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2009 Fiscal Year Annual Research Report

DT40細胞でニワトリBリンパ球細胞特異的な組換え因子を探索する

Research Project

Project/Area Number 20770147
Research InstitutionKyoto University

Principal Investigator

廣田 耕志  Kyoto University, 医学研究科, 助教 (00342840)

KeywordsトリBリンパ球 / 組換え / DT40細胞 / 細胞分化 / transcriptome
Research Abstract

申請者は、高等真核生物で例外的に標的組換えが効率的に起こることが知られるトリBリンパ球細胞由来DT40細胞株の解析を通じて、標的組換えがどのようなメカニズムでDT40細胞で高いのか?という謎を解き明かし、この知見を動物や植物と行ったこれまで標的組換えが困難であった細胞に応用できるような技術の開発につなげることを目的として研究を行ってきた。当初計画していた実験で、DT40細胞の転写因子(Pax5, Ikarosの2種)のノックアウトによるB細胞系譜からの逸脱に伴う標的組換えの低下や消失は見られなかったことから、DT40と細胞系譜が変質して標的組換えしなくなった細胞間のtranscriptomeアプローチでの比較解析は困難となった。ところが、昨年Blm(ブルーム症候群の原因遺伝子)とExo1(エキソヌクレアーゼ)が協力してDNAの組換えの過程で働くことを示す基礎データが海外の複数のゲループから報告された。これを受けて、我々はDT40細胞でこれらの因子を発現させたときに、ある制限酵素(1-SceI)によって誘導されるタイプの標的組換えが50倍から100倍程度高まることを見いだした(論文2、特許出願済)。さらに、Blm-Exo1による標的組換え率の上昇は、特にミスマッチした配列間の組換えにおいて特に顕著に見られたことから、標的組換えの難しい基質間の組換えに特に有効であることが示唆できた(論文2)。

  • Research Products

    (7 results)

All 2009

All Journal Article (2 results) (of which Peer Reviewed: 1 results) Presentation (3 results) Book (1 results) Patent(Industrial Property Rights) (1 results)

  • [Journal Article] Analysis of chromatin structure at meiotic DSB sites in yeasts.2009

    • Author(s)
      Hirota, K., Fukuda, T., Yamada, T., Ohta, K.
    • Journal Title

      Methods in molecular biology Clifton, N.J VOL.557

      Pages: 253-266

  • [Journal Article] Bloom DNA helicase facilitates homologous recombination between diverged homologous sequences.2009

    • Author(s)
      Kikuchi, K., Abdel-Aziz, H.I., Taniguchi, Y., Yamazoe, M., Takeda, S., Hirota, K.
    • Journal Title

      The Journal of biological chemistry VOL.284

      Pages: 26360-26367

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] Non coding RNAs disrupt chromatin array2009

    • Author(s)
      Kouji Hirota
    • Organizer
      AGENDA GeneExpression Systems of USA Presents Epigenetics, Sequencing &SNiPs-2009 Meeting
    • Place of Presentation
      米国(ハーバード大学)
    • Year and Date
      20090713-20090714
  • [Presentation] Transcription of mRNA-type long non-coding RNAs (mlonRNAs) disrupts chromatin array2009

    • Author(s)
      Kouji Hirota
    • Organizer
      内藤コンファレンスNuclear Dynamics and RNA
    • Place of Presentation
      日本(北海道)
    • Year and Date
      20090623-20090626
  • [Presentation] The Bloom DNA helicase facilitates homologous recombination between diverged sequences2009

    • Author(s)
      Koji Kikuchi, H.Ismail Abdel-Aziz, Mitsuyoshi Yamazoe, Kouji Hirota, Shunichi Takeda
    • Organizer
      International Symposium DNA Damage Response and Repair Mechanisms
    • Place of Presentation
      ギリシャ(クレタ)
    • Year and Date
      20090420-20090423
  • [Book] 細胞工学12月号(基礎の基礎)2009

    • Author(s)
      廣田耕志、武田俊一
    • Total Pages
      7
    • Publisher
      学研メディカル秀潤社
  • [Patent(Industrial Property Rights)] 遺伝的に改変された細胞を製造する方法2009

    • Inventor(s)
      武田俊一, 廣田耕志
    • Industrial Property Rights Holder
      独立行政法人農業生物資源研究所
    • Industrial Property Number
      特許特願2009-138902
    • Filing Date
      2009-06-10

URL: 

Published: 2011-06-16   Modified: 2016-04-21  

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