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2008 Fiscal Year Annual Research Report

ヒト全マイクロRNA発現ベクターライブラリの構築とそれを用いた標的制御機構の解明

Research Project

Project/Area Number 20770133
Research InstitutionThe University of Tokyo

Principal Investigator

内藤 雄樹  The University of Tokyo, 大学院・理学系研究科, 特任助教 (60451829)

KeywordsマイクロRNA
Research Abstract

マイクロRNA(miRNA)の機能を解明するための基盤を構築すると同時に, miRNAによる遺伝子の発現制御ネットワークの全体像を理解することを目的として, ヒト全miRNAの発現ベクターライブラリの構築およびmiRNAの活性を定量的にモニタリングできる「miRNAセンサー」の構築をおこなった. miRBase release 12. 0(2008年9月)に収録されたヒトの前駆体miRNA(pre-miRNA)は695種であり, それらから生成される成熟miRNAは866種であった. miRNA発現ベクターについては, これらの前駆体miRNA配列をゲノムにマッピングし, その前後約200塩基対を含む領域をPCRで増幅するためのプライマーを作成した. ヒトのゲノムDNAを鋳型にPCRで当該領域を増幅し, 発現ベクターに挿入してmiRNA発現ベクターを構築している. 平成21年度も継続して構築を進める予定である. miRNAセンサーについては, 前述の成熟miRNAの標的配列を合成DNAオリゴヌクレオチドで作成した. これらをルシフェラーゼ遺伝子の下流部分に挿入し, miRNAの活性を定量的に評価できるベクターを構築している. 平成21年度も継続して構築を進める予定である.

  • Research Products

    (3 results)

All 2009 2008

All Journal Article (3 results) (of which Peer Reviewed: 3 results)

  • [Journal Article] Experimental validation of published siRNA design algorithms.2009

    • Author(s)
      Naito, Y. ら
    • Journal Title

      Small Interfering RNA : New Research 印刷中(掲載確定)

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Evaluation of published rational siRNA design algorithms using firefly luciferase gene as a reporter.2008

    • Author(s)
      Naito, Y. ら
    • Journal Title

      RNA interference research progress

      Pages: 3-11

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Thermodynamic stability and Watson-Crick base pairing in the seed duplex are major determinants of the efficiency of the siRNA-based off-target effect.2008

    • Author(s)
      Ui-Tei, K. ら
    • Journal Title

      Nucleic Acids Res. 36

      Pages: 7100-7109

    • Peer Reviewed

URL: 

Published: 2010-06-11   Modified: 2016-04-21  

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