguchi
    • Organizer
      第47回 日本生物物理学会年会
    • Place of Presentation
      徳島
    • Year and Date
      20091030-20091101
  • [Presentation] Crystal structure of human REV7 in complex with REV3 fragment2009

    • Author(s)
      Hiroshi Hashimoto
    • Organizer
      Joint Conference of the Asian Crystallographic Association and Chinese Crystallography Society
    • Place of Presentation
      Beijing, China
    • Year and Date
      20091022-20091025
  • [Presentation] ヒト由来REV7-REV3複合体のX線結晶構造解析2009

    • Author(s)
      原幸大, 清水敏之, 村雲芳樹, 小林俊介, 小亀敏明, 花房朋, 大森治夫, 武田俊一, 佐藤衛, 橋本博
    • Organizer
      第82回 日本生化学会大会
    • Place of Presentation
      神戸
    • Year and Date
      20091021-20091024
  • [Presentation] エンドグルカナーゼ阻害タンパク質の構造機能解析2009

    • Author(s)
      吉澤拓也, 橋本博, 西内祐二, 雲財悟, 平野久, 清水敏之, 佐藤衛
    • Organizer
      第82回 日本生化学会大会
    • Place of Presentation
      神戸
    • Year and Date
      20091021-20091024
  • [Presentation] REV7とREV3フラグメントの複合体構造2009

    • Author(s)
      橋本博
    • Organizer
      国立遺会学研究所研究会
    • Place of Presentation
      三島
    • Year and Date
      20091007-20091008
  • [Presentation] Structural basis for novel interactions between human TLS polymerases and PCNA2009

    • Author(s)
      Asami Hishiki, Hiroshi Hashimoto, Tomo Hanafusa, Keijiro Kamei, Eiji Ohashi, Toshiyuki Shimizu, Haruo Ohmori, Mamoru Sato
    • Organizer
      25th European Crystallographic Meeting
    • Place of Presentation
      Istanbul, Turkey
    • Year and Date
      20090816-20090821
  • [Presentation] ヒト由来Mad2L2の結晶学的研究2009

    • Author(s)
      Kodai Hara, Toshiyuki Shimizu, Yoshiki Murakumo, Tomo Hanafusa, Haruo Ohmori, Mamoru Sato, Hiroshi Hashimoto
    • Organizer
      American Crystallographic Association Meeting
    • Place of Presentation
      Toronto, Canada
    • Year and Date
      20090725-20090730
  • [Presentation] Structural study for regulation mechanism of plant NADPH oxidase2009

    • Author(s)
      Takashi Oda, Hiroshi Hashimoto, Naoyuki Kuwabara, Kokoro Hayashi, Chojiro Kojima, Hann Ling Wong, Tsutomu Kawasaki, Ko Shimamoto, Mamoru Sato, Toshiyuki Shimizu
    • Organizer
      American Crystallographic Association Meeting
    • Place of Presentation
      Toronto, Canada
    • Year and Date
      20090725-20090730
  • [Presentation] Crystal structure of DNA ADP-ribosylating protein, pierisin-12009

    • Author(s)
      Toshiyuki Shimizu, Kiroshi Hashimoto, Kiyoshi Hiraga, Tkashi Oda, Tsuyoshi Nakano, Takashi Sugimura, Keiji Wakabayashi, Mamoru Sato
    • Organizer
      第9回日本蛋白質科学会
    • Place of Presentation
      Toronto, Canada
    • Year and Date
      20090725-20090730
  • [Presentation] ヒト由来Mad2L2の結晶学的研究2009

    • Author(s)
      原幸大、清水敏之、村雲芳樹、花房朋、大森治夫、佐藤衛、橋本博
    • Organizer
      第9回日本蛋白質科学会
    • Place of Presentation
      熊本
    • Year and Date
      20090520-20090522
  • [Presentation] レグインスリン結合タンパク質の結晶構造2009

    • Author(s)
      吉澤拓也、橋本博、雲財悟、西内祐二、平野久、清水敏之、佐藤衛
    • Organizer
      第9回日本蛋白質科学会
    • Place of Presentation
      熊本
    • Year and Date
      20090520-20090522
  • [Presentation] EcoO109IメチルトランスフェラーゼのDNA認識に関する構造基盤2009

    • Author(s)
      菱木麻美、橋本博、岩本真、島田隆史、今崎剛、喜多恵子、清水敏之、佐藤衛
    • Organizer
      第9回日本蛋白質科学会
    • Place of Presentation
      熊本
    • Year and Date
      20090520-20090522
  • [Presentation] 分子動力学計算及びX線小角散乱をいた、好熱菌F1-ATPase epsilonサブユニットのATP結合に伴う構造変化の研究2009

    • Author(s)
      苙口友隆、山田康之、伊藤和輝、橋本博、雲財悟、佐藤衛、池口満徳
    • Organizer
      第9回日本蛋白質科学会
    • Place of Presentation
      熊本
    • Year and Date
      20090520-20090522
  • [Presentation] 分裂酵母の相同組換えに機能するSwi5とSfr1の溶液構造解析2009

    • Author(s)
      小甲裕一、苙口友隆、村山泰斗、桑原直之、山根努、橋本博、雲財悟、清水敏之、岩崎博史、池口満徳
    • Organizer
      第9回日本蛋白質科学会
    • Place of Presentation
      熊本
    • Year and Date
      20090520-20090522
  • [Remarks]

    • URL

      http://www.kek.jp/newskek/2010/marapr/REV7.html

URL: 

Published: 2011-06-16   Modified: 2016-04-21  

Information User Guide FAQ News Terms of Use Attribution of KAKENHI

Powered by NII kakenhi